Dr Kagan od maja 2007 roku przeprowadził osiem okrążeń bojowych Iraku dla dowódcy MNF-I, z czego trzy były w Afganistanie dla Centralnego Dowództwa Stanów Zjednoczonych (CENTCOM) i międzynarodowych sił wsparcia bezpieczeństwa (ISAF). W październiku 2008 r.była członkinią zespołu ds. oceny planu kampanii dla Wielonarodowej misji Irak-Irak-USA w październiku 2008 r., a w styczniu 2009 r. weszła w skład Cywilnego Zespołu Doradczego ds. przeglądu strategicznego CENTCOM. Kagan służył w Kabulu jako członek zespołu ds. oceny strategicznej generała Stanleya Mcchrystala, złożonego z cywilnych ekspertów, podczas jego przeglądu strategicznego w czerwcu i lipcu 2009 r. Do Afganistanu wróciła latem 2010 r., aby pomóc generałowi Davidowi Petraeusowi w realizacji zadań przejściowych po objęciu przez niego dowództwa w Afganistanie. Kagan zasiada również w Akademickiej radzie doradczej w afgańsko-pakistańskim Centrum Doskonałości w CENTCOM.
Kagan jest założycielem i prezesem Instytutu Studiów nad wojną (ISW). ISW opisuje siebie jako ” bezpartyjny think tank non-profit, który ma na celu dostarczanie badań i analiz w szczególności dotyczących kwestii obrony i Spraw Zagranicznych. ISW tworzy kompleksowe raporty na temat realiów wojny; koncentrując się na operacjach wojskowych, zagrożeniach wroga i trendach politycznych w różnych strefach konfliktu”.
w dniu 25 maja 2010 r. Kagan uczestniczył w odprawie na Kapitolu, skupiającej się na kryzysie politycznym Iraku, która zawierała przemówienia irackiego ambasadora Samira Sumaidaie i dr Kennetha Pollacka, Senior Fellow w Brookings Institution. Kagan wziął również udział w wydarzeniu Brookings Institution zatytułowanym „Prospects for Afghanistan’ s Future: Assessing the Outcome of the Afghan Presidential Election” wraz z Dr. Michaelem E. O ’ Hanlonem.
organizacja Kagana, ISW, sfinansowała stworzenie 34-minutowego dokumentu The Surge: The Untold Story z dyrektorem CIA gen. Davidem Petraeusem, przewodniczącym ISW, generałem armii USA Jackiem Keane (ret.) i por. Jakub Dubik (ret.) opisując strategię wzrostu w Iraku i jak niektórzy wysocy rangą oficerowie amerykańscy twierdzą, że spacyfikowali kraj i w ten sposób wygrali wojnę.
wraz z generałem Keane, Kagan jest członkiem Rady Doradczej Spirit of America, organizacji 501(c) (3), która wspiera bezpieczeństwo i sukces Amerykanów służących za granicą oraz lokalnych ludzi i partnerów, których szukają, aby pomóc.
