전통적인 분류는 단세포 진핵생물 또는 원생생물에 대하여 식물과 동물과 같은 형태로 분열을 부과하였다. 비교적 단순한 구조와 제한된 지질 학적 기록으로 인해 이들을 문으로 분류하는 것은 어렵지만,미세 구조 및 기타 특성에 대한 연구는 원생 생물 분류에 대한 새로운 통찰력을 제공하고 있습니다. 가능한 분류가 논의되고,살아있는 세계를 왕국(모네 라,프로 티스타,곰팡이,동물,플란 타)및 필라 로 요약 한 분류가 제안됩니다. 이 분류는 또한 필라를 수퍼 필라 및 폼 수퍼 필라,그리고 확장 된 왕국 프로 티스타(녹조류,난균류 및 점균류를 포함하지만 적색 및 갈색 조류는 제외)로 그룹화하는 것을 제안합니다. 따라서 분류는 휘태커와 마굴리스의 원생 생물과 프로토 티스트 왕국 사이의 타협을 제공하고 공관 치료를 위해 이들의 그룹화와 필라의 전체 목록을 결합하고자한다.
