John Sulston.Autor: Scott Barbour /
zasada, że dane genomowe powinny być powszechnie udostępniane bez udziału komercyjnego, zawdzięcza swoją powszechną akceptację w dużej mierze Johnowi Sulstonowi. Jako lider brytyjskiego wkładu w międzynarodowy projekt genomu ludzkiego, Sulston przekonał fundatorów i współpracowników o kluczowym znaczeniu udostępnienia pełnej, wysokiej jakości sekwencji bezpłatnie globalnej społeczności naukowej. Jego zaangażowanie wynikało z moralnej pewności, że zysk jako motyw nie ma miejsca w nauce.
w 2002 roku podzielił się Nagrodą Nobla w dziedzinie fizjologii lub medycyny za swój wkład w zrozumienie, w jaki sposób geny kontrolują losy komórek u rozwijającego się glisty Caenorhabditis elegans. W swoich pracach na temat linii komórek robaka, a później sekwencjonowania genomu, Sulston promował ideę, że inwestowanie w zbieranie danych na dużą skalę bez konkretnej hipotezy ma długoterminowe korzyści.
Sulston, który zmarł 6 marca, był synem angielskiego duchownego i nauczyciela. Wziął sobie do serca obojętność rodziców na bogactwo materialne i chęć pracy dla wspólnego dobra. Mechanika fascynowała go od najmłodszych lat i poprzez sekcję martwych zwierząt zaczął postrzegać żywe istoty jako maszyny. Otrzymał stypendium na studia przyrodnicze na Uniwersytecie Cambridge w Wielkiej Brytanii.
jego Doktorat, również w Cambridge, dotyczył syntezy oligonukleotydów-budulców kwasów nukleinowych, takich jak DNA i RNA. Jego talent jako Eksperymentatora zapewnił mu posadę podoktora z chemikiem organicznym Leslie Orgelem w Salk Institute for Biological Studies w La Jolla w Kalifornii, badając początki życia. Sulston przybył w 1966 roku, aby zbadać replikację kwasów nukleinowych i po raz pierwszy zrozumiał ewolucyjny kontekst swojej pracy z chemii.
tam też Sulston spotkał Francisa Cricka, współodkrywcę podwójnej helisy DNA; Crick zarekomendował go na stanowisko w Laboratorium Biologii Molekularnej Medical Research Council w Cambridge. W 1969 roku Sulston dołączył do niewielkiej grupy kierowanej przez genetyka Sydney Brenner. Szukając wzorcowego organizmu, w którym można zbadać interakcje genów, rozwój i zachowanie, Brenner wybrał C. elegans. Maleńki robak jako dorosły ma tylko 959 komórek, ale ma jelito, układ nerwowy, gonady i repertuar zachowań do poruszania się, karmienia i rozmnażania.
jest również przezroczysty. Sulston użył swojego ulubionego narzędzia, mikroskopu różnicowo-interferencyjnego Nomarskiego, do wizualizacji jąder komórkowych u żywych larw robaków, a później u trudniejszych zarodków. Zaobserwował i zarejestrował niezmienną sekwencję podziałów komórkowych budujących dorosłego robaka. Jego prace dostarczyły podstaw dla przyszłych biologów robaków do odpowiedzi na pytania dotyczące rozwoju, które mają implikacje dla innych gatunków, w tym dla naszego.
Sulston zauważył, że niektóre komórki są eliminowane podczas rozwoju. Zaczął badać genetykę tego procesu z amerykańskim postdoc Robertem Horvitzem. Po powrocie do domu w Massachusetts Institute of Technology w Cambridge Horvitz odkrył geny regulujące programowaną śmierć komórek. Później mutacje w tych genach okazały się pomocne w zrozumieniu niekontrolowanego namnażania się komórek nowotworowych. Sulston, Horvitz i Brenner otrzymali w 2002 roku Nagrodę Nobla „za odkrycia dotyczące genetycznej regulacji rozwoju narządów i programowanej śmierci komórek”.
od 1983 roku Sulston zaczął mapować i sekwencjonować 100-milionowy Genom pary zasad robaka. Jego laboratorium pracowało w partnerstwie i przyjaznej konkurencji z Robertem Waterstonem, a następnie na University of Washington w St. Louis. W 1989 roku, ich wspólny wysiłek zmotywował Jima Watsona, ówczesnego szefa Human Genome Project, do sfinansowania ich pilotażowej inicjatywy sekwencjonowania. Projekt worm wykazał, że zautomatyzowane sekwencjonowanie ludzkiego genomu o wysokiej przepustowości nie jest niemożliwe. W 1992 roku brytyjski Wellcome Trust zaprosił Sulstona do kierowania swoim nowym zakładem sekwencjonowania, Sanger Centre (obecnie Sanger Institute) w Hinxton.
prowadząc Sanger jako część międzynarodowego konsorcjum, Sulston miał kluczową rolę w ustanawianiu zasad udostępniania danych i otwartego dostępu. Kiedy w 1998 roku prywatna inicjatywa Craiga Ventera z Celera Genomics ogłosiła zamiar sekwencjonowania ludzkiego genomu jako pierwszego i dla zysku komercyjnego, Sulston bronił Zasady otwartych danych. Wraz z Francisem Collinsem — ówczesnym szefem amerykańskiego Narodowego Instytutu Badań nad ludzkim genomem-stał się wiodącym głosem w przekonywaniu zarówno amerykańskich Narodowych Instytutów Zdrowia, jak i Wellcome Trust do zaangażowania się w zakończenie projektu. Sekwencja ludzkiego genomu, zakończona do normy 99.99% dokładność, został opublikowany w Nature w dniu 21 października 2004 (International Human Genome Sequencing Consortium Nature 431, 931-945; 2004).
jak przewidywał Sulston, dostępność pełnego ludzkiego genomu napędzała badania, zarówno akademickie, jak i komercyjne, na całym świecie. Prace powoli dostarczają zastosowań klinicznych, zwłaszcza w takich obszarach jak rak, gdzie mutacje genetyczne decydują o tym, czy nowotwór będzie wrażliwy na terapię. Tymczasem Technologia się rozwinęła i koszty spadły tak, że sekwencjonowanie całego genomu jednostek może wkrótce stać się rutyną.
Sulston był praktyczny w laboratorium, osobiście przygotowując bibliotekę klonów robaków do projektu mapowania i odszyfrowując wczesne maszyny sekwencjonujące, aby dane elektroniczne mogły być bezpośrednio analizowane. Ale zawsze cenił współpracowników o umiejętnościach innych niż jego własne, i wspólnie zarządzał Sangerem w siedmioosobowym zarządzie. Kiedy poprosił mnie o współautorstwo książki o walce o ludzki genom, wspólny wątek, nalegał, abyśmy pracowali jako równi partnerzy.
po publikacji The human sequence, Sulston poświęcił się pisaniu i mówieniu na rzecz otwartego dostępu i, szerzej, na temat relacji między nauką a społeczeństwem. Ciepły i elokwentny, zdobył publiczność swoją pokorą i pasją.
