Harvard Medical School
Department of Biological Chemistry and Molecular Pharmacology (BCMP)
240 Longwood Ave., Building C2, Rooms 315-325
Boston, MA 02115
de moleculaire mechanismen van transcriptional regelgeving worden hoogst behouden onder eukaryotes. Transcriptionele Regulatie in reactie op milieu-en ontwikkelingsfactoren wordt gemedieerd door de combinatorische en synergetische werking van specifieke DNA-bindende activatoren en onderdrukkers op componenten van de Algemene transcriptiemachines en chromatine modificerende activiteiten. Een groot deel van het werk in dit laboratorium combineert genetische, moleculaire en genomische benaderingen beschikbaar in gist om fundamentele vragen over transcriptionele regulerende mechanismen in levende cellen te beantwoorden. De huidige projecten omvatten 1) genetische experimenten om ons drie stapsmodel voor nucleosoompositionering te testen; 2) een systematische analyse van de algemene transcriptiefactoren betrokken bij de initiatie in het gebruik van het anker-weg systeem; 3) een studie van de factoren die betrokken zijn in rek en nucleosome uitputting op 3′ eindigt; 4) met behulp van de directe RNA-sequencing, een genoom-brede analyse van mRNA half-life en 3′-uiteinde vorming, 5) het gebruik van een functionele en evolutionaire benadering voor het begrijpen van de rollen van verschillende afschriften, alsmede specifieke onderdelen van transcriptionele co-activator en co-repressor complexen en activator en repressor bindingsplaatsen bemiddelen milieu reacties.
de transcriptionele reguleringscircuits die betrokken zijn bij cellulaire transformatie zijn van fundamenteel belang en natuurlijk direct relevant voor kanker. We gebruiken twee isogene modellen (borstcellen en fibroblasten) van menselijke kanker om de transcriptionele regulerende circuits die betrokken zijn bij het proces van cellulaire transformatie te verduidelijken. Dit impliceert mechanistische experimenten op de inflammatoire terugkoppelingslus en verwante aspecten van het cellulaire transformatieproces; geheel-genoomprofielen van mRNAs, microRNAs, en de bindingsplaatsen van de transcriptiefactor om een geïntegreerde mening van cellulaire transformatie te verstrekken; en het identificeren van genen, microRNAs, en regelgevende wegen betrokken bij het produceren van kankerstamcellen en mammosferes. De projecten omvatten 1) mRNA, miRNA en linc RNA het profileren van gebieden Versus kankercellen in verschillende types van kankercellen; 2) ribosoom het profileren tijdens cellulaire transformatie; en 3) grootschalige spaander-Seq experimenten om de rol van transcriptiefactoren in transformatie te bepalen. Tot slot, nu we hebben ontdekt dat het diabetesgeneesmiddel metformine selectief kankerstamcellen doodt, onderzoeken we het mechanisme van de werking van metformine en zijn potentieel voor preventie en behandeling van kanker.
