Harvard Medical School
Institutionen för Biologisk Kemi och molekylär farmakologi (BCMP)
240 Longwood Ave., Byggnad C2, rum 315-325
Boston, MA 02115
de molekylära mekanismerna för transkriptionsreglering är mycket bevarade bland eukaryoter. Transkriptionsreglering som svar på miljö-och utvecklingsmässiga signaler förmedlas av den kombinatoriska och synergistiska verkan av specifika DNA-bindande aktivatorer och repressorer på komponenter i den allmänna transkriptionsmaskinen och kromatinmodifierande aktiviteter.
mycket av arbetet i detta laboratorium kombinerar genetiska, molekylära och genomiska tillvägagångssätt som finns i jäst för att ta itu med grundläggande frågor om transkriptionella regleringsmekanismer i levande celler. Aktuella projekt inkluderar 1) genetiska experiment för att testa vår trestegsmodell för nukleosompositionering; 2) en systematisk analys av allmänna transkriptionsfaktorer som är involverade i initiering med anchor-away-systemet; 3) en studie av faktorer som är involverade i töjning och nukleosomutarmning vid 3′-ändar; 4) med direkt RNA-sekvensering, en genombredd analys av mRNA-halveringstid och 3′ – end-bildning, 5) användningen av ett funktionellt evolutionärt tillvägagångssätt för att förstå rollerna för olika transkript samt specifika komponenter i transkriptionskoaktivator-och Ko-repressorkomplex och aktivator-och repressorbindningsställen som förmedlar miljösvar.
de transkriptionella regulatoriska kretsarna som är involverade i cellulär transformation är av grundläggande betydelse och naturligtvis direkt relevanta för cancer. Vi använder två isogena modeller (bröstceller och fibroblaster) av mänsklig cancer för att belysa de transkriptionella regulatoriska kretsarna som är involverade i processen för cellulär transformation. Detta innebär mekanistiska experiment på den inflammatoriska återkopplingsslingan och relaterade aspekter av den cellulära transformationsprocessen; hela genomprofiler av mRNA, mikroRNA och transkriptionsfaktorbindningsställen för att ge en integrerad bild av cellulär transformation; och identifiera gener, mikroRNA och regleringsvägar som är involverade i att generera cancerstamceller och mammosfärer. Projekt inkluderar 1) mRNA, miRNA och linc RNA-profilering av sfärer vs. cancerceller i olika typer av cancerceller; 2) ribosomprofilering under cellulär transformation; och 3) storskaliga ChIP-Seq-experiment för att bestämma transkriptionsfaktorernas roll i transformation. Slutligen, efter att ha upptäckt att diabetesläkemedlet metformin selektivt dödar cancerstamceller, undersöker vi mekanismen för metforminverkan och dess potential för förebyggande och behandling av cancer.
