en uppblåsbar Julgrandräkt som bärs på sjukhuset den Dec. 25 kan delvis vara skylden för virusets snabba spridning den dagen, eftersom dess fläkt kan ha cirkulerat COVID-partiklar i luften.
” det var verkligen ett ovanligt utbrott med många sjukdomar, och det verkade sprida sig ganska snabbt,” sa Cody. ”Vi försöker förstå om funktionerna i det utbrottet beror på denna variant: Uppträder denna variant av viruset på något annat sätt, eller har det att göra med andra faktorer som fanns på sjukhuset? Så det är frågan om dagen. Vi har faktiskt ett team med kollegor både från California Department of Public Health och Centers for Disease Control som hjälper oss att försöka lista ut det.”
Santa Clara County har sekvenserat ett stort antal positiva exemplar som samlats in från gemenskapens testplatser och utbrott i länet. ”Vi i Santa Clara County har gjort mer utseende och därmed mer upptäckt,” förklarade Cody på presskonferensen.
”det faktum att denna variant identifierades i flera stora utbrott i vårt län är en röd flagga och måste undersökas ytterligare”, sa Cody i ett uttalande. ”Detta virus fortsätter att mutera och anpassa sig, och vi kan inte svika vår vakt. Denna nyhet understryker behovet av att alla följer alla förebyggande åtgärder och vaccineras så snart de erbjuds vaccinet.”
denna variant-som först identifierades förra året i andra länder och stater, inklusive Kalifornien-är annorlunda än B. 1.1.7-varianten som först upptäcktes i Storbritannien. Eftersom antalet prover som testats för att övervaka variantstammar har ökat vid Kaliforniens laboratorier, inklusive UCSF, har 452r-varianten identifierats oftare sedan November, sade tjänstemän från California Department of Public Health, Santa Clara County och University of California San Francisco.
under en månad har varianten ökat från 3.8 procent av fallen i Kalifornien till 25, 2 procent, förklarade Dr.Charles Chiu, UCSF-virolog och professor i laboratoriemedicin, på presskonferensen. Chiu har sekvenserat fall från flera län över hela staten under de senaste månaderna som en del av statens SARS-CoV-2-initiativ för helgenomsekvensering som kallas COVIDNet.
”vi sekvenserar prover från San Francisco”, Sa Chiu på presskonferensen. ”Jag har diskuterat med San Francisco Department of Public Health för att göra kanske mer systematisk övervakning, men i första hand har vi sekvenserat genom från både inpatienter och polikliniker vid UCSF sjukhus och kliniker, och ungefär proportionerna är desamma. Från och med November såg vi färre än 5 procent av fallen i San Francisco, men nu ser vi ungefär en fjärdedel av infektionerna, som för två veckor sedan, verkar vara denna variant.”
utanför Bay Area har l452r-varianten upptäckts i Humboldt, Lake, Los Angeles, Mono, Orange, Riverside, San Bernardino, San Diego och San Luis Obispo län. Eftersom genomisk sekvensering inte görs lika över hela staten eller landet, är det för tidigt att veta hur utbredd 452-varianten är statewide, nationellt eller globalt, sade tjänstemän.
”denna variant bär tre mutationer, inklusive L452R, i spikproteinet, som viruset använder för att fästa vid och komma in i celler, och är målet för de två vaccinerna som för närvarande finns i USA”, sa Chiu i ett uttalande. ”Nu när vi vet att denna variant ökar i våra lokala samhällen prioriterar vi den för studier. Forskare vid UCSF och på andra håll kommer nu att kunna utföra de kritiska laboratorieexperimenten för att avgöra om detta virus är mer infektiöst eller påverkar vaccinprestanda.”
CDPH har samarbetat med lokala folkhälsolaboratorier, diagnostiska laboratorier, Chan Zuckerberg Biohub, Invitae Corporation, UCSF och Scripps Research Institute för att bilda COVIDNet, ett nätverk av laboratorier som arbetar för att genomföra genomsekvensering av SARS-CoV-2 i staten för att förstå överföring och utveckling av viruset.
Chiu sa att l452r-varianten är” inte en helt ny variant”, och det första fallet i Kalifornien beskrevs i Alameda County i Maj. ”Det första fallet i världen var i Danmark i mars”, sa han. ”Så det här är en variant som har funnits, men det har varit väldigt sällsynt fram till November.”
ytterligare forskning måste göras angående variantens överförbarhet, sade Chiu.
” vi vet inte om det är mer smittsamt än,” sa han. ”Men med tanke på att det nu är ungefär en fjärdedel av de fall som vi ser i Kalifornien, kanske ännu mer för närvarande, handlar det om att det potentiellt kan vara mer smittsamt.”
tidiga laboratoriedata antyder platsen för denna mutation av varianten på SARS-CoV-2: s kritiska spikprotein kan påverka hur väl neutraliserande antikroppar binder till viruset, vilket kan påverka effekten av COVID-19-vacciner, sa Chiu. Liknande studier görs på Brittiska, sydafrikanska och brasilianska varianter av viruset.
” det är viktigt att förstå att viruset kan bete sig på ett sätt i laboratoriet och har vissa funktioner, men det kan bete sig på ett helt annat sätt i verkliga livet, ” Cody sa. ”Jag kan tänka mig att det också är något som våra kollegor inom vaccintillverkning också tittar på när de studerar dessa varianter. Jag vill se till att takeaway inte är att vi behöver börja oroa oss för detta. Jag tror att takeaway är att det här är en variant som blir allt vanligare, och vi måste luta oss in och förstå mer om det.”
Cody sa att det ännu inte finns någon indikation på att denna variant resulterar i allvarligare symtom. ”Vi har inga signaler vid denna tidpunkt att denna variation är förknippad med något annat som ökad svårighetsgrad av sjukdom, även om vi naturligtvis verkligen letar efter några signaler för att se om det skulle dyka upp”, sa hon.
på grund av den pågående ökningen av COVID-19-fall och sjukhusvistelser ber CDPH kalifornierna att fortsätta vidta åtgärder som begränsar överföringen av viruset och minskar belastningen på våra hälsovårdssystem. Detta inkluderar att stanna hemma förutom viktiga aktiviteter, bära en mask när du lämnar hemmet, begränsa interaktioner med människor utanför ditt omedelbara hushåll, hålla fysiskt avstånd på minst 6 fot från varandra, tvätta handen i 20 sekunder och få COVID-19-vaccinet om du är berättigad och vaccinet finns tillgängligt i ditt område.
”det är vanligt att identifiera varianter av virus som SARS-CoV-2, och vi arbetar med våra federala, lokala och universitetspartner för att bättre förstå denna variant och hur den kan påverka kalifornierna”, säger Dr. Erica Pan, Statlig epidemiolog för CDPH. ”Det är för tidigt att veta om denna variant kommer att spridas snabbare än andra, men det förstärker verkligen behovet av alla kalifornier att bära masker och minska blandningen med människor utanför deras omedelbara hushåll för att hjälpa till att sakta spridningen av viruset. Vi uppmanar också alla som har utsatts för viruset att isolera sig från andra för att skydda sig själva och sina nära och kära.”
