kekkei genkai (血継限界; bokstavelig talt betyr «en teknikk begrenset til arv av blod «eller» blodlinjegrense») er evner som overføres genetisk i bestemte klaner. Det er mulig for en ninja å ha mer enn en av disse evnene. Kekkei genkai evner som fungerer via brukerens øye kalles dō. Andre kekkei genkai inkluderer å blande en type elementær chakra med en annen, og skape en ny unik for brukerne, noe som vanligvis er umulig for normal ninja.
Kekkei genkai og tilhørende teknikker kan ikke læres til eller kopieres av andre. Kekkei genkai kan imidlertid gis til andre. Dō, eller andre kekkei genkai isolert til et enkelt organ, kan transplanteres inn i kroppen til en annen. Bruk av disse organene krever mye mer chakra enn noen født med kekkei genkai. Chakra elementer kan også sendes ned til folk utenfor klanen, ved å gå GJENNOM EN DNA re-modifikasjon for å skaffe Utgivelsen teknikk. Men, personer ferdigheter i å bruke det ville ikke være nesten like kraftig som den opprinnelige utøveren.
Selv om kekkei genkai vanligvis deles genetisk innenfor en bestemt klan, er det noen ganger unikt for en person alene, og at selv familie slektninger ikke deler den. Men andre kekkei genkai synes å dukke opp i personer uten kjent forhold, slik Som Lava Utgivelsen, som har dukket opp i ninja Fra Kirigakure, Iwagakure, Og Kumogakure, mens Magnet Utgivelsen, som har dukket opp i ninja fra Både Kumogakure og Sunagakure.