Les premières nominations musicales professionnelles de John Bitter furent en tant que chef de l’Orchestre symphonique de Jacksonville (1934-1937) et chef de l’Orchestre symphonique fédéral de Floride (1937-1939). Il a également été chef associé de l’All American Youth Orchestra de Leopold Stokowski (1940-1941).
Il a ensuite servi comme chef d’orchestre de l’Orchestre symphonique de l’Université de Miami de 1940 à 1942, puis s’est enrôlé dans l’Armée américaine pendant la Seconde Guerre mondiale en 1943 et a servi pendant cinq ans comme officier de renseignement dans la Neuvième Armée. Après la guerre, il est resté à Berlin et a aidé aux efforts de rééducation culturelle des États-Unis en tant que superviseur de la Division du contrôle de l’information du Gouvernement militaire américain (ICD) et titulaire de la licence militaire de l’Orchestre philharmonique de Berlin. Il a également dirigé l’Orchestre philharmonique de Berlin 30 fois entre 1945 et 1948, et a été chef invité de l’Orchestre symphonique de Dresde et de l’Orchestre philharmonique de Hambourg.
Il divorce et épouse en 1947 Barbara Buttery Pinion (1918-2013), née en Angleterre, analyste de recherche pour la WRAF et analyste de documents lors des procès de Nuremberg (1945-1946). Une fille Robin Simonetta Bitter est née à Florence, en Italie, en 1950.
La famille Barbara et John Bitter déménagent à Miami, en Floride, en 1950, lorsqu’il est nommé doyen de l’École de musique de l’Université de Miami (rebaptisée Frost School of Music en 2003) et directeur musical et chef d’orchestre de l’Orchestre symphonique de l’Université de Miami. Une fille Noel Lesley Bitter est née à Miami en 1952 et une troisième fille Marietta Barbara Bitter est née en 1957.
Bitter a dirigé l’Orchestre symphonique de l’Université de Miami pendant 13 saisons avec des abonnés à l’Auditorium municipal de Miami Beach et à l’Auditorium du comté de Dade. Les concerts comprenaient des solistes invités de premier plan de l’époque, notamment le violoniste Yehudi Menuhin, le violoncelliste Leonard Rose, la soprano Beverly Sills et la pianiste Gina Bachauer. Il a également invité un flux constant de chefs invités, notamment Igor Stravinsky, Heitor Villa-Lobos, André Kostelanetz et Arthur Fiedler. Les professeurs de musique et les étudiants de l’Université de Miami se sont produits dans l’orchestre.
En 1950, il a également créé une série de concerts Pop d’été de Miami Beach d’une décennie présentée par l’Orchestre symphonique d’été de l’Université de Miami à l’Auditorium de Miami Beach. Sa programmation comprenait des chefs invités tels que Paul Whiteman et Skitch Henderson, et Bitter a dirigé des concerts avec des solistes tels que le pianiste cubain Jorge Bolet.
Bitter a également dirigé pendant les mois d’été dans des lieux tels que le Brevard Music Center à Asheville, en Caroline du Nord.