tradycyjna klasyfikacja narzucała podział na formy roślinne i zwierzęce na jednokomórkowe eukarioty, czyli protisty; w obecnym ujęciu protisty są zróżnicowanym zbiorem grup roślinnych, zwierzęcych i grzybopodobnych. Klasyfikacja tych gatunków do phyli jest trudna ze względu na ich stosunkowo prostą strukturę i ograniczony zapis geologiczny, ale badanie ultrastruktury i innych cech dostarcza nowego wglądu w klasyfikację Protista. Rozważane są możliwe klasyfikacje i sugerowana jest sumaryczna klasyfikacja świata żywego na Królestwa (Monera, Protista, Fungi, Animalia, Plantae) i phyla. Klasyfikacja ta sugeruje również grupowanie phyla do superphyla i formy-superphyla oraz rozszerzone Królestwo Protista (w tym zielone glony, oomycoty i śluzowce, ale z wyłączeniem czerwonych i brązowych glonów). Klasyfikacja ta ma więc na celu zaproponowanie kompromisu pomiędzy protistami i protoctistami królestw Whittaker i Margulis oraz połączenie pełnej listy phyli z grupowaniem ich w celu leczenia synoptycznego.
