Kekkei genkai (血継限界; letterlijk “een techniek die beperkt is tot overerving door bloed” of “bloedlijnlimiet”) zijn vermogens die genetisch worden doorgegeven in specifieke Clans. Het is mogelijk voor een ninja om meer dan één van deze vaardigheden te hebben. Kekkei genkai vaardigheden die werken via het oog van de gebruiker worden genoemd dojutsu. Andere kekkei genkai omvatten het mengen van een type element chakra met een ander, het creëren van een nieuwe uniek voor de gebruikers, wat meestal onmogelijk is voor normale ninja.
Kekkei genkai en aanverwante technieken kunnen niet door anderen worden onderwezen of gekopieerd. Kekkei genkai kan echter aan anderen worden gegeven. Dojutsu, of andere kekkei genkai geïsoleerd in een enkel orgaan, kan worden getransplanteerd in het lichaam van een ander. Het gebruik van deze organen vereist veel meer chakra dan iemand die geboren is met de kekkei genkai. Chakra-elementen kunnen ook worden doorgegeven aan mensen buiten de clan, door een DNA-re-modificatie te ondergaan om de Releasetechniek te verwerven. Echter, de vaardigheid van de personen in het gebruik ervan zou lang niet zo krachtig zijn als de oorspronkelijke beoefenaar.Hoewel kekkei genkai ‘ s meestal genetisch worden gedeeld binnen een specifieke clan, is het soms uniek voor één persoon alleen, en dat zelfs familieleden het niet delen. Nog andere kekkei genkai lijken te verschijnen in individuen zonder bekende relatie, zoals de Lava Release, die is verschenen in ninja uit Kirigakure, Iwagakure, en Kumogakure, terwijl magneet Release, die is verschenen in ninja uit zowel Kumogakure en Sunagakure.
