han hade en berömd och långvarig fejd med tidigare Senator Vince Fumo. Den politiska webbplatsen PoliticsPA liknade förhållandet till Hatfield-McCoy fejd under 2008 demokratisk primär för 1: a senatorial district i Pennsylvania senat i Philadelphia, Dougherty fick ett överraskande nederlag av Larry Farnese, som fick starkt stöd av Fumo. Efter Doughertys koncession hördes Fumo sjunga ”Doc är död! Doc är död!”
2003 utsågs han till PoliticsPA ”Power 50” – listan över politiskt inflytelserika människor i Pennsylvania. År 2003 utsågs han till Pennsylvania-rapporten ”Power 75” – listan. År 2010 utsåg Politics Magazine honom till en av de mest inflytelserika demokraterna i Pennsylvania.
år 2015 godkände han tidigare Philadelphia City Councilman Jim Kenney för borgmästare i Philadelphia. Hans godkännande var en drivande faktor i hans seger i en fullsatt demokratisk primär.
i januari 2019 anklagades Dougherty i en IBEW Local 98-utredning som anklagade honom för att ha missbrukat fackliga medel till personlig nytta, bland många anklagelser. Hans försvar har hävdat kraftigt att påstådda aktiviteter faktiskt var lagliga, i Mars. Fallet har blivit ganska komplicerat med vissa tilltalade som ber att ärendet ska delas upp mellan olika omtvistade frågor, i Juli.
