Kinome

denna artikel handlar om termen i molekylärbiologi. För växten och maten, se Zanthoxylum piperitum.

i molekylärbiologi, biokemi och cellsignalering är en organisms kinom den kompletta uppsättningen proteinkinaser kodade i dess genom. Kinaser är vanligtvis enzymer som katalyserar fosforyleringsreaktioner (av aminosyror) och faller i flera grupper och familjer, t.ex. de som fosforylerar aminosyrorna serin och treonin, de som fosforylerar tyrosin och några som kan fosforylera båda, såsom MAP2K-och GSK-familjerna. Termen användes först 2002 av Gerard Manning och kollegor i tvillingpapper som analyserade 518 humana proteinkinaser och hänvisar till både proteinkinaser och proteinpseudokinaser och deras utveckling av proteinkinaser i hela eukaryoterna. Andra kinomer har bestämts för ris, flera svampar, nematoder och insekter, sjöborrar, Dictyostelium discoideum och infektionsprocessen med Mycobacterium tuberculosis. Även om den primära sekvensen av proteinkinaser visar väsentlig divergens mellan orelaterade eukaryoter, och aminosyraskillnader i katalytiska motiv har tillåtit deras separation av kinomer i kanoniska och pseudokinas subtyper, variationen som finns i aminosyramotiven intill platsen för faktisk fosforylering av substrat med eukaryota kinaser är mycket mindre.

eftersom kinaser är ett viktigt läkemedelsmål och en viktig kontrollpunkt i cellbeteende har kinomen också varit målet för storskalig funktionell genomik med RNAi-skärmar och för läkemedelsupptäcktsinsatser, särskilt i cancerterapi.

hos djur innehåller kinomen kinaser som fosforylerar endast tyrosin (tyrosinkinaser), de som verkar på serin eller treonin och några klasser, såsom GSK3 och MAP2K som kan verka på båda. Forskning har visat att det finns specialiserade proteindomäner som binder till fosforylerade serin-och treoninrester, såsom BRCA-och FHA-domäner.

Lämna ett svar

Din e-postadress kommer inte publiceras.