O Instituto foi fundado em 1934, o Departamento de Arqueologia da Universidade hebraica de Jerusalém. Em 1967, tornou-se o Instituto de Arqueologia. Hoje, o Instituto é uma unidade de pesquisa e ensino independente dentro da Faculdade de Humanidades, com uma equipe que fornece assistência administrativa e científica, bem como as instalações técnicas necessárias para realizar seus projetos de pesquisa. Os programas acadêmicos incluem estudos para BA, MA e Ph. D. Graus EM arqueologia pré-histórica, bíblica e clássica, civilizações do antigo Oriente Próximo e Arqueologia computacional.
desde sua criação como Departamento de Arqueologia, o Instituto tem se envolvido em muitos grandes empreendimentos arqueológicos e programas de pesquisa interdisciplinar, além de seu papel como instituição de ensino e treinamento. Escavações em grandes locais pré-históricos e históricos moldaram muitos dos paradigmas atuais da arqueologia israelense e contribuíram para uma melhor compreensão do comportamento humano passado.Muitas das escavações conduzidas por membros do instituto são relatadas e publicadas na série Qedem do Instituto.
o departamento estava alojado em Mt. Scopus até 1948, quando se mudou para o novo campus em Giv’at Ram e para um edifício doado pelos amigos belgas da Universidade Hebraica e nomeado em homenagem à Rainha Elizabeth da Bélgica. Após a guerra de 1967, o departamento voltou ao seu edifício original no Monte. Scopus, e tornou-se o Instituto de Arqueologia. Uma generosa doação da família Carasso permitiu que a ala de pesquisa fosse reconstruída e ampliada para acomodar sua crescente coleção de antiguidades e aumentando as atividades de pesquisa. Com uma doação adicional dos amigos belgas da Universidade Hebraica, a ala de ensino foi reconstruída e nomeada em homenagem à Rainha Elizabeth da Bélgica. Esta ala também contém a recém-renovada Biblioteca Emery e Claire Yass do Instituto e a coleção de slides.
o Instituto oferece a seus pesquisadores, bem como a acadêmicos externos serviços de conservação e fotografia. Ambos os laboratórios foram recentemente remodelados e estão equipados com state-of-the-art instalações,
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