Haplogroup L2 (mtDNA)

L2 ma pięć głównych podhaplogrup: L2a, L2b, L2c, L2d i L2e. z tych linii, najczęstszym podkladem jest L2a, który występuje zarówno w Afryce, jak i na Lewancie.

haplogrupa L2 została zaobserwowana wśród okazów na cmentarzu Wyspowym w Kulubnarti, w Sudanie, które pochodzą z wczesnego okresu chrześcijańskiego (AD 550-800).

haplogrupa L2aEdit

L2a jest szeroko rozpowszechniona w Afryce i najbardziej powszechna i szeroko rozpowszechniona Subsaharyjska Afrykańska haplogrupa, a także jest nieco częsta w 19% w Amerykach wśród potomków Afrykanów (Salas et al., 2002). L2a ma prawdopodobną datę powstania ok. 48 000 YBP.

jest szczególnie obfity w Czadzie (38% próby; 33% niezróżnicowanych L2 wśród Arabów Czadyjskich), a w populacjach spoza Bantu w Afryce Wschodniej (Kenia, Uganda I Tanzania)-38%. Około 33% w Mozambiku i 32% w Ghanie.

podklada ta charakteryzuje się mutacjami w 2789, 7175, 7274, 7771, 11914, 13803, 14566 i 16294. Stanowi 52% całkowitej L2 i jest jedynym podkladem L2 rozpowszechnionym w całej Afryce.

szeroki rozkład L2a i różnorodność utrudnia identyfikację pochodzenia geograficznego. Główną zagadką jest prawie wszechobecna haplogrupa L2a, która mogła rozprzestrzenić się na wschód i zachód wzdłuż korytarza Sahelu w Afryce Północnej po ostatnim maksimum Lodowcowym, lub początki tych ekspansji mogą leżeć wcześniej, na początku późniejszej epoki kamiennej ∼ 40 000 lat temu.

we wschodniej Afryce L2a znaleziono 15% W Dolinie Nilu–Nubia, 5% Egipcjan, 14% Cuszytów, 15% semickich amharów, 10% Gurage, 6% Tigraj-Tigrinia, 13% Etiopczyków i 5% Jemeńczyków.

haplogrupa L2a pojawia się również w Afryce Północnej, z najwyższą częstotliwością 20% Tuareg, Fulani (14%). Występuje również wśród niektórych Arabów algierskich, występuje w 10% wśród Arabów marokańskich, niektórych Berberów marokańskich i Berberów tunezyjskich. (watson 1997) et al., (vigilant 1991) et al. 1991.

u pacjentów, którym podawano stawudynę w leczeniu HIV, haplogrupa L2a wiąże się z mniejszym prawdopodobieństwem neuropatii obwodowej jako działania niepożądanego.

haplogrupa L2a1Edit

L2a można dalej podzielić na L2a1, kryjąc Przejście W 16309 (Salas et al. 2002).

podklada ta jest obserwowana z różną częstotliwością w Afryce Zachodniej wśród Malinke, Wolof i innych; wśród Północnej Afryki;w Sahelu wśród Hausa, Fulbe i innych; w Afryce Środkowej wśród Bamileke, fal i innych; w Afryce Południowej wśród rodziny Khoisan, w tym mówców Khwe i Bantu; i we wschodniej Afryce wśród Kikuyu z Kenii.

wszystkie klady L2 obecne w Etiopii pochodzą głównie z dwóch podklad, L2a1 i L2b. L2a1 jest zdefiniowany przez mutacje w 12693, 15784 i 16309. Większość etiopskich sekwencji L2a1 ma mutacje w nps 16189 i 16309. Jakkolwiek, podczas gdy The większość (26 z 33) Afroamerykanie dzielić Haplogroup L2A kompletny Sekwencja móc partitioned w cztery subclades przez podstawienie przy nps L2a1e-3495, L2a1a-3918, L2a1f-5581, i l2a1i-15229. Żadna z tych sekwencji nie została zaobserwowana w 16309 próbkach L2a1. (Salas 2002) et al.

haplogrupa L2a1 także obserwował wśród Mahra (4.6%).

haplogrupa L2a1 została znaleziona w starożytnych skamieniałościach związanych z kulturą neolityczną w Tell Halula, Syria. Okaz wydobyty w miejscu Neolitu sawanny w Luxmandzie w Tanzanii również zawierał Klad L2a1. Analiza grupowania domieszek wykazała ponadto, że osobnik miał znaczące pochodzenie ze starożytnego Lewantu, potwierdzając powiązania przodków między twórcami sawanny pasterskiej Neolitu a Neolitem przedpotopowym.

haplogrupa L2a1aEdit

Podklada L2a1a jest zdefiniowana przez podstawienia w 3918, 5285, 15244 i 15629. Istnieją dwa klastry L2a, które są dobrze reprezentowane w południowo-wschodniej Afryce, L2a1a i L2a1b, oba zdefiniowane przez przejścia w dość stabilnych pozycjach HVS-I. Wydaje się, że oba te typy pochodzą z Afryki Zachodniej lub północno-zachodniej (na co wskazuje rozmieszczenie pasujących lub sąsiednich typów) i uległy dramatycznej ekspansji albo w Afryce Południowo-Wschodniej, albo w populacji przodków do dzisiejszych Południowo-Wschodnich Afrykanów.

Ostatnie wybuchy gwiazd w podkladach L2a1a i L2a2 sugerują podpis dla rozszerzeń Bantu, jak również zaproponowane przez Pereira et al. (2001).

L2a1a jest zdefiniowany przez mutację w 16286. Kandydat na założyciela L2a1a datuje się na 2700 (SE 1200) lat temu. (Pereira et al. 2001). Jednak L2a1a, jak określono przez podstawienie at (np 16286) (Salas et al. 2002), jest obecnie wspierany przez znacznik regionu kodującego (np 3918) (rys. 2A) i został znaleziony w czterech z sześciu jemeńskich linii L2a1. L2a1a występuje z najwyższą częstotliwością w południowo-wschodniej Afryce (Pereira et al. 2001; Salas et al. 2002). Zarówno częsty haplotyp założyciela, jak i pochodne linie (z mutacją 16092) znalezione wśród Jemeńczyków mają dokładne dopasowanie w sekwencjach Mozambickich (Pereira et al. 2001; Salas et al. 2002). L2a1a występuje również z mniejszą częstotliwością w północno-zachodniej Afryce, wśród Maure i Bambara w Mali i Mauretanii. (Rando et al. 1998; Maca-Meyer et al. 2003)

haplogrupa L2a1a1Edit

L2a1a1 jest definiowana przez markery 6152c, 15391t, 16368c

haplogrupa L2a1bEdit

L2a1b jest definiowana przez podstawienia w 16189 i 10143. 16192 jest również powszechne w L2a1b i L2a1c; występuje w Afryce Północnej w Egipcie, występuje również w Afryce Południowo-Wschodniej i może być także wyznacznikiem ekspansji Bantu.

haplogrupa L2a1cEdit

L2a1c często akcje mutacja 16189 z L2a1b, ale ma swój własny markery w 3010 i 6663. 16192 jest również powszechne w L2a1b i L2a1c; pojawia się w południowo-wschodniej Afryce, a także w Afryce Wschodniej. Sugeruje to pewne zróżnicowanie tego kladu in situ.

pozycje T16209C C16301T C16354T na szczycie L2a1 definiują mały podklad, nazwany L2a1c przez Kivisild et al. (2004, Rysunek 3) (patrz także rysunek 6 w Salas et al. 2002), który występuje głównie w Afryce Wschodniej (np. Sudan, Nubia, Etiopia), wśród Turkany i Afryki Zachodniej (np. Kanuri).

w basenie Czadu zidentyfikowano cztery różne typy L2a1c, jeden lub dwa mutacyjne z typów wschodnioafrykańskich i zachodnioafrykańskich. (Kivisild et al.) 2004. (cytat na stronie.9 lub 443)

haplogrupa L2a1c1Edit

L2a1c1 ma pochodzenie północnoafrykańskie. Jest definiowany przez markery 198, 930, 3308, 8604, 16086. Występuje w Tunezji Sefardyjczyków, Aszkenazyjczyków, Żydów, Hebrajczyków, Marokańczyków, Egipcjan, Nubijczyków i Jemeńczyków.

haplogrupa L2a1f

Khosian, Zambia, Madagascar

haplogrupa L2a1kEdit

L2a1k jest definiowana przez markery g6722a i T12903C. to był wcześniej opisany jako Europejski-specyficzny subclade L2a1a i wykrywany w Czechach i Słowakach.

haplogrupa L2a1l2aEdit

l2a1l2a jest rozpoznawana jako „specyficzna dla Aszkenazyjczyków” haplogrupa, widziana wśród Żydów aszkenazyjskich z przodkami w Europie Środkowej i Wschodniej. Wykryto go również w niewielkich ilościach u pozornie nieżydowskiej ludności polskiej, gdzie przypuszcza się, że pochodził z domieszki Aszkenazyjskiej. Haplotyp ten stanowi jednak tylko bardzo mały odsetek aszkenazyjskich linii mitochondrialnych; różne badania (w tym Behara) oceniają jego częstość na 1,4–1,6%.

haplogrupa L2a2Edit

l2a2 jest charakterystyczna dla Pigmejów Mbuti.

haplogrupa L2b 'cedit

L2B’ C prawdopodobnie wyewoluowała około 62 000 lat temu.

haplogrupa L2bEdit

ten podklad jest przewaznie znaleziony w zachodniej Afryce, ale to jest rozprzestrzeniony w calej Afryce.

haplogrupa L2cEdit

L2c występuje najczęściej w Afryce Zachodniej i może tam powstać. Szczególnie obecny w Senegalu 39%, Republice Zielonego Przylądka 16% i Gwinei Bissau 16%.

haplogrupa L2dEdit

L2d występuje najczęściej w Afryce Zachodniej, gdzie może powstać. Występuje również w Jemenie, Mozambiku i Sudanie.

haplogrupa L2eEdit

L2E (dawniej l2d2) jest typowa w Afryce Zachodniej. Występuje także w Tunezji, a także wśród ludzi z Gwinei Bissau i Afroamerykanów.