uważana za najbardziej zanieczyszczoną rzekę w Izraelu przez kilka władz rządowych w tej sprawie, była przedmiotem kontrowersji dotyczących walki o poprawę jakości wody. Zanieczyszczenie wynika częściowo z codziennego zanieczyszczenia przez ponad 40 lat rtęcią, innymi metalami ciężkimi i organicznymi chemikaliami przez pobliskie zakłady chemiczne.
w 2000 roku twierdzono, że w rzece jest więcej chemikaliów niż wody, a mycie rąk w tej rzece może spowodować poważne oparzenia chemiczne. Kilkakrotnie rzeka ta (a raczej plamy odpadów petrochemicznych na niej) zapaliła się od zanieczyszczeń chemicznych. Poniżej mostu Histadrut (Autostrada 4), po przejściu przez strefę przemysłu petrochemicznego, pH przez większość czasu w 2001 r. było 3 lub poniżej.
badanie z 2002 r. wykazało zdolność 3-godzinnego narażenia na Wodę rzeki Kishon do wywoływania uszkodzeń DNA w komórkach wątroby pstrąga tęczowego do średnio trzykrotnego uszkodzenia nieskażonej wody. Zwłaszcza dolny Kishon, poniżej strefy przemysłu petrochemicznego, miał znacznie podwyższony potencjał genotoksyczny.
analiza wody rzecznej z 2000 r. wykazała obecność związków chlorowanych w zrzutach z rafinerii, miejskiej oczyszczalni ścieków oraz z zakładu produkcji nawozów chemicznych w Hajfie. Metale ciężkie były obecne w zrzutach z zakładów Carmel Olefins i Haifa Chemicals. Górny system rzeczny może być również mieszany z materiałami genotoksycznymi z odpadów domowych i spływów rolnych, które zawierają pestycydy i nawozy. Silne genotoksyny zwykle występujące w odpadach domowych obejmują również związki N-nitrozowe i Aminy aromatyczne, o których wiadomo, że są obecne w odpływach sanitarnych ludzi, a także genotoksyczne WWA występujące w zrzutach komunalnych.
; 1,000,000 metrów sześciennych rocznie wody pitnej dodaje się do rzeki Kishon, & zmniejszyło stężenie soli, azotanów, & fosforanów, o ponad 50%. Przepływ ten zostanie zastąpiony przez źródła Doliny Jezreel, ponieważ ich przepływ jest usuwany z nawadniania.
Oczyszczanieedytuj
w 2012 roku izraelskie Ministerstwo Ochrony Środowiska ogłosiło przetarg na oczyszczenie rzeki Kishon w projekcie kosztującym 220 milionów NIS. Znaczna część finansowania projektu pochodziła od firm odpowiedzialnych za zanieczyszczenie. Kanadyjska firma EnGlobe Corp. w 2012 roku rozpoczęto prace porządkowe nad rzeką. Projekt sprzątania ma zostać zakończony w 2015 roku.
Shayetet 13Edit
od 2001 roku odkryto, że weterani Shayetet 13 mieli wysokie występowanie raka, prawdopodobnie z powodu szkolenia w zanieczyszczonej rzece Kishon i Zatoce Hajfy. Komisja do zbadania sprawy nie znalazła statystycznych dowodów na to, że nurkowanie w Kishon spowodowało nowotwory. Jednak mimo ustaleń komisji Minister obrony Shaul Mofaz postanowił zrekompensować rodzinom nurków.