Zachodnie studia
badania współczesnej nauki Europejskiej, określane jako yōgaku („Zachodnie uczenie się”) lub rangaku („Holenderskie uczenie się”), również przyciągnęły uwagę ciekawskich uczonych, zwłaszcza że reżim zaczął tracić swoją skuteczność. Wielkim bodźcem do konkretnego rozwoju Zachodnich studiów była publikacja w 1774 roku Kaitai shinsho („Nowa Księga anatomii”), przekładu Sugity Gempaku i innych książek anatomicznych importowanych z Holandii. Później Zachodnie studia stawały się coraz bardziej dynamiczne, koncentrując się przede wszystkim na medycynie. Jednak wraz z nasileniem się kryzysu systemowego wielu uczonych zachodnich studiów zaczęło krytykować politykę odosobnienia, wzbudzając gniew bakufu. Na przykład kilku uczonych rangaku skrytykowało Plan bakufu ataku na amerykański statek handlowy. Wynikające z tego prześladowania Watanabe Kazana, Takano Choei i innych uczonych przez urzędników bakufu w tak zwanym incydencie Bansha no goku zadały poważny cios zachodnim studiom w Japonii. Następnie, w miarę jak świadomość zagrożenia zagranicznego rosła w siłę, zwolennicy Zachodnich studiów kładli duży nacisk na badanie technologii wojskowej.
pojawili się również inni filozofowie, którzy odrzucili społeczeństwo feudalne. Andō Shōeki odrzucił warstwowe społeczeństwo ustanowione przez władców jako jedynie zmyślenie, głosząc w jego miejsce „naturalne społeczeństwo”, w którym wszyscy byli równi. W swoim dziele Shizen shin ’ eidō (ok. 1753) shōeki przedstawił idealną społeczność, w której wszyscy ludzie w równym stopniu zajmują się rolnictwem, bez różnic społecznych i wyzysku. Podczas gdy Shōeki może być uważany za wyjątkowego w stopniu swojej krytyki społeczeństwa, inni rozwinęli krytyczne antyfeudalne światopoglądy, które były bezpośrednio lub pośrednio pod wpływem nauk empirycznych i zachodnich studiów. Miura Baien z Kyushu nazwał swoją naukę jōrigaku („racjonalnymi studiami”); zawierała ona dialektyczną metodę myślenia, która odrzucając ustaloną” drogę ” ortodoksyjnego neokonfucjanizmu, postrzegała świat jako stale zmieniający się. Przyrodnik Hiraga Gennai z domeny Takamatsu w Shikoku odrzucił ograniczone życie wojownika; został rōninem i przeniósł się do Edo, gdzie myślał i działał swobodnie. Jako zwolennik idei, że Japonia zapobiega odpływowi złota i srebra poprzez promowanie produkcji krajowej i wymianę tych produktów na dobra zagraniczne, Hiraga zasadniczo zgodził się z pragnieniem Tanumy Okitsugu, aby promować produkcję różnych towarów. Hiraga został zatrudniony przez Tanumę i wysłany do Nagasaki. Eksperymentując z dynamami i termometrami, Gennai oddał się w pełni swojemu geniuszowi, uprawiając trzcinę cukrową i marchew, produkując ceramikę w stylu holenderskim oraz badając i rozwijając kopalnie w różnych prowincjach kraju. Jako dramaturg stworzył również wiele znaczących dzieł.
dwoma innymi godnymi uwagi uczonymi końca XVIII i początku XIX wieku byli Shiba Kōkan i Yamagata Bantō. Artysta, który zaczynał w tradycji szkoły Kanō, a następnie studiował ukiyo-e u Harunobu, kōkan był pod silnym wpływem Holenderskich studiów i zachodniego racjonalizmu w ogóle. Jest znany jako pionier akwaforty w Japonii, ale w swoich pismach kōkan krytykował również system statusu Tokugawy, twierdząc, że cesarz i żebrak są podobnymi istotami ludzkimi, kładąc tym samym nacisk na ludzką równość. Bantō był głównym menedżerem bogatego kupca z ōsaki i znanym uczniem kaitokudō, omówionego powyżej. W swojej pracy Yume no shiro („zamiast snów”) zrekonstruował historię Japonii w epoce bogów na podstawie nauk przyrodniczych.