Abstrakt
selv om pattedyr genomer er diploide, tidligere studier grundig undersøkt gjennomsnittlig kromatin arkitekturer uten å vurdere forskjellene mellom homologe kromosomer. Vi genererte Hi-C, ChIP-seq og RNA-seq datasett FRA CD4 T-celler Av B6, Cast og hybridmus, for å undersøke diploid kromatinorganisasjon og epigenetisk regulering. Våre data indikerer at inter-kromosomale interaksjonsmønstre mellom homologe kromosomer er like, og likheten er sterkt korrelert med deres alleliske coexpression nivåer. Rekonstruksjon AV 3d-kjernen viste at avstander av de homologe kromosomene til sentrum av kjernen er nesten det samme. Inter-kromosomale interaksjoner ved sentromere ender er betydelig svakere enn de ved telomere ender, noe som tyder på at de befinner seg i forskjellige regioner innenfor kromosom territorier. Flertallet Av A / B-rom eller topologisk tilknyttede domener (TADs) er konsistente Mellom B6 og Cast. Vi fant at 58% av haploidene i hybrider opprettholder foreldrenes romstatus Ved B6 / Cast divergerende rom på grunn av cis-effekt. Omtrent 95% Av de transgjennomførte b6 / Cast divergerende rom konvergerer til samme romstatus potensielt på grunn av et delt cellulært miljø. Vi viste differensielt uttrykte gener mellom de to haploider i hybrid var assosiert med enten genetiske eller epigenetiske effekter. Oppsummert ga våre multi-omics-data fra hybridmusene haploid-spesifikk informasjon OM 3d-atomarkitekturen og en rik ressurs for videre forståelse av epigenetisk regulering av haploid-spesifikt genuttrykk.
