Harvard Medical School
Departamentul de Chimie Biologică și farmacologie moleculară (BCMP)
240 Longwood Ave., Corp C2, camere 315-325
Boston, MA 02115
mecanismele moleculare ale reglării transcripționale sunt foarte conservate printre eucariote. Reglarea transcripțională ca răspuns la indicii de mediu și de dezvoltare este mediată de acțiunea combinatorie și sinergică a activatorilor și represorilor specifici de legare a ADN-ului asupra componentelor mașinilor generale de transcriere și a activităților de modificare a cromatinei.
o mare parte din munca din acest laborator combină abordările genetice, moleculare și genomice disponibile în drojdie pentru a aborda întrebări fundamentale despre mecanismele de reglementare transcripțională în celulele vii. Proiectele actuale includ 1) experimente genetice pentru a testa modelul nostru în trei etape pentru poziționarea nucleozomilor; 2) o analiză sistematică a factorilor generali de transcripție implicați în inițiere folosind sistemul ancoră-distanță; 3) Un studiu al factorilor implicați în alungirea și epuizarea nucleozomilor la capetele 3′; 4) folosind secvențierea ARN directă, o analiză la nivel de genom a timpului de înjumătățire ARNm și a formării 3′-End, 5) utilizarea unei abordări evolutive funcționale pentru a înțelege rolurile diferitelor transcrieri, precum și componentele specifice ale complexelor Co-Activatoare și co-represoare transcripționale și a siturilor de legare Activatoare și represoare care mediază răspunsurile mediului.
circuitele de reglare transcripțională implicate în transformarea celulară sunt de o importanță fundamentală și, desigur, direct relevante pentru cancer. Folosim două modele izogene (celulele mamare și fibroblastele) ale cancerului uman pentru a elucida circuitele de reglementare transcripționale implicate în procesul de transformare celulară. Aceasta implică experimente mecaniciste pe bucla de feedback inflamator și aspecte conexe ale procesului de transformare celulară; profilurile genomului întreg al ARNm, microARN-urilor și site-urilor de legare a factorului de transcripție pentru a oferi o viziune integrată a transformării celulare; și identificarea genelor, microARN-urilor și căilor de reglementare implicate în generarea celulelor stem canceroase și a mamiferelor. Proiectele includ 1) ARNm, miARN și linc ARN profilarea sferelor vs.celulele canceroase în diferite tipuri de celule canceroase; 2) profilarea ribozomilor în timpul transformării celulare; și 3) experimente ChIP-Seq la scară largă pentru a determina rolul factorilor de transcripție în transformare. În cele din urmă, după ce am descoperit că medicamentul pentru diabet metformin ucide selectiv celulele stem canceroase, investigăm mecanismul acțiunii metforminei și potențialul său de prevenire și tratament al cancerului.
