Dr. Alvarez forskning fokuserar på rollen av näring och kroppssammansättning på metabolism vid kroniska sjukdomar, inklusive cystisk fibros och cystisk fibrosrelaterad diabetes, typ 2-diabetes, hjärt-kärlsjukdom och kronisk njursjukdom. Hennes forskning integrerar state-of-the-art metabolomics med många aspekter av näringsforskning inklusive rigorösa kliniska prövningar, kroppssammansättningsanalys, biomarkörbedömning, analys av kostintag och fysisk aktivitet. Specifika forskningsfokus inkluderar: 1) användning av plasma med hög upplösning metabolomics, redox och bioenergetisk bedömning för att identifiera mål för näringsintervention för att optimera hälsan hos vuxna med cystisk fibros och cystisk fibrosrelaterad diabetes, 2) roll av vitamin D i svavel/disulfid tiol redox, insulinkänslighet, vaskulär funktion och kliniska resultat i den allmänna befolkningen och olika kliniska sjukdomar (t. ex. 3) roll av kost, kroppssammansättning och energimetabolism i etniska hälsoskillnader vid kroniska sjukdomar inklusive typ 2 diabetes mellitus och hjärt-kärlsjukdom, och 4) roll av diet i svavel/disulfid tiol redoxmedierad patofysiologi. Dr. Alvarez stöds för närvarande av ett NIH/NIDDK K01-bidrag med titeln ”Integration of Nutritional Metabolomics with Bioenergetics in Cystic Fibrosis.