In 2011 nam Khavari ontslag bij Bank Melli vanwege beschuldigingen dat hij betrokken was bij het Iraanse verduisteringsschandaal van ongeveer 2,6 miljard dollar. Het schandaal betrof het gebruik van vervalste documenten om op frauduleuze wijze activa te kopen die grote staatsbedrijven omvatten; Bank Melli, die Khavari leidde als voorzitter van de Raad van bestuur en managing director, werd beschuldigd van het faciliteren van frauduleuze betalingen. Khavari ging Kort daarna naar het Verenigd Koninkrijk om een vergadering bij te wonen bij Lloyd Bank en kondigde zijn ontslag aan door het te faxen naar Iraanse ambtenaren op dinsdag 27 September 2011.In zijn ontslagbrief beschuldigde Khavari een andere bank als de bron van de fraude en beweerde dat hij ontslag nam om “de publieke opinie te respecteren”, aldus Bloomberg.Eind September 2011 verhuisde hij naar Canada, waar hij staatsburger werd. Toronto property records in Khavari ‘ s naam datum 2001, toen hij nam een hypotheek voor een $ 615,000 eigendom op Elmwood Ave. in North York. Khavari was ooit eigenaar van een in Toronto gevestigd bedrijf genaamd Soaring Properties. In pogingen om zijn kapitaal te beschermen tegen inbeslagname, investeerde Khavari in Toronto onroerend goed door geld te geven aan zijn zonen, Khashayar en Ardavan. Hij tekende ook zijn 3-miljoen dollar huis in Bridle Path, Toronto over aan zijn dochter, Parandis Khavari, en overgedragen hun andere twee huizen te worden in Mevrouw Khavaris naam alleen. Ondanks talrijke verzoeken van de Iraanse politie hebben de Canadese autoriteiten Khavari niet uitgeleverd. Hij kan de doodstraf krijgen als hij door het Iraanse rechtssysteem wordt veroordeeld.Irwin Cotler, lid van het Canadese Lagerhuis, riep op 31 oktober 2011 op tot onderzoek naar hoe hij Canadees staatsburger werd.
in 2016 meldde Bloomberg dat Khavari en zijn zonen zelfs na het schandaal actief waren op de vastgoedmarkt in Toronto en dat de familie van 2012 tot 2016 ten minste $12,1 miljoen aan onroerend goed heeft gekocht onder verschillende namen en rechtspersonen. Bovendien zijn ze verantwoordelijk voor ongeveer $ 11 miljoen van 10 verschillende hypotheken.Veel van de bedrijven en instellingen waarmee Khavari is geassocieerd, zoals Bank Sepah en later Bank Melli, zijn sinds 2007 gesanctioneerd door de VN-Veiligheidsraad en de internationale gemeenschap. De VN-Veiligheidsraad plaatste Bank Sepah op de zwarte lijst bij Resolutie 1747 en legde beperkingen op aan Melli bij Resolutie 1803. Volgens veiligheidsdeskundige Avi Jorisch schendt Khavari de Special Economic Measures (Iran) Regulations voor het werken en verlenen van financiële diensten namens een op de lijst geplaatste Canadese entiteit. Khavari is ook in overtreding van Canada ‘ s Anti-Terrorisme Wet, samen met Deel II. 1 van het wetboek van Strafrecht (Artikel 83.05). Bovendien hebben de Canadese autoriteiten krachtens artikel 83.05 het recht om de activa van Khavari te bevriezen. Sinds 2016 is Khavari echter niet onderworpen aan een bevriezing van tegoeden of onderzoek door de Canadese autoriteiten.
