Khama är förmodligen bäst ihågkommen för att ha fattat tre avgörande beslut under sin tid som chef. Först, även om han avskaffade bogwera-ceremonin själv, behöll Khama mephato-regementen som en källa till fri arbetskraft för en mängd olika ekonomiska och religiösa ändamål. Omfattningen av en mephatos arbetsansvar skulle senare utvidgas avsevärt under regimen av Khamas son Tshekedi till byggandet av grundskolor, spannmålssilor, vattennätningssystem och till och med ett college som heter Moeng ligger i utkanten av Serowe, som under Khamas regeringstid hade blivit Bamangwato-huvudstaden. I samförstånd med mephato introducerade Khama en mängd europeiska tekniska förbättringar i Bamangwato-territoriet, inklusive mogoma, eller oxdragen moldboard plog (i stället för handhakan) och vagnar för transport (i stället för slädar).
i dagens värld kan mephato betraktas som en exploaterande form av samhällshjälp. Bangwato män och kvinnor var skyldiga att delta i tilldelade arbetsprojekt när deras regementen kallades till tjänst. Och kallade de var, i ordets ordalydelse. En utsedd person från byn skulle klättra upp till toppen av Serowe Hill och bokstavligen skrika ut namnet på mephato som var planerad att börja arbeta. Alla medlemmar i mephato skulle släppa vad de gjorde och börja sin sexmånaders tulltur, utan något materiellt stöd från byn (särskilt utan något organiserat bidrag från mat). Mephato förväntades i allmänhet klara sig själv under sitt arbetsuppdrag.
efter att Khama blev kung 1875, efter att ha störtat sin far Sekgoma och böjt bort sin bror Kgamane, kom hans uppstigning i en tid med stora faror och möjligheter. Ndebele invasioner från norr (från vad som nu är Zimbabwe), Boer och ”blandade” vandrare från söder, och tyska styrkor från väst, alla hoppas att gripa sitt territorium och dess inlandet. Han svarade på dessa utmaningar genom att anpassa sin stat till de brittiska administrativa målen, som gav honom skydd och stöd, och, på liknande sätt, genom att energiskt utvidga sin egen kontroll över ett mycket bredare område än någon ”kgosi” före honom. Khama konverterade till kristendomen, vilket fick honom att kriminalisera sekterism och att avvärja de institutioner som gynnas av traditionalister. På Khamas begäran antogs stränga lagar mot import av alkohol. För att genomdriva alkoholförbudet förvisades vita från hans rike.
den brittiska regeringen själv var av två tankar om vad man skulle göra med territoriet. En fraktion, med stöd av en lokal missionär vid namn John Mackenzie, förespråkade inrättandet av ett protektorat, medan en annan fraktion, under ledning av Cecil Rhodes, antog en mer bestämd hållning och krävde att landet skulle öppnas för europeisk bosättning och ekonomiskt utnyttjande. Resolutionen kom 1885, då territoriet söder om Molopo River blev kolonin Brittiska Bechuanaland, medan territoriet norr om floden blev Bechuanaland protektorat. Kolonin införlivades så småningom i Storbritanniens Kapkoloni och är nu en del av Sydafrika.
Rhodos fortsatte sin kampanj för att pressa sin regering att bifoga det som återstod av Khamas territorium. 1895, med två andra chefer från angränsande stammar, Bathoen i och Sebele i, reste Khama till Storbritannien för att lobbya drottningen för skydd mot det dubbla trycket från Cecil Rhodes’ British South Africa Company – beläget i det som senare skulle bli Rhodesia i norr – och Afrikaner-bosättarna kryper upp från söder. Eftersom resan var missionärorganiserad blev Khamas kristendom centrum för kampanjen. Cheferna reste mycket över Storbritannien och talade till stora evangeliska publik. Inte bara var Khamas biografi skriven vid denna tidpunkt, men han fick stora mängder annan press som cementerade hans legend som en afrikansk Kristen. Resan till Storbritannien av de tre Tswana-kungarna visade sig så småningom framgångsrik efter den olyckliga Jameson-razzian 1896, när Rhodos rykte förstördes. Hade Khama och hans landsmän inte kunnat övertyga de brittiska myndigheterna om behovet av att skydda Bamangwato före Jameson Raid fiasko, det är mycket troligt att mycket av det som idag är Botswana skulle ha absorberats i Rhodesia och Sydafrika.
Khama III var orubblig i att införa sin kristna vilja på stammen. Han främjade skolor och föredrog att anställa utbildade kristna. Han förbjöd alkohol från stamländer (med varierande framgång), satte moratorier på försäljning av nötkreatur utanför Bamangwato-territoriet och stammark som eftergifter till utländska gruv-och boskapsintressen och avskaffade polygami. Avskaffandet av polygami var kanske hans mest kontroversiella drag. Vissa hävdar att när kristendomen senare spred sig bland protektoratets andra stammar och polygami avskaffades universellt, det samhälleliga ’limet’ som höll familjer ihop (utvidgades som de var genom polygami) torkade upp.
