w połowie lat 1610-tych Szach Abbas i ponowił swoje wysiłki na rzecz pełniejszego włączenia Gruzji do Imperium Safawidów i poddał Kachetię powtarzającym się najazdom w 1614, 1615 i 1616 roku. W serii gruzińskich powstań i irańskich represji zginęło od sześćdziesięciu do siedemdziesięciu tysięcy ludzi, a ponad sto tysięcy kachetyckich chłopów zostało siłą deportowanych do Iranu. Ludność Kachetii spadła o dwie trzecie; niegdyś kwitnące miasta, takie jak Gremi i Zagemi, skurczyły się do nieistotnych wiosek; Rolnictwo spadło, a handel stanął w miejscu.: 50-51 do 1648 roku niestrudzony Tajmuraz został ostatecznie wyparty z Kachetii. Rząd Safawidów zaostrzył kontrolę nad Kachetią, wprowadził politykę zastępowania rdzennej ludności koczowniczymi plemionami tureckimi. W tym samym czasie Górale Dagestańscy zaczęli atakować i kolonizować kachetyjskie Marchie.
w 1659 roku Kachetianie wzniecili powstanie generalne, udaremniając Safawidom plany osiedlenia dziesiątek tysięcy Turkomanów w Kachetii. Kachetia pozostała jednak pod polityczną kontrolą Iranu; trzej arystokratyczni przywódcy powstania poddali się i zostali straceni. Kilka lat później Wachtangowi V Szah-Nawazowi, muzułmańskiemu gruzińskiemu królowi / vali z Kartli, udało się uzyskać zgodę szacha na umieszczenie jego syna Archila na stanowisku króla/vali w Kachetii. Przez pewien czas dwa królestwa wschodniej Gruzji były praktycznie zjednoczone pod rządami Szah-Nawaza i jego syna, i nastał okres względnego pokoju. Czyniąc miasto Telawi swoją stolicą, w miejsce zniszczonego przez irańskie najazdy Gremi, Archil postanowił wdrożyć program odbudowy. Obiecująca sytuacja była jednak krótkotrwała. Wniebowstąpienie archila w Kachetii zapoczątkowało rywalizację między dwoma gałęziami Bagrationi-Mukhrani, do których należał Archil, a domem Kachetii, pozbawionym Korony w osobie Teimuraza I. Ten ostatni dom ostatecznie zdołał, kosztem odstępstwa od islamu, przywrócić się w 1703 r.i odtąd rządził według przyjemności swoich safawidzkich suzerenów. Okazało się to jednak mało korzystne, a królestwo nadal było nękane nieustannymi atakami Dagestanu.
w latach 1724-1744 Kachetia była poddawana kolejnej okupacji osmańskiej i irańskiej. Jednak usługi świadczone przez Kachetyjskiego księcia Teimuraz II nader szachowi Iranu w walce z Turkami doprowadziły do unieważnienia ciężkiego hołdu płaconego przez Kachetię irańskiemu dworowi w 1743 roku. W 1744 roku, w nagrodę za lojalność, Nader nadał Kartli Królestwo Teimurazowi II, A Kartli jego synowi Ereklowi II. obaj monarchowie zostali koronowani zgodnie z tradycją chrześcijańską w 1745 roku. Wykorzystali zamieszanie w Iranie, które nastąpiło po zabójstwie Nadera w 1747 roku i stali się praktycznie niezależnymi władcami. Ich rządy przyczyniły się do stabilizacji kraju; gospodarka zaczęła się ożywiać, a ataki Dagestańskie zostały zredukowane, ale nie wyeliminowane. Kiedy Teimuraz zmarł 8 stycznia 1762 roku, Erekle zastąpił go, jednocząc Wschodnią Gruzję jako jedno państwo po raz pierwszy od prawie trzech stuleci, w postaci Królestwa Kartli-Kachetii.