John Bitters erste berufliche Musikerfahrungen waren als Dirigent des Jacksonville Symphony Orchestra (1934-1937) und als Dirigent des Florida Federal Symphony Orchestra (1937-1939). Er war auch stellvertretender Dirigent von Leopold Stokowskis All American Youth Orchestra (1940-1941).
Anschließend war er von 1940 bis 1942 Dirigent des University of Miami Symphony Orchestra, trat 1943 während des Zweiten Weltkriegs in die US-Armee ein und diente fünf Jahre lang als Geheimdienstoffizier bei der Neunten Armee. Er blieb nach dem Krieg in Berlin und unterstützte die kulturellen Umerziehungsbemühungen der USA als Supervisor der Information Control Division (ICD) der amerikanischen Militärregierung und Militärlizenzinhaber für die Berliner Philharmoniker. Zwischen 1945 und 1948 dirigierte er 30 Mal die Berliner Philharmoniker und war Gastdirigent der Dresdner Symphoniker und der Hamburger Philharmoniker.
Er ließ sich scheiden und heiratete 1947 die in England geborene Barbara Buttery Pinion (1918-2013), eine Forschungsanalytikerin der WRAF und eine Dokumentenanalytikerin während der Nürnberger Prozesse (1945-1946). Eine Tochter, Simonetta Bitter, wurde 1950 in Florenz, Italien, geboren.
Die Familie Barbara und John Bitter zog 1950 nach Miami, Florida, als er zum Dekan der University of Miami School of Music (2003 in Frost School of Music umbenannt) und Musikdirektor und Dirigent des University of Miami Symphony Orchestra ernannt wurde. Eine Tochter Noel Lesley Bitter wurde 1952 in Miami geboren und eine dritte Tochter Marietta Barbara Bitter wurde 1957 geboren.
Bitter dirigierte das University of Miami Symphony Orchestra für 13 Spielzeiten mit Abonnenten sowohl im Miami Beach Municipal Auditorium als auch im Dade County Auditorium. Zu den Konzerten gehörten prominente Gastsolisten des Tages, darunter der Geiger Yehudi Menuhin, der Cellist Leonard Rose, die Sopranistin Beverly Sills und die Pianistin Gina Bachauer. Er lud auch einen stetigen Strom von Gastdirigenten ein, darunter Igor Strawinsky, Heitor Villa-Lobos, Andre Kostelanetz und Arthur Fiedler. University of Miami Musik Fakultät und Studenten im Orchester durchgeführt.
1950 gründete er auch eine jahrzehntelange Miami Beach Summer Pops Concerts-Reihe, die vom Summer Symphony Orchestra der University of Miami im Miami Beach Auditorium präsentiert wurde. Auf dem Programm standen Gastdirigenten wie Paul Whiteman und Skitch Henderson, und Bitter dirigierte Konzerte mit Solisten wie dem kubanischen Pianisten Jorge Bolet.
Bitter dirigierte auch in den Sommermonaten an Orten wie dem Brevard Music Center in Asheville, North Carolina.
