Harvard Medical School
Department of Biological Chemistry and Molecular Pharmacology(BCMP)
240Longwood Ave.,C2ビル,315-325号室
ボストン,マサチューセッツ州02115
転写調節の分子機構は、真核生物の間で高度に保存されている。 環境と発達の手がかりに応答して転写調節は、一般的な転写機械とクロマチン修飾活性のコンポーネント上の特定のDNA結合活性化剤とリプレッサー
この研究室での研究の多くは、酵母で利用可能な遺伝的、分子的、およびゲノム的アプローチを組み合わせて、生きた細胞における転写調節機構に関す 現在のプロジェクトには、1）ヌクレオソーム位置決めのためのスリーステップモデルをテストするための遺伝的実験が含まれています; 2)アンカーアウェイシステムを用いた開始に関与する一般的な転写因子の系統的解析;3)3’末端の伸長とヌクレオソーム枯渇に関与する因子の研究;4)直接RNAシーケンシング、mRNA半減期と3’末端形成のゲノムワイド解析、5)様々な転写物の役割だけでなく、転写コアクチベーターとコリプレッサー複合体と活性化剤とリプレッサー結合部位の特定のコンポーネントを理解するための機能的進化的アプローチの使用環境応答を仲介する。
細胞の形質転換に関与する転写調節回路は基本的に重要であり、もちろん癌に直接関係しています。 私たちは、ヒト癌の二つの等原性モデル（乳房細胞と線維芽細胞）を用いて、細胞形質転換の過程に関与する転写調節回路を解明しています。 これには、炎症性フィードバックループと細胞変換プロセスの関連する側面に関する機械的実験が含まれます; mrna、マイクロrna、および転写因子結合部位の全ゲノムプロファイルは、細胞形質転換の統合されたビューを提供する;と遺伝子、マイクロrna、および癌幹細胞とマンモスフェアの生成に関与する調節経路を識別します。 プロジェクトには、1）異なるタイプの癌細胞における球対癌細胞のmRNA、miRNAおよびlinc RNAプロファイリング、2）細胞形質転換中のリボソームプロファイリング、および3）形質転換における転写因子の役割を決定するための大規模なChIP-Seq実験が含まれる。 最後に、糖尿病薬メトホルミンが癌幹細胞を選択的に殺すことを発見し、メトホルミン作用のメカニズムと癌の予防と治療の可能性を検討しています。
