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これらの系統のうち、最も一般的なサブクラードは、アフリカとレバントの両方に見られるL2Aである。
ハプログループL2は、スーダンのKulubnartiの島墓地の標本の中で観察されており、これはキリスト教初期（AD550-800）のものである。
ハプログループL2Aedit
L2Aはアフリカに広く分布しており、サハラ以南のアフリカのハプログループで最も一般的で広く分布しており、アフリカ人の子孫の間ではアメリカ大陸で19％でやや頻繁である(Salas et al., 2002). L2aは約起源の可能な日付を持っています。 48,000円
特にチャドに豊富である（サンプルの38％）。; チャド-アラブ人の33%が未分化であり、東アフリカ（ケニア、ウガンダ、タンザニア）の非バントゥー人の38%が未分化である。 モザンビークでは約33％、ガーナでは32％。
このサブクレイドは、次の変異によって特徴付けられます2789, 7175, 7274, 7771, 11914, 13803, 14566 16294 それは総L2の52%を表し、アフリカ中広まっているL2の唯一のsubcladeである。
L2Aの広い分布と多様性は、地理的起源を特定することを困難にする。 主なパズルは、最終氷期の極大期の後に北アフリカのサヘル回廊に沿って東西に広がっている可能性があり、またはこれらの拡張の起源は、40,000年前の後の石器時代の始まりにある可能性がある、ほぼ遍在するハプログループL2Aである。
東アフリカでは、L2Aはナイル渓谷–ヌビアで15%、エジプト人で5%、クッシュ語話者で14%、セム系アムハラ人で15%、Gurageで10%、Tigray-Tigrinya人で6%、Ethiopi人で13%、Yemenisで5%であった。
ハプログループL2Aは北アフリカにも出現し、最も頻度の高い20%トゥアレグ、フラニ（14%）である。 一部のアルジェリアアラブ人の間でも発見され、モロッコのアラブ人、一部のモロッコのベルベル人、チュニジアのベルベル人の間で10％で発見されている。 ら（ｗａｔｓｏｎ１ ９ ９ ７）ら（ｗａｔｓｏｎ１ ９ ９ ７）。(vigilant1991)et al. 1991.
HIVを治療するためにスタブジン薬を投与された患者では、ハプログループL2Aは副作用として末梢神経障害の可能性が低いと関連している。
ハプログループL2A1Edit
L2AはさらにL2A1に分けることができ、16309で遷移を保持する（Salas et al. 2002).
このサブクレイドは、西アフリカではMalinke、Wolofなど、北アフリカではSausa、Fulbeなど、中央アフリカではBamileke、Faliなど、南アフリカではKhwe、Bantu話者を含むKhoisan家、ケニアのKikuyuなどで様々な頻度で観測されている。
エチオピアに存在するすべてのL2クレードは、主に二つのサブクラード、L2A1とL2Bに由来しています。L2A1は、12693、15784と16309の変異によって定義され ほとんどのエチオピアのL2A1配列は、nps16189と16309で変異を共有しています。 しかし、大多数（33人のうち26人）のアフリカ系アメリカ人がハプログループL2A完全配列を共有しているのに対し、nps L2A1E-3495、L2A1A-3918、L2A1F-5581、およびL2A1I-15229での置換によって四つのサブクラードに分割することができる。 これらの配列のいずれも、エチオピア16309L2A1サンプルで観察されなかった。 ら（ｓａｌａｓ２ ０ ０ ２）ら（ｓａｌａｓ２ ０ ０ ２）。
ハプログループL2A1もMahraの間で観察されている（4.6％）。
ハプログループL2A1は、シリアのテルハルーラの前陶器の新石器時代の文化に関連する古代の化石から発見されている。 タンザニアのラクスマンダのサバンナ牧畜新石器時代のサイトで発掘された標本はまた、L2A1クレードを運んだ。 混和クラスタリング分析はさらに、個体が古代レバントからの重要な祖先を持っていることを示し、サバンナ牧畜新石器時代と前陶器新石器時代のメーカーの間の先祖の関係を確認した。
ハプログループL2A1Aedit
サブクレードL2A1Aは、3918、5285、15244、および15629での置換によって定義されます。 アフリカ南東部でよく表現されている二つのL2Aクラスター、L2A1AとL2A1Bがあり、どちらも非常に安定したHVS-I位置での遷移によって定義されている。 これらの両方は、西アフリカまたは北西アフリカに起源を持っているように見える（一致するか、隣接するタイプの分布によって示される）、そして南東ア
サブクラスl2A1AとL2A2の非常に最近のスターバーストは、Pereiraらによっても提案されているように、バントゥ展開の署名を示唆している。 (2001).
L2A1Aは16286の突然変異によって定義されます。 L2A1Aの創設者候補は2,700年（SE1,200年）前にさかのぼる。 （Pereira et al. 2001). しかしながら、Ｌ２Ａ１Ａは、（ｎｐ１ ６ ２ ８ ６）での置換によって定義されるように（Ｓａｌａｓ ｅ ｔ ａ ｌ． は、符号化領域マーカー（ｎｐ３ ９ １ ８）によってサポートされる（図２ ０ ０ ２）。 2A）および六つのイエメンL2A1系統の四つで発見された。 L2a1aはアフリカ南東部で最も高い頻度で発生する（Pereira et al. ２ ０ ０ １；Ｓａｌａｓ ｅ ｔ ａ ｌ． 2002). イエメン人の間で発見された頻繁な創始者ハプロタイプと派生系統（16092変異を有する）の両方がモザンビーク配列内で完全に一致する（Pereira et al. ２ ０ ０ １；Ｓａｌａｓ ｅ ｔ ａ ｌ． 2002). L2a1aはまた、マリとモーリタニアのモウレとバンバラの中で、北西アフリカでより小さな頻度で発生します。 （Ｒａｎｄｏ ｅ ｔ ａ ｌ． １ ９ ９ ８；Ｍａｃａ−Ｍｅｙｅｒ ｅ ｔ ａ ｌ． 2003)
ハプログループL2A1A1Edit
L2A1A1はマーカー6152C、15391T、16368C
ハプログループL2A1Bedit
L2A1Bは16189および10143での置換によって定義される。 16192はL2A1BおよびL2A1Cでも一般的です; エジプトの北アフリカにも現れ、アフリカ南東部にも現れているので、バントゥー系の拡大のマーカーでもあるかもしれません。
ハプログループL2A1Cedit
L2A1Cはしばしば変異16189をL2A1Bと共有しているが、3010と6663に独自のマーカーを持っている。 16192はL2A1BとL2A1Cでも一般的であり、アフリカ南東部や東アフリカにも見られる。 これは、このクレードのin situのいくつかの多様化を示唆している。
L2A1の上にT16209C C16301T C16354Tを配置すると、KivisildらによってL2A1Cと呼ばれる小さなサブクレードが定義される。 (2004,Figure3)(Salas et al.の図6も参照のこと。 2002年）、主に東アフリカ（スーダン、ヌビア、エチオピアなど）、トゥルカナと西アフリカ（カヌリなど）に現れる。
チャド盆地では、東アフリカと西アフリカのタイプから四つの異なるL2A1Cタイプ一つまたは二つの変異ステップが同定された。 （Ｋｉｖｉｓｉｌｄ ｅ ｔ ａ ｌ．) 2004. （ページ上の引用。9or443)
ハプログループL2A1C1Edit
L2A1C1は北アフリカ起源である。 それはマーカーによって定義されます198, 930, 3308, 8604, 16086. それはチュニジアのセファルディック、アシュケナージ、ユダヤ人、ヘブル人、モロッコ人、エジプト人、ヌビア人、イエメンで観察されています。
ハプログループL2A1F
Khosian,Zambia,Madagascar
ハプログループL2A1Kedit
l2A1Kはマーカー G6722AとT12903Cによって定義されており、以前はヨーロッパ特異的なサブグレードL2A1Aとして記載されており、チェコとスロバキアで検出されていた。
ハプログループL2A1L2Aedit
L2A1L2Aは”アシュケナージ固有の”ハプログループとして認識されており、中央および東ヨーロッパの祖先を持つアシュケナージ-ユダヤ人の間で見られる。 また、アシュケナージの混合物から来たと推定される表向きは非ユダヤ人ポーランド人の集団でも少数で検出されている。 しかし、このハプロタイプはアシュケナージのミトコンドリア系統のごくわずかな割合を占めており、様々な研究（ベーハールを含む）では1.4–1.6％の間にその発生率が置かれている。
ハプログループL2A2
L2A2はムブティ-ピグミーの特徴である。
ハプログループL2B’cedit
L2B’cはおそらく約62,000年前に進化した。
ハプログループL2Bedit
この亜科は主に西アフリカに見られるが、アフリカ全土に広がっている。
ハプログループL2Cedit
L2Cは西アフリカで最も頻繁に発生しており、そこで発生した可能性がある。 特にセネガルでは39%、カーボベルデでは16%、ギニアビサウでは16%である。
ハプログループL2Dedit
L2Dは西アフリカで最も頻度が高く、発生した可能性がある。 イエメン、モザンビーク、スーダンでも見られる。
ハプログループL2Eedit
L2E(旧L2D2)は西アフリカで典型的である。 また、チュニジアやギニアビサウやアフリカ系アメリカ人のマンディンカ人の間でも見られる。
