Clayton servito in precedenza nella Chiesa LDS come vescovo, palo alto consigliere, consigliere in una presidenza missione, rappresentante regionale, e zona settanta. Al momento della sua chiamata come area settanta, i Clayton vivevano a Irvine, in California.
Clayton è stato chiamato come autorità generale e membro del Primo Quorum dei Settanta nel 2001. I precedenti incarichi come autorità generale hanno incluso il servizio sia come consigliere che come presidente dell’area Sud America sud della chiesa e come assistente direttore esecutivo del Dipartimento di storia della famiglia e della Chiesa. Quando Clayton è stato chiamato alla Presidenza dei Settanta il 5 aprile 2008, gli è stata assegnata la responsabilità di supervisione per le aree Nord America Ovest e Nord America Nord-ovest della chiesa. Dal 2012 al 2015, ha supervisionato il lavoro della chiesa nelle tre aree geografiche all’interno dello Utah. Nell’agosto 2015, Clayton ha presieduto l’inaugurazione del tempio Cedar City Utah della chiesa.
Mentre la Chiesa LDS ha ricevuto critiche per presunti abusi sessuali su ragazzi nelle unità di scouting della chiesa, risalenti a decenni fa ma resi pubblici da accuse nel 2015, Clayton ha commentato gli sforzi in corso della chiesa per prevenire gli abusi sui minori all’interno dei suoi programmi.
Da ottobre 2015 ad agosto 2020, Clayton è stato il membro anziano, o presidente, della Presidenza dei Settanta. Ha riempito la posizione precedentemente ricoperta da Ronald A. Rasband, che fu chiamato a servire nel Quorum dei Dodici Apostoli. È stato designato come autorità generale emerita nell’ottobre 2020.
Nell’aprile 2016, il fratello di Clayton, Weatherford T. Clayton, è stato sostenuto come autorità generale.
Clayton è stato relatore in numerosi eventi o forum religiosi, parlando frequentemente sulla libertà religiosa.