Haplogroup L2 (mtDNA)

L2 har fem hovedundergrupper: L2a, L2b, L2c, L2d og L2e. av disse linjene er Den vanligste underklassen L2a, som finnes i Både Afrika og Levanten.

Haplogruppe L2 har blitt observert blant prøvene på øya kirkegården I Kulubnarti, Sudan, som dateres Fra Tidlig Kristen periode (AD 550-800).

Haplogruppe L2aEdit

L2a er utbredt I Afrika og den vanligste Og mest utbredte Afrikanske Haplogruppen sør For Sahara, og er også noe hyppig på 19% I Amerika blant etterkommere Av Afrikanere (Salas et al., 2002). L2a har en mulig opprinnelsesdato ca. 48 000 YBP.

Det er spesielt rikelig i Tsjad (38% av prøven; 33% udifferensierte L2 blant Tsjad-Arabere,), Og I ikke-Bantu-befolkninger I Øst-Afrika (Kenya, Uganda og Tanzania) på 38%. Ca 33% I Mosambik og 32% I Ghana.

denne underklassen er karakterisert ved mutasjoner ved 2789, 7175, 7274, 7771, 11914, 13803, 14566 og 16294. Den representerer 52% Av den totale L2 og er den eneste underklassen Av L2 som er utbredt over Hele Afrika.

den brede fordelingen Av L2a og mangfold gjør det vanskelig å identifisere en geografisk opprinnelse. Hovedpuslespillet er den nesten allestedsnærværende Haplogruppen L2a, som kan ha spredt Seg Øst og Vest langs Sahel-Korridoren i Nord-Afrika etter Den Siste Istiden, Eller opprinnelsen til disse utvidelsene kan ligge tidligere, ved begynnelsen Av Den Senere Steinalderen ∼ for 40.000 år siden.

I Øst-Afrika L2a ble funnet 15% I Nildalen-Nubia, 5% Av Egypterne, 14% Av Kusjittiske høyttalere, 15% Av Semittiske Amhara folk, 10% Av Gurage, 6% Av Tigray-Tigrinya folk, 13% Av Etiopiere og 5% Av Jemenitter.

haplogruppe L2a vises også I Nord-Afrika, med den høyeste frekvensen 20% Tuareg, Fulani (14%). Funnet også blant Noen Algerie Arabere, er det funnet på 10% Blant Marokkanske Arabere, Noen Marokkanske Berbere og Tunisiske Berbere. (watson 1997) et al., (vigilant 1991) et al. 1991.

hos pasienter som får stavudin for Å behandle HIV, er Haplogruppe L2a forbundet med en lavere sannsynlighet for perifer nevropati som en bivirkning.

Haplogruppe L2a1Edit

L2a kan videre deles Inn I L2a1, husing overgangen på 16309 (Salas et al. 2002).

denne underklassen observeres ved varierende frekvenser I Vest-Afrika blant Malinke, Wolof og andre; Blant Nordafrikanere; I Sahel blant Hausa, Fulbe og andre; I Sentral-Afrika blant Bamileke, Fali og andre; I Sør-Afrika blant Khoisan-familien, inkludert Khwe-og Bantu-høyttalere; Og I Øst-Afrika blant Kikuyu fra Kenya.

Alle L2-klader som finnes I Etiopia er hovedsakelig avledet Fra De to subkladene, L2a1 Og L2b. L2a1 er definert ved mutasjoner ved 12693, 15784 og 16309. De Fleste etiopiske l2a1-sekvenser deler mutasjoner ved nps 16189 og 16309. Imidlertid, mens flertallet (26 av 33) Afroamerikanere deler Haplogruppe L2a komplette sekvenser, kan deles inn i fire underklasser ved substitusjoner ved nps L2a1e-3495, L2a1a-3918, L2a1f-5581 og L2a1i-15229. Ingen av disse sekvensene ble observert I Etiopiske 16309 L2a1-prøver. (Salas 2002) et al.

Haplogruppe L2a1 har også blitt observert blant Mahra (4,6%).

Haplogruppe L2a1 har blitt funnet i gamle fossiler assosiert Med Pre-Keramikk Neolittisk kultur På Tell Halula, Syria. En prøve utgravd På Savannen Pastorale Neolittiske området Luxmanda I Tanzania også gjennomført L2a1 clade. Blanding clustering analyse videre indikerte at den enkelte fødte betydelig herkomst fra den gamle Levanten, bekrefter forfedrenes bånd mellom skaperne Av Savannen Pastorale Neolittisk og Pre-Keramikk Neolittisk.

Haplogruppe L2a1aEdit

Underklasse L2a1a er definert ved substitusjoner ved 3918, 5285, 15244 og 15629. Det er to L2a-klynger som er godt representert i sørøstlige Afrikanere, L2a1a og L2a1b, begge definert av overganger ved ganske stabile HVS – i-stillinger. Begge disse synes å ha en opprinnelse I Vest-Afrika eller Nordvest-Afrika (som indikert ved fordelingen av tilsvarende eller nabotyper), og å ha gjennomgått dramatisk ekspansjon enten I Sørøst-Afrika eller i en befolkning som er nedarvet til dagens Sørøstlige Afrikanere.

de aller siste starbursts I subclades L2a1a og L2a2 foreslå en signatur For bantu utvidelser, som også foreslått Av Pereira et al. (2001).

L2a1a er definert av en mutasjon ved 16286. L2a1a grunnlegger kandidat dateres til 2,700 (SE 1,200) år siden. (Pereira et al. 2001). Men L2a1a, som definert ved en substitusjon ved (np 16286) (Salas et al. 2002), støttes nå av en kodingsregionsmarkør (np 3918) (fig. 2A) og ble funnet i fire av seks Jemenittiske L2a1 linjer. L2a1a forekommer på sitt høyeste frekvens I Sørøst-Afrika (Pereira et al. 2001; Salas et al. 2002). Både den hyppige grunnleggeren haplotype og avledede linjer (med 16092 mutasjon) funnet blant Jemenitter har eksakte treff innenfor Mosambik sekvenser (Pereira et al. 2001; Salas et al. 2002). L2a1a forekommer også med mindre frekvens I Nordvest-Afrika, blant Maure Og Bambara I Mali og Mauritania. (Rando et al. 1998; Maca-Meyer et al. 2003)

Haplogruppe L2a1a1Edit

L2a1a1 er definert av markører 6152C, 15391T, 16368C

Haplogruppe L2a1bEdit

L2a1b er definert ved substitusjoner ved 16189 og 10143. 16192 er også vanlig I L2a1b Og L2a1c; det vises I Nord-Afrika I Egypt, det vises Også I Sørøst-Afrika, og det kan også være en markør for bantu-utvidelsen.

Haplogruppe L2a1cEdit

L2a1c deler ofte mutasjon 16189 med L2a1b, men har egne markører på 3010 og 6663. 16192 er også vanlig I L2a1b Og L2a1c; det vises I Sørøst-Afrika så Vel Som Øst-Afrika. Dette antyder noe diversifisering av denne clade in situ.

Posisjoner T16209C C16301T C16354T på Toppen Av L2a1 definere en liten sub-clade, kalt L2a1c Av Kivisild et al. (2004, Figur 3) (Se Også Figur 6 I Salas et al. 2002), som hovedsakelig forekommer I Øst-Afrika (For Eksempel Sudan, Nubia, Etiopia), Blant Turkana og Vest-Afrika (For Eksempel Kanuri).

i Tsjadbassenget ble det identifisert fire Forskjellige L2a1c-typer ett eller to mutasjonelle trinn fra Øst-og Vestafrikanske typer. (Kivisild et al.) 2004. (sitat på side.9 eller 443)

Haplogruppe L2a1c1Edit

L2a1c1 har en nordafrikansk opprinnelse. Det er definert av markører 198, 930, 3308, 8604, 16086. Det er observert I Tunisia Sefardiske, Ashkenazi, Jøder, Hebreere, Marokkanere, Egyptere, Nubiere og Jemenitter.

Haplogruppe L2a1f

Khosian, Zambia, Madagaskar

Haplogruppe L2a1kEdit

L2a1k er definert av markørene G6722A OG T12903C. Det ble tidligere beskrevet Som En europeisk-spesifikk underklasse L2a1a og oppdaget I Tsjekkere og Slovaker.

Haplogruppe L2a1l2aEdit

L2a1l2a er anerkjent som En» Ashkenazi-spesifikk » Haplogruppe, sett blant Ashkenazi-Jøder med opphav I Sentral-Og Øst-Europa. Det har også blitt påvist i små tall i tilsynelatende ikke-Jødiske polske befolkninger, hvor det antas å ha kommet fra Ashkenazi blanding. Imidlertid utgjør denne haplotypen bare en svært liten andel Av Ashkenazi mitokondriell linje; ulike studier (inkludert Behars) har satt forekomsten på mellom 1,4-1,6%.

Haplogruppe L2a2Edit

L2a2 er karakteristisk For Mbuti-Pygmeene.

Haplogruppe L2b ‘cedit

L2b’ c utviklet seg sannsynligvis rundt 62 000 år siden.

Haplogruppe L2bEdit

denne underklassen er hovedsakelig funnet I Vest-Afrika, men den er spredt Over Hele Afrika.

Haplogruppe L2cEdit

L2c er hyppigst i Vest-Afrika, og kan ha oppstått der. Spesielt til Stede i Senegal på 39%, Kapp Verde 16% og Guinea-Bissau 16%.

Haplogruppe L2dEdit

L2d er hyppigst i Vest-Afrika, hvor Den kan ha oppstått. Den finnes også I Jemen, Mosambik og Sudan.

Haplogruppe L2eEdit

L2e (tidligere L2d2) er typisk I Vest-Afrika. Det er også funnet i Tunisia, Og Blant Mandinka folk Fra Guinea-Bissau og Afroamerikanere.