Kekkei genkai (bokstavligen betyder ”en teknik begränsad till arv med blod” eller ”blodlinjegräns”) är förmågor som överförs genetiskt i specifika klaner. Det är möjligt för en ninja att ha mer än en av dessa förmågor. Kekkei genkai-förmågor som fungerar via användarens öga kallas D bisexjutsu. Andra kekkei genkai inkluderar att blanda en typ av elementärt chakra med en annan, skapa en ny unik för användarna, vilket vanligtvis är omöjligt för normal ninja.
Kekkei genkai och deras relaterade tekniker kan inte läras ut eller kopieras av andra. Kekkei genkai kan dock ges till andra. D ucorijutsu, eller annan kekkei genkai isolerad till ett enda organ, kan transplanteras i en annan kropp. Användning av dessa organ kräver mycket mer chakra än någon som är född med kekkei genkai. Chakraelement kan också överföras till människor utanför klanen genom att gå igenom en DNA-modifiering för att förvärva Frisättningstekniken. Men personens skicklighet i att använda den skulle inte vara nästan lika kraftfull som den ursprungliga utövaren.
även om kekkei genkai vanligtvis delas genetiskt inom en specifik klan, är det ibland unikt för en person ensam, och att även släktingar inte delar det. Ännu andra kekkei genkai verkar förekomma hos individer utan känd relation, såsom Lava Release, som har dykt upp i ninja från Kirigakure, Iwagakure och Kumogakure, medan Magnet Release, som har dykt upp i ninja från både Kumogakure och Sunagakure.
