Haplogroup L2 (mtDNA)

L2 heeft vijf belangrijkste subhaplogroups: L2a, L2b, L2c, L2d en L2e. Van deze lijnen, de meest voorkomende subclade is L2a, die is gevonden in zowel Afrika en de Levant.

Haplogroup L2 has been observed among specimens at the island cemetery in Kulubnarti, Soedan, which date from the Early Christian period (AD 550-800).

Haplogroup L2aEdit

L2a is wijdverspreid in Afrika en de meest gemeenschappelijk en wijd verspreid sub-Sahara Afrikaans Haplogroup en is ook enigszins frequent bij 19% ter naar de Americas onder afstammelingen van Afrikanen (Salas et al., 2002). L2a heeft een mogelijke datum van oorsprong CA. 48.000 YBP.

het is bijzonder overvloedig in Tsjaad (38% van de steekproef; 33% ongedifferentieerd L2 onder de Tsjaad-Arabieren,), en in niet-Bantu populaties van Oost-Afrika (Kenia, Oeganda en Tanzania) op 38%. Ongeveer 33% in Mozambique en 32% in Ghana.

deze subclade wordt gekenmerkt door mutaties bij 2789, 7175, 7274, 7771, 11914, 13803, 14566 en 16294. Het vertegenwoordigt 52% van de totale L2 en is de enige subclade van L2 die wijdverspreid is over heel Afrika.

de grote spreiding van L2a en diversiteit maakt het moeilijk om een geografische oorsprong te identificeren. Naar de belangrijkste puzzel zit naar de bijna alomtegenwoordige Haplogroup L2a, welk mei hebben verbreid Oost en West langs naar de Sahel Corridor ter Noord Afrika na naar de laatste Glacial Maximum, of naar de oorsprong van deze expansies mei liggen vroeger , ter naar de beginneling van naar de Later stenig Tijdperk 40,000 40.000 jaren geleden.

in Oost-Afrika werd L2a gevonden in 15% van de Nijlvallei–Nubië, 5% van de Egyptenaren, 14% van de Cushiet sprekers, 15% van de Semitische Amhara mensen, 10% van de Gurage, 6% van de Tigray-Tigrinya mensen, 13% van de Ethiopiërs en 5% van de Jemenieten.

Haplogroup L2a ook verschijnt in Noord-Afrika, met de hoogste frequentie 20% Toeareg, Fulani (14%). Ook gevonden onder sommige Algerijnse Arabieren, wordt het gevonden op 10% onder Marokkaanse Arabieren, sommige Marokkaanse Berbers en Tunesische Berbers. (watson 1997) et al., (vigilant 1991) et al. 1991.

bij patiënten die het geneesmiddel stavudine krijgen voor de behandeling van HIV, wordt Haplogroup L2a geassocieerd met een lagere waarschijnlijkheid van perifere neuropathie als bijwerking.

Haplogroup L2a1Edit

L2a kan verder worden verdeeld in L2a1, harboring de overgang op 16309 (Salas et al. 2002).

deze subclade wordt waargenomen in verschillende frequenties in West-Afrika onder de Malinke, Wolof en anderen; onder de Noord-Afrikanen; in de Sahel onder de Hausa, Fulbe en anderen; in Centraal-Afrika onder de Bamileke, Fali en anderen; in Zuid-Afrika onder de Khoisan familie met inbegrip van de Khwe en Bantu sprekers; en in Oost-Afrika onder de Kikuyu uit Kenia.

alle in Ethiopië aanwezige L2-klassen zijn voornamelijk afgeleid van de twee subkladen, L2a1 en L2b. L2a1 wordt gedefinieerd door mutaties op 12693, 15784 en 16309. De meeste Ethiopische L2a1-sequenties delen mutaties bij nps 16189 en 16309. Echter, overwegende dat de meerderheid (26 Uit 33) Afro-Amerikanen delen Haplogroup L2a complete sequenties kon worden verdeeld in vier subclades door substituties op NPS L2a1e-3495, L2a1a-3918, L2a1f-5581, en L2a1i-15229. Geen van deze opeenvolgingen, werden waargenomen in Ethiopische 16309 L2a1 steekproeven. (Salas 2002) et al.

Haplogroup L2a1 is ook waargenomen onder de Mahra (4.6%).

Haplogroup L2a1 has been found in ancient fossils associated with the Pre-Pottery Neolithic culture at Tell Halula, Syria. Een exemplaar dat werd opgegraven op de savanne Pastoral Neolithic site van Luxmanda in Tanzania droeg ook de L2a1 clade. De analyse van de vermenging gaf verder aan dat het individu significante afstamming van de oude Levant droeg, bevestigend voorouderlijke banden tussen de makers van het pastorale Neolithicum van savanne en het Neolithicum van pre-Aardewerk.

Haplogroup L2a1aEdit

Subclade L2a1a is gedefinieerd door substituties op 3918, 5285, 15244, en 15629. Er zijn twee L2a clusters die goed vertegenwoordigd zijn in Zuidoost-Afrikanen, L2a1a en L2a1b, beide gedefinieerd door overgangen op vrij stabiele HVS-I posities. Beide lijken een oorsprong te hebben in West-Afrika of Noordwest-Afrika (zoals blijkt uit de verdeling van matching of naburige types), en een dramatische expansie te hebben ondergaan, hetzij in Zuidoost-Afrika of in een bevolking voorouderlijk tot de huidige Zuidoost-Afrikanen.

de zeer recente Starburst in subclades L2a1a en L2A suggereren een handtekening voor de Bantu uitbreidingen, zoals ook voorgesteld door Pereira et al. (2001).

L2a1a wordt gedefinieerd door een mutatie bij 16286. De L2a1a oprichter kandidaat dateert uit 2.700 (SE 1.200) jaar geleden. (Pereira et al. 2001). Echter, L2a1a, zoals gedefinieerd door een substitutie op (NP 16286) (Salas et al. 2002), wordt nu ondersteund door een codering-regio marker (NP 3918) (fig. 2A) en werd gevonden in vier van de zes Jemenitische L2a1-stammen. L2a1a komt met zijn hoogste frequentie voor in Zuidoost-Afrika (Pereira et al. 2001; Salas et al. 2002). Zowel de frequente stichter haplotype en afgeleide geslachten (met 16092 mutatie) gevonden onder Jemenieten hebben exacte overeenkomsten binnen Mozambique sequenties (Pereira et al. 2001; Salas et al. 2002). L2a1a komt ook met een kleinere frequentie voor in Noordwest-Afrika, onder de Maure en Bambara van Mali en Mauritanië. (Rando et al. 1998; Maca-Meyer et al. 2003)

haplogroep L2a1a1Edit

L2a1a1 is defined by markers 6152C, 15391T, 16368C

haplogroep L2a1bEdit

L2a1b is defined by substitutions at 16189 and 10143. 16192 is ook gemeenschappelijk in L2a1b en L2a1c; het verschijnt in Noord-Afrika in Egypte, het verschijnt ook in Zuidoost-Afrika en dus kan het ook een marker voor de Bantu expansie.

Haplogroup L2a1cEdit

L2a1c vaak aandelen mutatie 16189 met L2a1b, maar heeft zijn eigen markers bij 3010 en 6663. 16192 is ook algemeen in L2a1b en L2a1c; het komt voor in Zuidoost-Afrika en Oost-Afrika. Dit suggereert een zekere diversificatie van deze clade in situ.

posities T16209C C16301T C16354T bovenop L2a1 definiëren een kleine subklade, genaamd L2a1c door Kivisild et al. (2004, Figuur 3) (zie ook Figuur 6 in Salas et al. 2002), die vooral voorkomt in Oost-Afrika (bijvoorbeeld Soedan, Nubië, Ethiopië), tussen de Turkana en West-Afrika (bijvoorbeeld Kanuri).

in het Tsjaadbekken werden vier verschillende L2a1c-typen geïdentificeerd, één of twee mutationele stappen van de oost-en West-Afrikaanse typen. (Kivisild et al.) 2004. (citaat op bladzijde.9 of 443)

Haplogroup L2a1c1Edit

L2a1c1 heeft een Noord-Afrikaanse oorsprong. Het wordt gedefinieerd door markers 198, 930, 3308, 8604, 16086. Het wordt waargenomen in Tunesië Sefardisch, Asjkenazi, Joden, Hebreeërs, Marokkanen, Egyptenaren, Nubiërs en Jemenieten.

Haplogroup L2a1f

Khosian, Zambia, Madagaskar

Haplogroup L2a1kEdit

L2a1k is defined by markers G6722A and T12903C. it was previously described as a European-specific subclade L2a1a and detected in Czechs and Slowaken.

haplogroep L2a1l2aEdit

L2a1l2a wordt erkend als een “Ashkenazi-specifieke” haplogroep, gezien onder Ashkenazi Joden met Voorouders in Centraal-en Oost-Europa. Het is ook ontdekt in kleine aantallen in ogenschijnlijk niet-Joodse Poolse populaties, waar het vermoedelijk afkomstig is van Asjkenazische vermenging. Nochtans, vormt dit haplotype slechts een zeer klein deel van Asjkenazi mitochondrial geslachten; diverse studies (met inbegrip van Behar’ s) hebben zijn weerslag op tussen 1.4–1.6% gesteld.

Haplogroup L2a2Edit

L2a2 is kenmerkend voor de Mbuti Pygmeeën.

Haplogroup L2b ‘Cedit

L2b’ C waarschijnlijk geëvolueerd rond 62,000 jaar geleden.

Haplogroup L2bEdit

deze subclade is voornamelijk gevonden in West-Afrika, maar het is verspreid over heel Afrika.

Haplogroup L2cEdit

L2c is meest frequent in West-Afrika, en kunnen zijn er ontstaan. Vooral aanwezig in Senegal op 39%, Kaapverdië 16% en Guinee-Bissau 16%.

Haplogroup L2dEdit

L2d is het meest frequent in West-Afrika, waar het kan zijn ontstaan. De soort komt voor in Jemen, Mozambique en Soedan.

Haplogroup L2eEdit

L2e (voormalige L2d2) is typisch in West-Afrika. De soort komt ook voor in Tunesië en onder Mandinka ‘ s uit Guinee-Bissau en Afro-Amerikanen.