Dr. Kagan har genomfört åtta slagfältcirkulationer i Irak sedan maj 2007 för MNF-I Commanding General, varav tre var i Afghanistan för United States Central Command (CENTCOM) och International Security Assistance Force (ISAF). Hon tjänstgjorde i Joint Campaign Plan Assessment Team för multinationell styrka-Irak-USA: s uppdrag Irak i oktober 2008 och som en del av Civil Advisory Team för CENTCOM strategic review I januari 2009. Kagan tjänstgjorde i Kabul som medlem i general Stanley Mcchrystals team för strategisk bedömning, bestående av civila experter, under hans strategiska granskning i juni och juli 2009. Hon återvände till Afghanistan sommaren 2010 för att hjälpa General David Petraeus med övergångsuppgifter efter hans övertagande av kommandot i Afghanistan. Kagan sitter också i Academic Advisory Board vid Afghanistan-Pakistan center of Excellence på CENTCOM.
Kagan är grundare och ordförande för Institute for the Study of War (ISW). ISW beskriver sig själv som en ”icke-partisan ideell tankesmedja som syftar till att ge forskning och analys specifikt om frågor om försvar och utrikesfrågor. ISW producerar omfattande rapporter om krigets realiteter; med fokus på militära operationer, fiendens hot och politiska trender i olika konfliktzoner”.
den 25 maj 2010 deltog Kagan i en briefing på Capitol Hill med fokus på Iraks politiska kris som inkluderade kommentarer från den irakiska ambassadören Samir Sumaidaie och Dr.Kenneth Pollack, Senior Fellow vid Brookings Institution. Kagan deltog också i en Brookings Institution händelse med titeln ”framtidsutsikter för Afghanistans framtid: bedömning av resultatet av det afghanska presidentvalet” tillsammans med Dr.Michael E. O ’ Hanlon.
Kagans organisation, ISW, finansierade skapandet av en 34-minuters dokumentär, The Surge: The Untold Story med CIA-direktören General David Petraeus, ISW-ordförande, US Army General Jack Keane (ret.) och LTG James Dubik (ret.) beskriver surge-strategin i Irak och hur vissa högt rankade amerikanska officerare hävdar att de har pacifierat landet och därmed vunnit kriget.
tillsammans med General Keane är Kagan en rådgivande styrelseledamot i Spirit of America, en 501(c)(3) organisation som stöder säkerheten och framgången för amerikaner som tjänar utomlands och lokalbefolkningen och partnerna de försöker hjälpa.
