het systeem werd ingevoerd nadat George Washington aan het einde van zijn tweede termijn had aangekondigd met pensioen te gaan, toen de Democratisch-Republikeinse Partij en de Federalistische Partij verkiezingen begonnen te houden op partijdige basis. Beide partijen hebben mogelijk in 1796 informele caucussen gehouden om te proberen te beslissen over hun kandidaten. Na de ongeorganiseerde electorale stemming van 1796, hielden beide partijen formele caucussen in 1800 die hun respectieve presidentskandidaten selecteerden (voorafgaand aan de ratificatie van het 12e amendement in 1804 had elke partij twee presidentskandidaten). De Federalisten hielden in het geheim hun caucus begin mei, maar maakten later hun ticket van President John Adams en Charles Cotesworth Pinckney openbaar. De Democratische Republikeinen ontmoetten elkaar in Mei in het geheim en stemden ermee in om Thomas Jefferson en Aaron Burr voor het presidentschap te steunen. De Federalisten hielden na 1800 geen andere caucus.
in 1804, na de passage van het 12e amendement, kwam de Democratisch-Republikeinse caucus opnieuw bijeen. In een stemronde van de caucus versloeg George Clinton John Breckinridge en werd genomineerd als Jefferson ‘ s running mate. Tijdens de caucus van 1808 versloegen aanhangers van James Madison de pogingen om Clinton of James Monroe te nomineren in plaats van Madison. Clinton werd genomineerd als vice-presidentskandidaat, maar Clinton bekritiseerde de legitimiteit van het caucus-systeem en zowel Clinton als Monroe overwogen zich kandidaat te stellen voor het presidentschap. De Federalisten hielden ondertussen een proto-Nationale Conventie in New York in 1808, waar ze Charles Cotesworth Pinckney en Rufus King nomineerden. In 1812 werd Madison unaniem herbenoemd door de caucus. Echter, de Democratisch-Republikeinse leden van de New Yorkse wetgevende macht hekelden het caucus systeem als onwettig, en in plaats daarvan nomineerde DeWitt Clinton, de neef van George Clinton. De Federalisten hielden een andere proto-conventie in 1812, daar kwamen ze overeen om Clinton te steunen. Clinton verloor uiteindelijk de verkiezingen, maar bood Madison een sterke uitdaging en won 89 electorale stemmen.In 1816 won James Monroe ternauwernood de nominatie van zijn partij over William H. Crawford. In plaats van het verkiezingsresultaat te betwisten, steunde Crawford Monroe ‘ s kandidatuur en besloot om zijn tijd af te wachten tot een toekomstige verkiezing. Een andere Democratisch-Republikeinse caucus kwam bijeen in 1820, maar verdaagde zonder een nominatie. Monroe ‘ s herverkiezingscampagne van 1820 ging zonder tegenstand, omdat de Federalisten extreem zwak waren geworden op nationaal niveau en geen Democratisch-Republikeinse uitgedaagd Monroe, waardoor Monroe de enige presidentskandidaat sinds Washington te zijn herkozen zonder ernstige oppositie. In 1824, Crawford werd genomineerd door de caucus, maar drie andere Democratisch-Republikeinse kandidaten liep ook voor het presidentschap, van wie een, John Quincy Adams, won de verkiezing. Na 1824 brak de Democratisch-Republikeinse Partij tussen aanhangers van Andrew Jackson en aanhangers van Adams; beide kandidaten veroordeelden het caucus-systeem en er werd geen caucus gehouden in 1828. Vanaf 1831 werd de Congressional nominating caucus vervangen door de National presidential nominating conventions.De Federalisten en democratisch-Republikeinen van het begin van de 19e eeuw waren niet zo georganiseerd op staats-en vooral federaal niveau als latere partijen zouden zijn, dus leden van het Congres waren de enige groep nationale partijfunctionarissen die regelmatig bijeenkwamen. Velen bekritiseerden het caucus-systeem als onwettig omdat het niet in de grondwet werd genoemd. De caucus werd ook het onderwerp van interne partijstrijd, vooral in 1808 toen tegenstanders van Madison zijn selectie afkeurden. De caucus systeem geproduceerd bezorgdheid over de scheiding van de machten, als leden van de wetgevende tak nomineerde het hoofd van de uitvoerende tak. Het belang van het verdienen van re-nominatie kan Madison onder druk gezet hebben om een agressievere houding aan te nemen in de aanloop naar de oorlog van 1812. Veel critici van het caucus-systeem stelden voor dat de staten de primaire rol zouden moeten spelen bij het nomineren van kandidaten. Aanhangers van het caucus-systeem betoogden echter dat het het beste systeem was voor het kiezen van nationale kandidaten in een land met verschillende staten.