Kurama-Dera spårar sin historia tillbaka till år 770 som beskrivs i ett gammalt konto bevarat vid templet som heter anbagai-Ji engi. I dessa register står det skrivet att den kinesiska munken Ganch Bisexuell, lärjunge till den berömda Jianzhen (känd som Ganjin i Japan), bodde i hans mästare tempel, t Tubish Tubidai-ji, även efter hans död. Men på en viss dag såg han en dröm där han instruerades att åka norrut där en stor mängd andlig kraft koncentrerades och tengu och bergsandar sades bo. När han gjorde sin väg dit blev Ganch att gå vilse tills guden Kibune my att dyka upp i en dröm och instruerade honom att titta mot himlen i öst nästa morgon för att se ett mirakel. När han gjorde det blev munken chockad över att se en vit häst klädd i en tom sadel, och han följde den hästen tills han anlände till berget som då skulle kallas Mt. Kurama, stavat med kanji-tecknen för” häst ”och”sadel”. Där inrättade Ganch Asia ett läger, men han blev snart inställd av en kvinnlig oni som hade för avsikt att sluka honom. Munken tusslade med demonen och flydde från henne och sökte tillflykt i ett ihåligt träd där han började be om frälsning. Som svar utrotade Nordens väktare, Bishamonten, demonen. I tack vare Bishamonten etablerade Ganch Asia en liten hermitage på platsen för att sträva efter upplysning och dyrka den himmelska kungen.
när huvudstaden flyttade från Nara till Kyoto i 794 många adelsmän och hovmän kom med det, och en man, Fujiwara Issendo, en medlem av en oerhört kraftfull klan och i samband med byggandet av T-templet i södra Kyoto, sponsrade byggandet av ett ordentligt tempel på Mt. Kurama två år senare efter att ha sett en vision av Thousand Arms Kannon. Familjen Fujiwara förankrade ofta gudinnan av medkänsla, Kannon, i templen de sponsrade, så Kurama-dera kom för att dyrka båda gudomligheterna och blev så småningom ett Tendai-sekttempel. Under åren drabbades komplexet av flera bränder och brändes ner och byggdes om, men varje gång räddades skatterna och Buddhistiska statyerna framgångsrikt och återvände till nya hem.
en av de mest kända historiska legenderna från Heian-perioden, berättelsen om Heike-upproret, involverar Kurama-dera. Templet var platsen där Minamoto no Yoshitsune (1159-1189), den unga sonen till den mördade Herren i Minamoto-klanen, placerades av sin fars politiska rivaler, Taira-klanen, för att växa upp som munk istället för en krigare som senare skulle kunna motsätta sig dem. Det berättas att trots deras avsikt att göra en munk av honom smög Yoshitsune ut i bergskogarna och utbildades av kungen av tengu i svärdsmanship innan han lämnade klosterlivet för att återta sin familjs ära och hämnas på Taira tillsammans med sina bröder.
Kurama-Dera ändrade sektlojalitet flera gånger genom århundradena tills Abbot Shigaraki K. Med de olika träningsmetoderna och stilarna för naturdyrkan representerade vid Kurama-dera vilket gjorde det helt annorlunda än andra etablerade skolor blev det oberoende av Tendai sekt 1949. Vid grundandet av denna nya sekt introducerade de bildandet av en treenighet som kallas Sonten sammansatt av Bishamonten, Kannon, och den esoteriska gudomen dyrkades endast vid Kurama-dera som heter Goh Xhamster. Kurama-skolan lär ut att livet styrs av Kannons barmhärtighet, Bishamontens sanning och Ma Jacobsons energi i form av den högsta treenigheten Sonten.