Molekylær fylogeni av kelch-repeat superfamily avslører en utvidelse av BTB/kelch proteiner i dyr

Identifikasjon Og karakterisering av kelch-repeat proteiner kodet i det menneskelige genom

for å identifisere kelch-repeat proteiner kodet i det menneskelige genom, BLAST og PSI-BLAST søk av human genome predicted protein database ble utført med kelch-motif consensus (cdd543, pfam01344, Smart 00612) som en spørringssekvens. Dette søket identifiserte 57 kelch-gjenta proteiner og hypotetiske proteiner. Vi bemerket at flere av de kjente humane kelch-repeat proteinene ikke ble identifisert ved denne metoden, sannsynligvis fordi det er relativt få konsensusrester i hvert kelchmotiv, hvorav ingen er helt uforanderlige på tvers av alle eksemplene på motivet, og også på grunn av variasjon i lengdene av løkkene mellom de β-strengene . Derfor ytterligere søk ble gjort med kelch-repetisjoner av alle 28 kjente superfamily medlemmer, som beskrevet i Metodene. Disse søkene identifiserte 18 ekstra kelch-gjenta proteiner kodet i det menneskelige genom. Kryssreferanse av alle 75 oppføringer mot GenBank identifiserte 9 av oppføringene som delvise sekvenser og / eller dupliserte oppføringer for det samme proteinet eller hypotetiske ORF, og to av oppføringene som ikke-kelchholdige proteiner. Vi kryssrefererte også søkeresultatene til domeneoppføringene for kelch i Pfam – og SMARTDOMENEDATABASENE. Mange oppføringer ble oppført i BÅDE SMART og Pfam, men en rekke proteiner vi hadde identifisert, var ikke oppført i disse databasene (angitt I Tabell 1), selv om vi søkte disse polypeptidene mot SMART eller Pfam, var kelchmotiver tydelig identifisert. Videre ble antallet kelch-repeatproteiner tildelt H. sapiens i Artetreet eller Taxbreak-koblingene Til Pfam og SMART overestimert på grunn av inkludering av ufullstendige ORFs og flere oppføringer for samme polypeptid. Vi har også gjennomført flere søk I GenBank Med enkelt kelch motiver fra 28 kjente kelch-gjenta proteiner som var tydelig lengre ENN CDD kelch motiv konsensus, for å søke mer omfattende for proteiner som inneholder mer divergerende repetisjoner. Fra disse flere evalueringene og med utelukkelse av delvise sekvenser (som beskrevet i Metodene), identifiserte vi minst 71 kelch-repeterende proteiner kodet i det menneskelige genomet (Tabell 1).

FOR å bestemme antall gjentatte kelch motiver i hvert protein eller hypotetisk protein, BLASTP søk ble gjort med hver sekvens mot Konservert Domain Database (Cdd) Og Pfam, sammen med manuell identifisering av kelch motiver. Antallet kelch motiver identifisert varierte fra to til syv. Fire blad er minimumsnummeret som er dokumentert fra krystallstrukturer av β-propell domener . Dermed viste det seg usannsynlig at oppføringer som koder for to eller tre kelchmotiver korresponderte med komplette ORFs, og disse ble ekskludert FRA videre analyse (oppføringer NP-689579, XP_209285, XP_058629). På bakgrunn av dette ble 12,7 % (9/71) av sekvensene spådd å inneholde femblader β-propeller, 84,5 % (60/71) å være seksblader og 2,8 % (2/71) å inneholde syvblader propeller (Tabell 1). Etter vår kunnskap har bare ett syvbladet kelch repeat protein blitt identifisert tidligere, sopp galaktoseoksidase .

i galaktoseoksidase, det enkle kelch-repeterende proteinet som det er informasjon om krystallstruktur for, sirkuleres propellen ved dannelse av et sammensatt syvende blad, med β-en til β-tre tråder levert fra den Mest c-terminale sekvensrepetisjonen og β-fire tråder levert av sekvens aminoterminal til den første fullstendige sekvensrepetisjonen, en mekanisme kalt «N-terminale β-strenglukking» , (Fig. 1C). Vi undersøkte de humane kelch-repetisjonsproteinene ved hjelp av sekundærstruktur prediksjon av β-ark og ved manuell analyse av sekvensrepetisjonene, og fant at for 77,5% (55/71) av proteinene ble β-propellstrukturen spådd å bli lukket av En C-terminal β-streng. For fem sekvenser kunne ingen klar prediksjon gjøres (Tabell 1).

Kromosomal lokalisering av Humane kelch-repeat proteiner

kodingssekvensene for humane kelch-repeat proteiner er spredt over hele genomet, lokalisert på alle kromosomer unntatt kromosom 21 og Y-kromosomet (Tabell 1). Flere forekomster av gener i fysisk nærhet ble lagt merke TIL, for EKSEMPEL NP_006460 og NP_067646 ved 1q31. 3 og NP_569713 og NP_060114 ved 3q27 .3 (Tabell 1). Men i de fleste tilfeller samsvarer disse ikke med de mest nært relaterte proteinsekvensene som forventes for nylig dupliserte gener. Et unntak var NP_055130 OG NP-751943 som var lokalisert på 14q21. 3 og som var mest knyttet til hverandre (46% identitet). Samlet sett var det ingen bevis for fysisk gruppering av kelch-proteinkodingssekvenser innenfor det humane genomet. I kontrast er gener som koder for de mange f-box/kelch-proteinene Av A. thaliana gruppert slik at noen av de mest relaterte sekvensene er kodet fra fysisk nært genomiske steder .

Domenearkitektur Av Humane Kelch-repeatproteiner

Tjueåtte kelch-repeatproteiner fra forskjellige organismer ble tidligere gruppert i 5 strukturelle kategorier i henhold til plasseringen av kelch-repeterene i polypeptid-sekvensen og tilstedeværelsen av andre konserverte strukturelle domener . For å evaluere kompleksiteten av domenearkitekturer i en enkelt organisme, ble hver menneskelig kelch-repeat protein sekvens re-analysert ved å søke mot CDD, SMART Og Pfam og deretter undergruppert i henhold til domenearkitektur.

Påfallende inneholdt 72 % (51/71) av de humane kelch-repeatproteinene ET BTB / POZ-domene. I alle unntatt ett av proteinene var BTB-domenet aminoterminalt til kelch-domenet (Tabell 1). Dette hypotetiske proteinet, LZTR-1, inneholdt to tandem BTB-domener. Fire (5,6%) kelch-repeat proteiner inneholdt et enkelt ekstra konservert domene. Muskelin var det eneste kelch-repeterende proteinet som ble identifisert i det menneskelige genom for å inneholde et discoidin-domene (CDD 7753, Pfam 00231, SMART 00231, også kjent Som F5 / F8 Type C-domene) (Prag, Collett og Adams, under forberedelse). Discoidin-domenet fungerer som et protein-protein interaksjonsdomene i en rekke ekstracellulære og intracellulære proteiner, og i koagulasjonsfaktorer V OG VIII medierer fosfolipidbinding . Et annet kelch-protein, XP_048774, inneholdt Et f-box-domene (CDD9197, Pfam 00646). F-boksen er et domene på omtrent førti rester, først identifisert i cyclin A, som interagerer Med Skp1 for å forankre proteiner til ubiquitin-ligase-samlingen for ubiquitination og målretting mot proteosom-mediert nedbrytning . Kombinasjonen Av f-box og kelch-repeat domener har tidligere blitt beskrevet I A. thaliana, hvor minst 67 F-box / kelch proteiner og hypotetiske proteiner er kodet i genomet . Flere av disse fungerer i lysavhengig regulering av sirkadisk klokke, men funksjonen til mange andre er uklar . Så vidt vi vet er dette den første anerkjennelsen av Et f-box/kelch-protein i et dyregenom. Et spådd kelch-repeterende protein, NP_055608, inneholdt et leucinkarboksylmetyltansferase (LCM) – domene (CDD9631, Pfam 04072) med 34% identitet til lcm-domenet av proteinfosfatase 2 leucinkarboksylmetyltransferase . Rekombinasjonsaktiverende gen-2 (RAG-2) inneholder et plantehomeodomain (PHD) fingerdomene (Pfam00628) ved karboksyterminalen .

Seks kelch-repeatproteiner (11 %) var svært store, flerdomainproteiner (Tabell 1). Attractin / mahogny (som er spleisevarianter fra et enkelt gen; 27-29) og MEGF8 er hver over 1000 aminosyrer lange og inneholdt ET CUB-domene, kelch gjentar, Et c-type lektindomene og EGF-lignende domener. Ulike funksjoner har blitt tilskrevet attractin og mahogny som inkluderer en rolle I T-celle interaksjoner (attractin, den utskilte splice variant) og fedme regulering i mus (mahogny, den transmembrane splice variant) . Vertscellefaktor-1 og -2 (HCF-1 OG HCF-2) er også store proteiner som inneholder aminoterminal kelch-repetisjoner, to fibronektin TYPE III-domener og, i TILFELLE HCF-1, en serie unike HCF-repetisjoner. Disse proteinene fungere som transkripsjonelle coactivators av herpes simplex virus umiddelbar tidlig genuttrykk .

vi identifiserte tre hypotetiske kelch-repeat proteiner som inneholder urelaterte unike sekvenser som ikke samsvarer med anerkjente strukturelle domener, plassert enten amino-eller karboksy-terminal til kelch repeats (Tabell 1).

Rab9 effektor p40 og seks andre kelch-repeat proteiner var korte polypeptider, fra 350-442 aminosyrer i lengde, som besto nesten utelukkende av kelch repetisjoner (Tabell 1). Fem av disse proteinene eller hypotetiske proteinene, inkludert p40, inneholdt seks sekvensrepetisjoner og antas dermed å danne seks-bladede β-propeller. To hypotetiske proteiner, NP_060673 og XP_114323, besto av formodede syvblader propeller. Sammen danner disse strukturelle forskjellene grunnlaget for den nye kategoriseringen av humane kelch-repeat proteiner som presenteres her (Tabell 1).

Strukturelle forhold mellom humane BTB / kelch-proteiner

det uventet store antallet BTB / kelch-proteiner kodet i det menneskelige genomet fikk oss til å studere denne gruppen mer detaljert, med sikte på å identifisere strukturelle undergrupper som også kan representere funksjonelle undergrupper. De 38 full-lengde sekvenser som inneholdt enkelt BTB domener og spådd seks-bladed β-propeller ble justert i henhold til sekvens likhet I CLUSTALW og sett på som nabolaget-bli trær. Justering av full lengde sekvenser avdekket tre undergrupper av omtrent like stor størrelse, som vi kalte undergrupper 1 til 3 (Fig. 2A). Når den samme analysen ble utført med kelch-domenene alene, var den samme grupperingen tydelig for undergruppe 1 og en betydelig andel av undergruppe 2, kalt undergruppe 2A (Fig. 2B). I en justering av BTB domener bare, undergrupper 1 og 2 ble opprettholdt for de fleste sekvenser (Fig. 2C). Unrooted trær produsert av en egen metode for justering basert på maksimal parsimony analyse av sekvenser, PROTPARS, støttet ikke undergruppe 3, men konsekvent viste forholdet mellom sekvensene i undergrupper 1 OG 2A (data ikke vist). Vi fokuserte på disse robust-relaterte kelch-gjenta sekvenser i undergrupper 1 OG 2A, for en nærmere analyse av kelch-gjenta domener.

Relasjoner mellom humane BTB / kelch proteiner. Aminosyresekvensene av de 38 full-lengde humane BTB / kelch-proteinene som antas å inneholde seks-blader β-propeller ble justert I CLUSTALW og presenteres I Phylip Drawgram For A) full-lengdesekvenser; B) bare kelch-gjenta domener; C) BARE BTB-domener, med skyggekoder for de tre identifiserte undergruppene som angitt. Stjerne i panelet for a indikere kjente actin-bindende BTB / kelch-proteiner. Panel B viser den robuste grupperingen av et sett med sekvenser fra undergruppe 2, kalt undergruppe 2A.

CLUSTALW multiple sekvens justering av kelch-gjenta domener fra hver av undergrupper 1 OG 2A demonstrert særpreg i form av gjenta organisasjon. I begge undergrupper (Fig. 3 Og Fig. 4), intrablade-sløyfen mellom β-tråder 2 og 3 (2-3-sløyfen, Fig. 5A) og interblade 4-1-sløyfen var store kilder til variasjon innenfor repetisjonene med hensyn til deres lengde og primærstruktur. I sammenheng med et intakt β-propelldomene stikker 1-2-og 3-4-løkkene over ett ansikt av β-arkene og 2-3-løkken stikker ut fra motsatt ansikt (Fig. 5A). 4-1-sløyfen ligger enten på samme flate som 2-3-sløyfen, eller kan plasseres nærmere propellkjernen (Fig. 5). I undergruppe 1 ble de lengste 2-3 løkkene funnet i repeter 1, 5 og 6, med kortere løkker i bladene 2, 3 og 4. Den lengste 4-1 sløyfe var at mellom gjentar 5 og 6 (Fig. 3). I sammenheng med en β-propell antyder dette at siden av propellen dannet av gjentakelser 5, 6 og 1 kan være spesielt involvert i proteininteraksjoner (Se Fig. 1C). I undergruppe 2A var de lengste 2-3 løkkene de i repeter 1 og 2, gjentar 4 og 5 hadde mellomliggende 2-3 løkker og gjentar 3 og 6 inneholdt de korteste 2-3 løkkene. De lengste 4-1 løkkene var de mellom repetisjonene 1 og 2, og gjentar 3 og 4 (Fig. 4). Dette antyder at det er en annen organisering av bindingssteder i undergruppe 2A β-propeller, med kanskje to bindingsflater dannet av repeter 1 og 2, og repeter 4 og 5. På nivå med individuelle sekvenser var det også spesifikke eksempler på variasjon fra standard repetisjonsorganisasjon som kunne ha funksjonell betydning for individuelle proteiner. FOR EKSEMPEL HAR NP_695002 I undergruppe 2A en uvanlig lang og høyt ladet 3-4 sløyfe i repeat 1 OG XP_ 040383 har en lang 3-4 sløyfe i repeat 4 (Fig . 4).

Multiple sekvensjustering av undergruppe 1 humane BTB / kelch proteiner. Kelch-gjenta domener av 15 undergruppe 1 BTB / kelch proteiner ble justert I CLUSTALW å generere en 50% identitet terskel nivå konsensus sekvens. Justeringene presenteres for hver repetisjon, med repetisjonsenheten tildelt i HENHOLD TIL 1gof-strukturen. De fire β-strengene i hver gjentakelse er fargekodet som I Fig. 1A. Justeringer presenteres I Boxshade: svart skygge indikerer identiske aminosyrer, grå skygge indikerer lignende aminosyrer og hvit bakgrunn indikerer ikke-relaterte aminosyrer.

Multiple sekvensjustering av undergruppe 2A humane BTB / kelch proteiner. Kelch-gjenta domener av 10 undergruppe 2A BTB / kelch proteiner ble justert I CLUSTALW å generere en 50% identitet terskel nivå konsensus sekvens. Justeringene presenteres for hver repetisjon, med repetisjonsenheten tildelt i HENHOLD TIL 1gof-strukturen. De fire β-strengene i hver gjentakelse er fargekodet som I Fig. 1A. Justeringer presenteres I Boxshade: svart skygge indikerer identiske aminosyrer, grå skygge indikerer lignende aminosyrer og hvit bakgrunn indikerer ikke-relaterte aminosyrer.

Relasjoner av konsensus kelch-motiver til propellbladstruktur. A, Sidevisning av enkelt propellbladstruktur fra galaktoseoksidase (1gof). β-tråder er fargekodet som I Fig. 1a og nomenklaturen for intra – og mellombladsløyfer er angitt. B, Justering av konsensus kelch motiver avledet FRA BTB / kelch undergrupper 1 OG 2a til blad struktur, viser forskjeller i 2-3 sløyfe størrelse og kostnadsfordeling. Posisjonen til hver β-streng er indikert.

vi fant også at konsensussekvensene for brettet var særegne mellom de to undergruppene. 50% identitet konsensussekvensen fra hver undergruppe ble justert mot kelch-repeat-enheten for å utlede gjennomsnittlige 50% identitet konsensussekvenser for undergruppe 1 OG undergruppe 2A. disse motivene ble kartlagt mot den kjente bladstrukturen til galaktoseoksidase (Fig. 5). Konsensusmotivene inkluderte både aminosyrer av betydning for folden (plassert innenfor de β-strengene)og visse aminosyrer i sløyfer, som ville bli spådd å bidra til bindende interaksjoner. Gjennomsnittlig lengde på motivet var kortere i undergruppe 1 enn undergruppe 2A. Undergruppen 2a konsensus er spådd å inneholde en lengre 2-3 sløyfe. Konsensusmotivene var tydelige i posisjoneringen av høyt konserverte ladede rester i sløyferegionene (Fig. 5). Bevaringen av disse ladede rester var mest uttalt i undergruppe 1, hvor disse stillingene ble bevart i motivet til 70% identitetsterskelnivå (data ikke vist). Disse forskjellene i sløyfekarakteristikker tyder også på forskjellige modaliteter av protein-protein-interaksjoner for β-propellene i undergrupper 1 og 2a. MED hensyn til tidligere karakteriserte proteinbindende egenskaper observerte vi AT BTB / kelch-proteinene som binder seg til aktin ble delt mellom undergruppe 1 og 3; dermed har denne funksjonen ikke et enkelt forhold til primærstrukturen (Fig. 2A).

Kelch-repeat Proteiner kodet i invertebrate genomer

vi ønsket å sammenligne den evolusjonære utviklingen av kelch-repeat proteiner mellom mennesker og moderne virvelløse dyr, og så gjentok analysen av kelch-repeat proteiner og deres strukturelle undergrupper kodet i genomene Til d. melanogaster, a. gambiae og C. elegans . Vi identifiserte 18 kelch-gjenta proteiner kodet i Drosophila og Anopheles genomene (Tabell 2). Sytten av disse var ortologer bevart mellom de to artene (gjennomsnittlig identitet Mellom ortologe gener Av d. melanogaster og a. gambiae er 56 % ) og en var unik for hver art. Dermed ble En Actinfilin-homolog identifisert I a. gambiae, men ikke I d. melanogaster, og d. melanogaster-genomet inneholdt en homolog AV NP_116164 som ikke var tilstede I a. gambiae (Tabell 2). Bare tre kelch-repeter proteiner ble tidligere karakterisert i D. melanogaster, Nemlig Kelch, Muskelin og Drosophila vert celle faktor . To andre, diablo og scruin-lignende på midtlinjen (SLIM-1), har blitt anerkjent som kelch-repeat proteiner .

innenfor gruppen av 19 proteiner og hypotetiske proteiner inneholdt 95% seks kelch-repetisjoner. Bare ett protein med fem kelch-repetisjoner ble identifisert i Enten d. melanogaster eller a. gambiae, som korresponderte med en orthologue av det humane f-box / kelch-proteinet, XP_048774 (Tabell 2). 56 % av kelch-repeatproteiner Av d. melanogaster og A. gambiae var BTB / kelchproteiner. Både d. melanogaster og a. gambiae inneholdt ett discoidin/kelch protein orthologe til muskelin, ett F-box/kelch protein, tre kelch og multidomain proteiner, ett kelch og unikt protein, og to propell-bare proteiner. Dermed hadde alle de 19 kelch-repeterende proteinene identifisert homologer i det menneskelige genomet, og BTB / kelch-domenearkitekturen var den mest utbredte (Tabell 2).

vi identifiserte 16 kelch-repeat proteiner kodet i c. elegans genomet (Tabell 3). Av disse proteinene er kun kel-1, spe-26 og CeHCF funksjonelt karakterisert. Kel-1 er et intracellulært protein som er involvert i regulering av adferdsadferd under larvutvikling . Spe-26 bidrar til cellulær organisering av spermatocytter og mutasjoner er forbundet med sterilitet . CeHCF kan være involvert i regulering av celleproliferasjon . 43.7 % (7/16) av proteinene hadde BTB/kelch-domenearkitekturen, to var homologer AV HCF og attractin med lignende flerdomainarkitekturer, to inneholdt unike sekvenser utenfor kelch-repetisjonene og to var propellproteiner, som begge ble spådd å danne seksbladede β-propeller. Et Enkelt F-box / kelch protein ble identifisert, men ingen muskelin – lignende protein ble funnet (Tabell 3). I stedet ble to hypotetiske proteiner med særegne domenearkitekturer identifisert : NP_506605 som også inneholdt et cyclin carboxy-terminal domene (Cdd 7965, Pfam 02984, SMART 00385) og NP_506602, som inneholdt ET RINGDOMENE (CDD 8941, Pfam 00097, SMART 00184). Cyclin carboxy-terminal-domenet danner en α-spiralformet fold som kan utgjøre et proteininteraksjonssted . RINGDOMENET er en sinkfinger-fold som formidler protein-protein-interaksjoner .

Kelch-repeat Proteiner kodet i gjærgenomer

Flere kelch-repeat proteiner har blitt studert funksjonelt i spirende og fisjon gjær, men ingen av disse tilsvarer BTB / kelch proteiner . Vi undersøkte om prevalansen av BTB/kelch-domenearkitekturen vi hadde identifisert i multicellulære dyr utvidet til gjær, ved å analysere komplementet til kelch-repeterende proteiner kodet I s. pombe og s. cerevisiae-genomene . Vi fant at hvert genom kodet et lite antall kelch-gjenta proteiner (fem I S. pombe, åtte I S. cerevisiae), hvorav ingen tilsvarte ET BTB / kelch-protein(Tabell 4). Proteiner og hypotetiske proteiner bestående av en aminoterminal kelch β-propell og en utvidet spiralområde og et protein som tilsvarer en antatt leucinkarboksylmetyltransferase var vanlige For S. pombe og s. cerevisiae. De andre kodede kelch-repeterende proteinene var ikke-homologe (Tabell 4). Muskelinlignende 1-protein og Ral-2p ble identifisert i S. pombe, men ikke s. cerevisiae . To proteiner med fjernrelaterte kelchrepetisjoner, Gpb1 / Krh1 og Gpb2 / Krh2, har blitt karakterisert funksjonelt som G-proteinkoblede reseptorbindende proteiner i S. cerevisiae . Homologe proteiner ble ikke identifisert I S. pombe i sammenheng med vår studie. DERMED BLE BTB / kelch-domenearkitekturen ikke identifisert i disse gjærene.

Begrensning av BTB/kelch proteiner til metazoan dyr og poxviruses

FORDI BTB / kelch domene arkitektur dukket utbredt i dyr, men ble ikke identifisert i gjær vi var interessert i å vurdere om noen andre organismer kan inneholde kelch-gjenta proteiner med dette domenet arkitektur. EN rekke BTB / kelch-proteiner har blitt rapportert som hypotetiske open reading frames (ORFs) i poxvirusfamilien av dyrevirus . Cdart-databasen (Conserved Domain Architecture Retrieval Tool) hos NCBI viser 333 oppføringer for BTB / kelch-proteiner, som alle stammer fra vertebrater, insekter, C. elegans eller poxvirus. TIL dags dato HAR BTB-domenet bare blitt identifisert i eukaryoter(Pfam 00651 arter tre). I tillegg til å gjennomgå SMART-og Pfam-artertrærne for kategorisering AV BTB / kelch-domenearkitekturen, gjennomførte vi våre EGNE BLASTP – og TBLASTX-søk i A. thaliana genome database MED cdd kelch motif consensus (dette søkeverktøyet identifiserte 44 BTB / kelch proteiner fra det menneskelige genomet og er dermed svært effektivt for å avdekke disse proteinene) og identifiserte 72 proteinsekvenser, hvorav de fleste var F-box / kelch proteiner, hvorav noen var serin – treoninfosfatase / kelch proteiner, og ingen av dem VAR BTB / kelch proteiner. Søk med BTB-domenene til flere humane eller hvirvelløse kelch-repeat-proteiner identifiserte heller ikke BTB / kelch-proteiner i A. thaliana. BLAST genomer søk i databaser av fullstendig eller delvis sekvensert eukaryote dyr og plante genomer PÅ NCBI (Entrez / genome_tree,), som inkluderte fullt sekvensert genomer Av Apicomplexium Plasmodium falciparum, Microsporidium Encephalitozoon cuniculi, anlegget Oryza sativa (ris; ) og sopp Neurospora crassa identifisert mange spådd kelch-gjenta-holdige proteiner, men ingen ORFs som hadde BTB / kelch domene arkitektur. Resultater for utvalgte domenearkitekturer i fem eukaryote organismer er presentert I Fig. 6. Vi noterte imidlertid I Apicomplexia-arter, to proteiner Med K Tetra / kelch-domenearkitektur (NP_705330 OG EAA22466). K tetra-domenet (Pfam 02214) er en fjern strukturell slektning av BTB / POZ-domenet . Samlet sett gir disse resultatene en signifikant indikasjon på at proteinkodende sekvenser for BTB/kelch-domenearkitekturen har blitt utvidet under utviklingen av multicellulære dyr, sammenlignet med Apikompleksi, sopp, planter og andre eukaryoter.

Prevalens av utvalgte kelch-repeat protein domene arkitekturer i eukaryoter. Søylediagrammer representerer antall kelch-gjenta proteiner med de angitte domenearkitekturer kodet I proteomer Av H. sapiens (Hs), d. melanogaster (Dm), C. elegans (Ce), S. pombe (Sp) og A. thaliana (At).