Samuel Jenness, PhD

olen tartuntatautien epidemiologi, joka on erikoistunut matemaattisiin ja laskennallisiin lähestymistapoihin tartuntatautien ajurien ja ehkäisystrategioiden tutkimiseen dynaamisten siirtoverkkojen avulla.

Emoryn yliopiston Rollins School of Public Healthin epidemiologian laitoksen apulaisprofessorina johdan EpiModel-tutkimuslaboratoriota ja teen myös yhteistyötä useissa tartuntatautien epidemiologian menetelmiin ja sovelluksiin liittyvissä hankkeissa.

tutkimusintressit

metodologinen tutkimukseni keskittyy avoimen ohjelmistoalustan, Epimodelin, kehittämiseen, jonka avulla käyttäjät voivat rakentaa, simuloida ja analysoida monimutkaisia mekanistisia malleja mielivaltaisesti määriteltyjen tartuntatautijärjestelmien siirtämiseksi. EpiModel tarjoaa tehokkaan työkalupakin dynaamisten kontaktiverkostojen mallintamiseen, jotka ovat usein olennaisia suoraa kontaktia vaativien sairauksien leviämisen esittämiseen. Epimodelia on käytetty yli 50 tieteellisessä julkaisussa, sekä ryhmäni että mallinnustutkijoiden toimesta ympäri maailmaa!

soveltava tutkimukseni keskittyy HIV: n, sukupuoliteitse tarttuvien infektioiden ja muiden tartuntatautien epidemiologiaan. Olen kiinnostunut siitä, miten voimme käyttää mekanistisia mallinnus-ja verkostotiedekehyksiä näiden sairauksien ajurien ymmärtämiseen sekä tehokkaiden ehkäisystrategioiden suunnitteluun ja arviointiin. Viimeaikaisissa hakemuksissa on käytetty malleja, joilla on simuloitu useiden samanaikaisesti kiertävien patogeenien rinnakkaiskiertoa samassa populaatiossa, koska riskitekijät yhden taudin saamiselle voivat riippua muiden samassa kontaktiverkossa tarttuvien infektioiden epidemiadynamiikasta.

laajemmin EpiModel – Tutkimuslaboratoriossani käsitellään näitä kysymyksiä seuraavilla aloilla tehtävän tutkimuksen avulla:

  • tartuntatautien epidemiologia
  • infektiotautien mekanistinen/matemaattinen mallinnus
  • Verkostotiede
  • epidemiologian syy-seurausmenetelmät
  • tutkimuksen suunnittelu ja analyysi
  • laskennallinen epidemiologia & tieteellinen ohjelmistokehitys

tuen ja ohjaan aktiivisesti tohtoriopiskelijoita, tohtoriopiskelijoita ja tutkimushenkilöstöä, jotka työskentelevät kanssani näillä aloilla.

Uutiset

2020

2020-11-15

Uusi paperi julkaistu AIDS: mallinnus integroitu HIV ehkäisy ja hoito jatkumo saavuttaa lopettaa HIV epidemia tavoitteet

2020-09-30

Uusi ennakkopainos medrxivissä: ennustettu HIV: n ja bakteerien STI: n ilmaantuvuus COVID-tautiin liittyvän seksuaalisen etääntymisen ja kliinisen Palvelukatkoksen jälkeen

2020-09-03

Kevin Maloneyn johtama uusi paperi julkaistiin Journal of Infectious Diseases-lehdessä: Samanaikaisesti saatavilla olevan pitkävaikutteisen Injisoitavan ja päivittäisen suun kautta otettavan HIV-estohoidon ennustettu vaikutus

2020-09-30

Medrxiv: N Uusi ennakkopainos: SARS-CoV-2-ohjauksen dynaamisten Verkostostrategioiden mallintaminen risteilyaluksella

2020-07-23

Uusi paperi johti Christina Chandra julkaistu Clinical Infectious Diseases: Miesten kanssa seksiä PrEP-hoidon aikana harrastavien Miesten Seksitartuntojen seulonnassa puutteita Yhdysvalloissa

2020-07-01

Kristin Nelsonin johtama uusi tutkimus julkaistiin American Journal of Epidemiology: Modeling Missing Cases and Transmission Links in Networks of largely Drug-resistent Tuberculosis in KwaZulu-Natal, South Africa

2020-03-01

Uusi paperi johti Kevin Weiss julkaistu JAIDS: Arvioitu määrä miehiä, jotka harrastavat seksiä miesten kanssa, joilla on viitteitä HIV – altistusta edeltävästä Estolääkityksestä kansallisessa Seksuaaliverkostotutkimuksessa

2020-03-01

New paper led by Stephen Uong published in Epidemiology: Assessing the Validity of Sexual Network Degree among Men Who Have Sex with Men using Prospective Cohort Data

2020-01-24

Uusi paperi johti Kevin Weiss julkaistu Epidemics: itsekeskeinen seksuaalinen verkostot miesten kanssa seksiä Yhdysvalloissa: Artnetin tutkimuksen tulokset

2019

2019-11-01

Uusi paperi johti Kevin Weiss julkaistu sexual Transmitted Diseases: Epidemiological Impact of Expedited Partner Therapy for Men Who Have Sex with Men: a Modeling Study

2019-10-25

Uusi paperi johti Kevin Weiss julkaistu Open Forum Infectious Diseases: Optimoimalla kattavuus vs. taajuus sukupuoliteitse tarttuvien infektioiden seulonta miesten, jotka harrastavat seksiä miesten kanssa

2019-06-07

Jeb Jonesin johtama new paper published in Sexuate Transmitted Diseases: intercepted HIV-tapausten osuus miehistä, jotka harrastavat seksiä miesten kanssa tippurin ja klamydian vuoksi: a Modeling Analysis.

2018

2018-10-11

Uusi paperi julkaistu American Journal of Epidemiology: Puututaan puutteisiin HIV: n altistusta edeltävässä ennaltaehkäisevässä hoidossa, jotta voidaan vähentää rotujen välisiä eroja HIV: n esiintyvyydessä Yhdysvalloissa.

2018-07-29

new paper published in sexual Transmitted Diseases: Bacterial STI Screening Rates by symptomaattinen Status among Men Who Have Sex with Men in the United States: a Hierarchical Bayesian Analysis.

2018-07-12

nih/NIAID (R01 AI138783) antoi uuden merkittävän tutkimusrahoituksen (ensimmäinen R01-rahoitukseni PI: nä) hankkeelle, jonka tarkoituksena on kehittää ja laajentaa EpiModel-alustaa vastaamaan seuraavan sukupolven tärkeisiin HIV/STI-ennaltaehkäisyyn liittyviin tieteellisiin kysymyksiin.

2018-06-18

New commentary published in Clinical Infectious Diseases:Moving Forward with Treatment of Gonorrhea for Users of Human Immunodeficiency Virus Preexposure profylaksia Given the Threat of Antimicrobial Resistance.

2018-04-20

New paper published in the Journal of Statistical Software: EpiModel: An R Package for Mathematical Modeling of Infectious Disease over Networks.

2017

2017-09-01

New paper published in Clinical Infectious Diseases: Incidence of Gonorrhea and Chlamydia Following Human Immunodeficiency Virus Preexposure profylaksia Among Men Who Have Sex with Men: a Modeling Study.

2017-02-15

sain ensimmäisen nih-rahoitukseni PI: nä (R21 MH112449) uuteen tutkimukseen, jossa kerätään kansallinen näyte verkostopohjaisista tiedoista MSM: stä HIV/STI-transmission dynamiikan ja ennaltaehkäisymahdollisuuksien paikalliseen mallintamiseen.

2017-01-06

PLoS One: Individual HIV Risk versus Population Impact of Risk Compensation after HIV Preexposure profylaksia Initiation among Men Who Have Sex with Men.

2016

2016-12-01

Journal of Infectious Disease issue with our HIV PrEP model julkaistiin joulukuun 15 numerossa,ja esillä taidetta meidän tutkimuksen kannessa numero.

2016-09-01

aloitti uuden kuulumisen Northwestern Center for Prevention Implementation Methodology (CePIM) varhaisessa vaiheessa tutkija, rahoitusta tehdä verkko-ja täytäntöönpano tieteen tutkimusta seuraavien 5 vuoden aikana.

2016-07-14

new paper published in the Journal of Infectious Diseases: Impact of the Centers for Disease Control ’ s HIV Preexposure profylaksia Guidelines for Men Who Have Sex with Men in the United States

2016-06-13

new paper published in the journal sexual Transmitted Infections: Effectiveness of combination packages for HIV-1 prevention in subsharan Africa depends on partnership network structure: a mathematical modelling study

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista.