choroba Kufs typu A i typu B są spowodowane mutacjami w dwóch zestawach różnych genów. Oba zestawy genów są odpowiedzialne za produkcję białek i enzymów, które są silnie zaangażowane w degradację białek i wydalanie w komórce-konkretnie w komórce nerwowej.
Typ AEdit
mutacje genów CLN6 i PPT1 powodują chorobę Kufs typu A. CLN6 wytwarza białka, które ułatwiają transport tłuszczu w komórce, a także wydalanie z komórki. Gen PPT1 koduje enzym tioesterazy palmotoilowo-białkowej-1. Enzym ten jest odpowiedzialny za usuwanie łańcuchów bocznych kwasów tłuszczowych z białek, które zostały przeniesione do lizozymu. Usuwając otaczające tłuszcze, tioesteraza palmotoilowo-białkowa-1 zapewnia łatwiejszy dostęp innym enzymom do rozkładania reszty białka. Substancja tłuszczowa gromadzi się w mózgu jest konsekwencją zmutowanych genów. Tłuszcze i białka, które się gromadzą, nazywane są lipopigmentami. Ostatecznie nagromadzenie lipopigmentów prowadzi do śmierci komórek neuronowych, ustępując miejsca objawom fenotypowym. Typ A jest chorobą autosomalną recesywną, co wskazuje, że jest dziedziczona po rodzicach. Każdy rodzic musi posiadać jedną kopię mutacji; jednak oznaczenie recesywne wskazuje, że z tylko jedną kopią rodzice nie są dotknięci i nie wykazują żadnych objawów.
Typ BEdit
choroba Kufs typu B jest spowodowana mutacjami w genach DNAJC5 i ctsf. Ta forma Kufs jest autosomalnie Dominująca, co oznacza, że tylko jedna kopia każdego zmutowanego genu wystarcza do manifestacji choroby. Mutacja genu DNAJC5 wpływa na produkcję białka łańcuchowego cysteiny (CSP) kodowanego w obrębie DNAJC5. CSP pomaga w przekazywaniu sygnałów przez nerwy znajdujące się w mózgu. Kiedy Gen CTSF jest zmutowany, nie może wytwarzać katepsyny F enzymu, który tnie białka w lizozymie. Poprzez cięcie białek, Cathepsin F może modyfikować funkcję białek, jak również pomóc je rozbić. Podobnie jak typ A, gdy zarówno DNAJC5, jak i CTSF są niefunkcjonalne, skutkuje to niepełnym rozpadem białek. Po raz kolejny, lipopigmenty narastają, a funkcja mózgu zmniejsza się wraz z obumarciem komórek neuronowych.