dit artikel beschrijft de historische achtergrond en vroege vorming van Wilhelm Johannsen’ s onderscheid tussen genotype en fenotype. Er wordt gesteld dat in tegenstelling tot een algemeen aanvaarde interpretatie (bijvoorbeeld, W. Provine, 1971. De oorsprong van theoretische populatiegenetica. Chicago: The University of Chicago Press; Mayr, 1973; F. B. Churchill, 1974. Journal of the History of Biology 7: 5-30; E. Mayr, 1982. The Growth of Biological Thought, Cambridge: Harvard University Press; J. Sapp, 2003. Genesis. De evolutie van de biologie. New York: Oxford University Press) verwees zijn Concepten voornamelijk naar Eigenschappen van individuele organismen en niet naar statistische gemiddelden. Johannsen ‘ s concept van genotype is afgeleid van het idee van soorten in de traditie van biologische systematiek van Linnaeus tot de Vries: een individu behoorde tot een groep – soorten, ondersoorten, elementaire soorten – door het vertegenwoordigen van een bepaald onderliggend type (S. Müller-Wille and V. Orel, 2007. Annalen van de wetenschap 64: 171-215). Johannsen verscherpte dit idee theoretisch in het licht van recente biologische ontdekkingen, niet in de laatste plaats die van de cytologie. Hij testte en bevestigde het experimenteel combineren van de methoden van biometrie, zoals ontwikkeld door Francis Galton, met de individuele selectie methode en stamboom analyse, zoals ontwikkeld door bijvoorbeeld Louis Vilmorin. De term “genotype” werd geïntroduceerd in W. Johannsen ‘ s 1909 (Elemente der Exakten Erblichkeitslehre. Jena: Gustav Fischer) verhandeling, maar het idee van een stabiel onderliggend biologisch “type” onderscheiden van waarneembare eigenschappen was de kernidee van zijn klassieke bonenselectie experiment gepubliceerd 6 jaar eerder (W. Johannsen, 1903. Ueber Erblichkeit in Populationen und reinen Linien. Eine Beitrag zur Beleuchtung schwebender Selectionsfragen, Jena: Gustav Fischer, PP. 58-59). De individuele ontologische basis van populatieanalyse was een vanzelfsprekende vooronderstelling in Johannsens studies van erfelijkheid in populaties vanaf hun begin in de vroege jaren 1890 tot zijn dood in 1927. De bewering dat er een “substantiële maar voorzichtige wijziging was van Johannsen ’s fenotype-genotype onderscheid” (Churchill, 1974, p. 24) van een statistisch naar een individueel ontologisch perspectief komt voort uit een verkeerde interpretatie van de teksten uit 1903 en 1909. Het onmiddellijke doel van dit artikel is om deze lezing van de monografie van 1903 te corrigeren door te laten zien hoe de problemen en resultaten groeien uit Johannsens eerdere werk in erfelijkheid en plantenveredeling. Johannsen presenteerde zijn beroemde selectie-experiment als het hoogtepunt van een lijn van kritiek op het orthodoxe Darwinisme door William Bateson, Hugo de Vries en anderen (Johannsen, 1903). Ze hadden betoogd dat evolutie is gebaseerd op stapsgewijze in plaats van continue verandering in erfelijkheid. Johannsen ‘ s paradigmatische experiment toonde aan hoe stapsgewijze variatie in erfelijkheid operationeel kon worden onderscheiden van de waarneembare, continue morfologische variatie. Om Galton ‘ s wet van partiële regressie te testen, koos Johannsen bewust zuivere lijnen van zelfbemestende planten, een zuivere lijn zijnde de afstammelingen in opeenvolgende generaties van één enkel individu. Men kon aannemen dat een dergelijke populatie zeer homogeen was met betrekking tot het erfelijke type, en Johannsen vond dat selectie geen verandering in dit type veroorzaakte. Galton, legde hij uit, had geëxperimenteerd met populaties bestaande uit een aantal stabiele erfelijke types. De gedeeltelijke regressie die Galton vond, was slechts een gevolg van selectie tussen typen, waardoor het aandeel van sommige typen ten koste van andere werd verhoogd.
