損傷した中央カテーテルに関連するKocuria rhizophilaによる持続的な血流感染 | Jumbuck

症例報告

患者は、Hirschsprung病の全結腸形態を有する3歳の少女であった。 生後2日目（27April2006）には、閉鎖による小腸閉塞のための緊急手術が行われ、小腸の31cmを除去し、その後、末端回腸造設術および人工肛門造設術が行われた。 その後、総非経口栄養が必要とされた。 2006年8月25日、皮下移植可能な血管アクセスポート（Cook Spectrum Central Venous Cateter,Cook Ireland Ltd. Nutricath（Vygon、フランス）カテーテルの偶然の取り外しの後で家の非経口的な栄養物のために置かれました。

4ヶ月後（2006年12月）、最初の敗血症性エピソードが観察され、カテーテルおよび末梢静脈から7つの陽性の血液サンプルが採取された。 バンコマイシン（40mg/kg体重/日、10日）とゲンタマイシン（3mg/kg/日、2日）を組み合わせた抗菌療法の開始後、発熱は速やかに解決した。 血液分離株は最初にＭｉｃｒｏｃｏｃｃｕｓｓｐｐとして同定された。 分子ツールを使用して、ルーチン生化学ギャラリーを使用して、その後Kocuria rhizophilaとして。 その後、K.rhizophilaによる他の敗血症エピソード（2007年に二つ、2008年に四つ、2009年に一つ）が観察され、同じ抗菌療法で解決された。 カテーテルの植民地化が敗血症の原因であると仮定されたので、エタノールロック（70％エタノールをカテーテル内腔に12時間注入し、カテーテル内腔から抜去した）; その後、等張性塩化ナトリウムフラッシュが行われた）は、全身抗生物質（17）に関連する最後の四つのエピソードの間にカテーテルで行われました。 2009年の最後の敗血症イベントの時点で、カテーテルの穴が検出され、特定の修理キットを使用して修復されました。 2009年4月以降、新規な敗血症性のエピソードは観察されなかった。

3年間（2007年から2009年）、BacT/Alert三次元（3D）システム（bioMérieux、Marcy l’Etoile、France）を用いて、合計22の陽性血液培養が得られ、カテーテルから21のサンプルと末梢静脈から1つが採取された。 すべての培養物は、基本的な特性を有するミクロコッカス種として予備的に同定された対、四分体、およびクラスターで発生するグラム陽性球菌を得た。 コロニーは好気性条件下で成長し，血液寒天上にレモン黄色の色合いまたはクリーム色の滑らかで円形であった。 分離株はカタラーゼ陽性，オキシダーゼ陰性，バシトラシン感受性，フラゾリドン耐性であった。 ID32ブドウ球菌ギャラリー（bioMérieux）ではわずかな陽性反応が見つかり、57％の弱い確率でブドウ球菌auricularisが得られた。 2006年と2007年には、臨床株は、同定プロセスにおける他の調査なしにMicrococcusと考えられていました。 2008年には、Vitek2ID-GPCカード（bioMérieux）を使用して、Kocuria variansが明らかに「優れた」信頼スコア（98％）を得ました。 それはK.varians分離株の87％で陽性でなければならないのに対し、それはこの種のために陰性であったので、単一の不和試験（尿素）のみを示した。 この不和なテストを明確にし、K.variansを確認するために、我々は16S rRNA遺伝子解析を使用しました。 ＤＮＡ抽出および１ ６Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子配列分析は、前述のようにして行った（１ ６）。 この手順は11の臨床分離株で行われ、2006年に四つ、2008年に六つ、2009年に一つが回収された。 驚くべきことに、得られたすべての配列は、GenBankヌクレオチドデータベースに堆積したK.rhizophilaのものと完全な同一性を示した。 Ｋ．ｒｈｉｚｏｐｈｉｌａ分離株の１ ６Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子配列は、Ｋ．ｒｈｉｚｏｐｈｉｌａ ＤＣ２ ２ ２ ０ １株の１ ６Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子のそれと９ ８％（４ ５ ７／４ ６ ６）の類似性を示した（Ｇｅｎｂａｎｋ ａｃｃｅｓｓｉｏｎ ｎｏ． Ｋ．ｒｈｉｚｏｐｈｉｌａ株（Ｎｃ０ １ ０ ６ １ ７）の配列と類似性を示し、Ｋｏｖａｃｓの歴史的タイプ株Ｋ．ｒｈｉｚｏｐｈｉｌａ Ｔ Ａ６ ８Ｔ（Ｇｅｎｂａｎｋ ａｃｃｅｓｓｉｏｎ ｎｏ． ＮＲ＿０ ２ ６ ４ ５ ２；９ ９％の類似性）およびＭｉｃｒｏｃｏｃｃｕｓ ｌｕｔｅｕｓ ＮＣＴＣ２ ６ ６ ５（Ｇｅｎｂａｎｋ ａｃｃｅｓｓｉｏｎ ｎｏ． NC012803;93%の類似性）。 他のKocuria種は、Kocuria carniphilaの451/462とKocuria marinaの452/467の類似性を示した。 最後に、最近、我々は、以前に記載されているようにマトリックス支援レーザー脱着イオン化飛行時間質量分析（MALDI-TOF MS）を使用して、k.rhizophilaとして株を確認しました。 四つの臨床分離株のスペクトルプロファイルは、K.rhizophila型株のスペクトルプロファイルと同一であった（図。 1）とKocuria kristinae、Kocuria palustris、Kocuria rosea、およびKocuria variansのプロファイルとはかなり異なっており、すべてAndromasデータベースに存在しています。 With the disk diffusion method, all the isolates were resistant to ciprofloxacin, intermediate to erythromycin, and susceptible to penicillin, gentamicin, amikacin, tobramycin, tetracycline, vancomycin, and teicoplanin, according to EUCAST breakpoints determined for Staphylococcus spp. since there are not breakpoints available for Kocuria spp. With broth microdilution, MICs were 0.03 mg/liter for penicillin, 0.5 mg/liter for gentamicin, 1 mg/liter for amikacin, 2 mg/liter for tobramycin, 8 mg/liter for ciprofloxacin, 4 mg/liter for erythromycin, 0.125 mg/liter for tetracycline, 0.バンコマイシンのための5つのmg/リットル、およびteicoplaninのための1つのmg/リットル。

Ellinghaus et al.によって報告されているように、任意にプライミングされたPCR技術を用いた臨床分離株の遺伝子型決定は、延長されたランプ時間を必要とした。 (8). これは、八敗血症エピソードの9つの代表的な分離株で行われ、クローンKを表す同じパターンを示した。 rhizophila株は3年間回収された（Fig. 2).

ミクロコッカル種は，塵，土壌，水，食物およびヒトおよび動物の皮膚および粘膜に見出された。 これらの種群のメンバーはまた、特に免疫不全患者において、髄膜炎、心内膜炎、および肺炎などの感染症、および移植または挿入された装置に関連する感染症を引き起こすことが見出されている（18、21、30）。 最近確立された属Kocuriaの中で、文書化されたヒトの感染例は限られている。 タイプ種はK. ロゼアは、カテーテル関連菌血症を引き起こすことが報告されている（2）。 属の別のメンバー、K.kristinaeはまた、卵巣癌（3）または急性胆嚢炎（14）の患者にカテーテル関連菌血症を引き起こすことが報告されている。 2009年には、K.marinaによる腹膜炎の二つの症例がLeeらによって報告された。 (12). さらに最近では、2010年に、Lai et al. (11)kocuria spによって引き起こされるカテーテル関連菌血症および感染性心内膜炎を報告した。 Ｔｓａｉ ｅ ｔ ａ ｌ． (27)脳膿瘍に関連するK.varians感染を報告した。

rhizophilaは、チーズ（7）や鶏肉（1）などの食品から単離されている、我々の知る限り、我々のケースは、ベッカーらによって記述された最初のものの後にK.rhizophilaヒト感染の第二の報告 2008年(4) 私たちの3年持続K.rhizophila株のソースは不明であったが、それはいくつかの機会に血管内デバイスを植民地化、患者の常駐皮膚細菌叢の一部であった可能性 長期的な血管内デバイス（3年）は、おそらくデバイスの穴を通って繰り返し、永続的なK.rhizophila株のためのニッチを提供しました。 損傷した装置の修理は、これまでの新しい敗血症エピソードの発生を防ぐように見えた。 全区のスタッフは中心静脈のカテーテル管理に関する無菌議定書の厳密な適用を今頻繁に思い出させられる。 現在、子供は健康で、常に液体便を持っています。 非経口栄養は週5日に減らすことができます。

ID32ブドウ球菌ギャラリーは、Kの信頼できる識別を許可していませんでした。 rhizophilaこの市販の診断キットのデータベースは、限られた数のマイクロコッカル種のみを含み、最近記載された種をカバーせず、Stackebrandtらによって確立された分類学を反映していないためである。 (23). Vitek2ID-GPカードはあいまいにいくつかのKocuria種（K.varians、K.kristinae、およびK.rosea）を同定したが、K.rhizophilaは同定しなかった。 さらに、vitek2システムによる標準的な生化学的分析を用いたコアグラーゼ陰性ブドウ球菌のKocuriaとの誤認は、表現型の変動のために珍しいことではない(5)。 対照的に、16S rRNA遺伝子解析またはMALDI-TOF MSの使用は、K.rhizophilaの正確な同定を得るのに十分であった。

Kocuria sppの抗菌感受性に関するデータは現在入手可能ではありません。 または他のmicrococciおよび、さらに、厳しい伝染のための一般に受け入れられた治療上の養生法はまだ定義されていません。 1995年、von Eiff et al. (29)188マイクロコッカル株上のいくつかの薬の決定MICs:mic90S(mg/リットル)リファンピン、ペニシリン、イミペネム、アンピシリン、クリンダマイシン、セフォタキシム、バンコマイシン/テイコプラニン、およびゲンタマイシンのそれぞれ、≤0.031、0であった。125, 0.125, 0.25, 0.25, 1, 1/1, そして1、amikacin、エリスロマイシン、fosfomycinおよびfusidic酸のMic90Sが>2mg/リットルだったのに対し。 本症例では，バンコマイシンとゲンタマイシンに感受性であり，これら二つの薬剤の組み合わせは常に血液培養の滅菌を可能にした。

結論として、micrococciに似た生物が血液培養から繰り返し単離される場合、正確な種同定を得るためには、16S rRNA遺伝子配列決定やMALDI-TOF MSなどの日常的な生化学 また、長期的な血管内装置の完全性を慎重に検証し、中央線を除去しなければならないことからサルベージする損傷を修復することをお勧めします。