Nel 2011, Khavari si è dimesso dalla sua posizione presso Bank Melli tra le accuse di essere coinvolto nello scandalo di appropriazione indebita iraniano di circa 2,6 miliardi di dollari. Lo scandalo riguardava l’utilizzo di documenti falsi per acquistare fraudolentemente beni che includevano importanti società statali; la Banca Melli, che Khavari guidava come presidente del consiglio e amministratore delegato, era accusata di facilitare pagamenti fraudolenti. Khavari poco dopo è andato nel Regno Unito per partecipare a una riunione presso la Lloyd Bank e ha annunciato le sue dimissioni inviandole via fax ai funzionari iraniani martedì 27 settembre 2011.
Nella sua lettera di dimissioni, Khavari ha implicato un’altra banca come fonte della frode e ha affermato che si stava dimettendo per “rispettare l’opinione pubblica”, secondo Bloomberg.
Alla fine di settembre, 2011 si è trasferito in Canada, dove ha la cittadinanza. I registri immobiliari di Toronto nel nome di Khavari risalgono al 2001, quando ha stipulato un mutuo per una proprietà di El 615.000 su Elmwood Ave., a North York. Un tempo, Khavari possedeva una società con sede a Toronto chiamata Soaring Properties. Nel tentativo di proteggere il suo capitale dal sequestro, Khavari ha investito nel settore immobiliare di Toronto dando denaro ai suoi figli, Khashayar e Ardavan. Ha anche firmato la sua casa da 3 milioni di dollari a Bridle Path, Toronto verso sua figlia, Parandis Khavari, e trasferito le loro altre due case per essere in nome della signora Khavaris solo. Nonostante le numerose richieste della polizia iraniana, le autorità canadesi non hanno estradato Khavari. Egli può affrontare la pena di morte se condannato dal sistema giudiziario iraniano.
Il 31 ottobre 2011, il membro della Camera dei Comuni del Canada Irwin Cotler ha chiesto un’indagine su come è diventato cittadino canadese.
Nel 2016 Bloomberg ha riferito che Khavari ei suoi figli sono stati attivi nel mercato immobiliare di Toronto anche dopo lo scandalo e dal 2012 al 2016 la famiglia ha acquistato almeno worth 12,1 milioni di proprietà sotto vari nomi e persone giuridiche. Inoltre sono responsabili di circa million 11 milioni da 10 diversi mutui.
Molte delle aziende e istituzioni a cui Khavari è stata associata come Bank Sepah e successivamente Bank Melli sono state sanzionate dal consiglio di sicurezza delle Nazioni Unite e dalla comunità internazionale dal 2007. Il Consiglio di sicurezza delle Nazioni Unite ha inserito nella lista nera la Banca Sepah ai sensi della risoluzione 1747 e ha posto restrizioni alla Melli ai sensi della risoluzione 1803. Secondo l’esperto di sicurezza, Avi Jorisch, Khavari è in violazione delle norme sulle misure economiche speciali (Iran) per aver lavorato e fornito servizi finanziari per conto di un’entità canadese designata. Khavari è anche in violazione della legge anti-terrorismo del Canada, insieme alla Parte II. 1 del Codice penale (Sezione 83.05). Inoltre, ai sensi della Sezione 83.05, le autorità canadesi hanno il diritto di congelare i beni di Khavari. Tuttavia, a partire dal 2016 Khavari non è stato sottoposto ad alcun congelamento dei beni o indagine da parte delle autorità canadesi.
