mutacja K103n w terapii przeciwretrowirusowej–wcześniej nieleczeni pacjenci z Afryki zakażeni wirusem HIV typ 1

Streszczenie

większość informacji na temat sekwencjonowania genetycznego i wrażliwości na lek ludzkiego wirusa niedoboru odporności typu 1 (HIV-1) pochodzi z badania HIV-1 Podtyp B. na całym świecie większość osób zakażonych wirusem HIV-1 jest zakażonych wirusami niezwiązanymi z Podtyp B. w krajach rozwijających się. Zgłaszamy 3 przypadki nieleczonych wcześniej antyretrowirusowo afrykańskich imigrantów zakażonych szczepami HIV-1 posiadającymi mutację k103n w genie odwrotnej transkryptazy, która nadaje wysoką oporność na wszystkie nonukleozydowe inhibitory odwrotnej transkryptazy.

panel International AIDS Society—USA i US Public Health Service Task Force zalecają testowanie niektórych osób pod kątem opornych na lek szczepów HIV-1, aby pokierować wyborem nowych schematów. Należą do nich osoby, u których leczenie nie powiodło się, kobiety w ciąży (w celu zapobiegania przenoszeniu wirusa z matki na dziecko), osoby z ostrym lub niedawno nabytym zakażeniem HIV-1 przed rozpoczęciem leczenia oraz osoby w regionach, w których czas trwania zakażenia jest niepewny, ale spodziewana częstość występowania oporności na leki wynosi >5%. Jednakże decyzję o zleceniu badań oporności u pacjentów wcześniej nie leczonych przeciwretrowirusowo (ART) z rozpoznanym zakażeniem HIV—1 pozostawiono w gestii lekarza prowadzącego. W obszarach, w których występują znaczne wskaźniki odporności na ART i w przypadkach, w których prawdopodobieństwo przeniesienia wirusa lekoopornego jest wysokie, zaleca się testowanie odporności. Badania odporności na ART nie są rutynowo wykonywane w krajach rozwijających się, jednak istnieją dowody na to, że u pacjentów wcześniej nieleczonych ART w Afryce Subsaharyjskiej istnieją mutacje oporne na leki i wtórne polimorfizmy związane z opornością na leki przeciwretrowirusowe . Opisujemy 3 naiwnych, zakażonych HIV-1 afrykańskich gości i/lub imigrantów z mutacją k103n związaną z nonnucleoside Reverse-transcriptase inhibitor (NNRTI) w genie odwrotnej transkryptazy (RT), którzy byli widziani w ciągu 3 miesięcy w naszym Centrum Medycznym (Hennepin County Medical Center; Minneapolis). Według naszej wiedzy, nie było to wcześniej zgłaszane w Stanach Zjednoczonych.

Pacjentem 1 Była 45-letnia kobieta z Kenii, która wyemigrowała do Stanów Zjednoczonych ∼6 miesięcy przed rozpoznaniem zakażenia HIV-1. Miała nawracające zapalenie sromu i pochwy, które skłoniło ją do badania. Otrzymała diagnozę zakażenia wirusem opryszczki narządów płciowych typu 2, a wyniki testu HIV-1 wykonanego podczas wizyty były pozytywne. Zgłosiła, że miała dwóch dożywotnich partnerów seksualnych, z których obaj nadal mieszkali w Kenii. Zakładano, że heteroseksualny stosunek płciowy był jej drogą zakażenia HIV-1, ponieważ nie zgłosiła historii zażywania iniekcji ani transfuzji krwi. Odmawiała uprzedniego kontaktu ze sztuką. Sekwencjonowanie genetyczne izolatu HIV-1 wykryło mutację k103n, a izolat wirusa grupował się ze szczepem CRF01_AE HIV-1. Na podstawie tych wyników i stanu klinicznego pacjenta 1, rozpoczęto stosowanie schematu oszczędzającego NNRTI tenofowiru, lopinawiru/rytonawiru i lamiwudyny/zydowudyny. U pacjentki 1 wystąpiła odpowiedź na leczenie, a jej ostatnie obciążenie RNA HIV-1 i liczba limfocytów T CD4+, mierzone 1 rok po rozpoczęciu leczenia, wynosiły odpowiednio <50 kopii/mL i 436 komórek/mm3 (tabela 1).

Tabela 1

charakterystyka demograficzna i kliniczna 3 pacjentów z Kenii zakażonych wirusem HIV-1.

Tabela 1

charakterystyka demograficzna i kliniczna 3 pacjentów z Kenii zakażonych wirusem HIV-1.

pacjentami 2 i 3 byli odpowiednio 42-letni mężczyzna i 42-letnia żona. Obaj pochodzili również z Kenii i otrzymali diagnozę zakażenia HIV – 1 podczas wakacji w Stanach Zjednoczonych. Pacjentów 2 i 3 oceniano po rozpoznaniu AIDS przez ich młodą córkę podczas hospitalizacji z powodu zapalenia płuc. U pacjenta 2 rozpoznano mięsaka Kaposiego i czynną gruźlicę płuc, natomiast u pacjenta 3 nie stwierdzono objawów. Oboje przez całe życie mieszkali w Kenii i oboje nie byli świadomi swojego statusu zakażenia HIV-1. Obaj zaprzeczyli jakiemukolwiek znanemu kontaktowi ze sztuką. Mutację K103N w genie RT wykryto u obu pacjentów, a Izolaty odzyskano od każdego pacjenta zgrupowanego z wirusem podtypu a (Tabela 2 i fig.1). U obu pacjentów rozpoczęto leczenie oszczędzającym NNRTI tenofowirem, lopinawirem/rytonawirem oraz lamiwudyną/zydowudyną i uzyskano dobrą odpowiedź na leczenie (tabela 1).

Tabela 2

mutacje i polimorfizmy w genach odwrotnej transkryptazy (RT) i proteazy (PR).

Tabela 2

mutacje i polimorfizmy w genach odwrotnej transkryptazy (RT) i proteazy (PR).

Rysunek 1

drzewo filogenetyczne izolatów HIV-1, poprzez analizę sekwencji genu odwrotnej transkryptazy. Sąsiad dołącza do drzewa (za pomocą MEGA 2.1) zbudowany z sekwencji pol z izolatów pacjentów i 11 izolatów referencyjnych grupy m (Podtyp a izolat U455, CRF01_AE izolat U54771, CRF02_AG izolat L39106, Podtyp B izolat HXB2, Podtyp C izolat C2220, Podtyp D izolat NDK, Podtyp F izolat 93BR020, Podtyp G izolat SE6165, Podtyp H izolat 90cr056, Podtyp J izolat SE9173c i podtyp K izolat 97eqtb11c), zakorzenione w grupie N (izolat ybf30). Izolaty od pacjentów 2 i 3 klastra najbliżej siebie i do podtypu A oraz Izolaty od pacjentów 1 klastra z CRF01_AE. Wyświetlane są wartości Bootstrap >60.

Rysunek 1

drzewo filogenetyczne izolatów HIV-1, poprzez analizę sekwencji genu odwrotnej transkryptazy. Sąsiad dołącza do drzewa (za pomocą MEGA 2.1) zbudowany z sekwencji pol z izolatów pacjentów i 11 izolatów referencyjnych grupy m (Podtyp a izolat U455, CRF01_AE izolat U54771, CRF02_AG izolat L39106, Podtyp B izolat HXB2, Podtyp C izolat C2220, Podtyp D izolat NDK, Podtyp F izolat 93BR020, Podtyp G izolat SE6165, Podtyp H izolat 90cr056, Podtyp J izolat SE9173c i podtyp K izolat 97eqtb11c), zakorzenione w grupie N (izolat ybf30). Izolaty od pacjentów 2 i 3 klastra najbliżej siebie i do podtypu A oraz Izolaty od pacjentów 1 klastra z CRF01_AE. Wyświetlane są wartości Bootstrap >60.

dyskusja. Wśród 4 klas leków przeciwretrowirusowych częstość występowania oporności na leki u pacjentów wcześniej nieleczonych przeciwretrowirusowo jest często najwyższa w przypadku NNRTI . W Stanach Zjednoczonych w niektórych populacjach zaobserwowano odsetek pierwotnej oporności na NNRTI wynoszący 16%. U 33% pacjentów poddanych monoterapii newirapiną w badaniu w USA wystąpiła mutacja K103N . Pojedyncza dawka newirapiny (200 mg) w zapobieganiu przenoszeniu wirusa HIV-1 z matki na dziecko jest coraz częściej stosowana w wielu częściach Afryki i była związana z rozwojem oporności na NNRTI, w tym spowodowanej mutacją K103N . Sugerowano, że u kobiet w ciąży otrzymujących pojedynczą dawkę newirapiny, lek ten szybko hamuje szczepy wrażliwe na ART, umożliwiając selekcję podstawowych, lekoopornych szczepów HIV-1 . Może to być ułatwione przez wysokie miano wirusa i małą liczbę limfocytów T CD4+, jak również przez długi okres półtrwania newirapiny. Mutacja K103N jest główną mutacją oporności obserwowaną w przypadku NNRTI i nadaje oporność na wszystkie leki z tej klasy . Chociaż pierwotnie zidentyfikowano go u afrykańskich pacjentów narażonych na ART, według naszej wiedzy, ta mutacja oporności nie została wcześniej zgłoszona u afrykańskich pacjentów, którzy nie byli wcześniej leczeni ART w Stanach Zjednoczonych.

istnieje kilka możliwych wyjaśnień dla wykrycia mutacji K103N u pacjentów nieleczonych wcześniej ARV. Zgłaszano zmiany genetyczne w genie HIV-1 pol bez ekspozycji na ART w pozycjach związanych z opornością na leki . Dobrze scharakteryzowane pierwotne mutacje w pozycjach oporności na leki są wybierane w wirusach pod ciśnieniem leku, ale zidentyfikowano również mniej scharakteryzowane wtórne podstawienia aminokwasów, które pojawiają się podczas terapii lekowej . Niektóre z nich są polimorfizmami (tj. występują u >1% izolatów od nieleczonych pacjentów) i nie są tak silnie związane z opornością na leki. Warianty te mogą istnieć jako dominujące lub mniejszościowe populacje wirusowe przed wprowadzeniem sztuki, ale mogą one również pojawić się podczas terapii i mogą przyczynić się do niepowodzenia leczenia .

większość naszej wiedzy na temat oporności na leki w HIV-1 pochodzi z badań nad podtypem B, podczas gdy większość ludzi w Afryce zakażonych HIV-1 jest zakażonych podtypami innych niż B ; różnica między genem env podtypów innych niż B A genem podtypu B wynosi ∼30% . Pojawiają się DANE, że chociaż szczepy HIV—1 niezwiązane z podtypem B w dużej mierze wykazują mutacje oporności na leki już rozpoznane w podtypie B, istnieją unikalne polimorfizmy niezwiązane z podtypem B-niektóre z nich występują w pozycjach oporności na leki-i mogą wpływać na potencjalną terapię przeciwretrowirusową .

mogą występować specyficzne dla podtypu mutacje związane z leczeniem, co sugeruje, że szlaki oporności na leki mogą się różnić w zależności od podtypu. W badaniu HIV-1 podtypu C w Botswanie, Bollyky i wsp. wykazano, że mutacje specyficzne dla podtypu C, o których wcześniej wiadomo, że są związane z opornością na leki w niektórych pozycjach proteazy, stwierdzono u znaczącego odsetka pacjentów nieleczonych wcześniej lekami. To rodzi pytanie o pewne wzorce oporu rozwijające się szybciej w niektórych podtypach innych niż B. W swoich badaniach nad wirusem podtypu C w Etiopii, Loemba et al. zasugerowano również, że może istnieć różnica w szybkości rozwoju oporności w niektórych podtypach innych niż B, która jest ułatwiona przez istniejące wcześniej polimorfizmy. Fakt, że nasi 3 pacjenci byli zakażeni podtypem a lub AE, zwiększa możliwość, że polimorfizm K103N może wystąpić w znacznym stopniu w niektórych populacjach zakażonych HIV—1 innych niż typ B, potencjalnie zagrażając odpowiedzi na leczenie oparte na NNRTI.

nie wiadomo, czy nasi pacjenci byli zakażeni szczepami już opornymi na NNRTIs, czy szczepami z polimorfizmami de novo w pozycjach lekoopornych. Nie byli świadomi swojej ekspozycji na HIV – 1 i nie wiedzieli, kiedy zostali zarażeni. Ze względu na ich poziom supresji immunologicznej (z wykorzystaniem liczby limfocytów T CD4+ jako markera zastępczego), jest prawdopodobne, że zostali zakażeni co najmniej kilka lat temu, a pacjent 3 był zakażony przez >6-8 lat (w oparciu o wiek córki, która otrzymała diagnozę AIDS). Ramy czasowe poprzedzają powszechne stosowanie newirapiny u kobiet w ciąży w Afryce, które rozpoczęło się w przybliżeniu w 1999 roku.

ze względu na zwiększoną emigrację Afrykanów do krajów rozwiniętych, ważne jest, aby pracownicy służby zdrowia na Zachodzie, którzy leczą pacjentów z zakażeniem HIV-1, zauważyli możliwość lekooporności u tych pacjentów, którzy często pochodzą z regionów ubogich w zasoby, z ograniczonym dostępem do terapii przeciwretrowirusowej. Nasze doświadczenie podkreśla potencjalną rolę testów oporności przed użyciem sztuki, która zawiera NNRTI i potencjalnie leki z innych klas, nawet dla pacjentów z regionów, w których zastosowanie sztuki jest niewielkie lub nie ma żadnego zastosowania. Chociaż status oporności genotypowej niekoniecznie koreluje z odpowiedzią kliniczną na terapię, takie informacje mogą stać się coraz ważniejsze wraz z dalszym wprowadzaniem i administrowaniem sztuką w krajach rozwijających się oraz z emigracją i podróżami osób zakażonych HIV-1 do krajów rozwiniętych. U wszystkich 3 pacjentów opisanych w tym artykule, identyfikacja wyjściowego wzorca oporności miała wpływ na wybór początkowego leczenia i prawdopodobnie przyczyniła się do skutecznego zahamowania wiremii.

podziękowania

Dziękujemy Davidowi Katzensteinowi, Wydziałowi chorób zakaźnych Uniwersytetu Stanforda i Centrum Badań nad AIDS (Palo Alto, CA) za jego cenną pomoc.

Wszyscy autorzy: bez konfliktu.

1

Hirsch
MS

,

Brun-Vezinet
F

,

Klotet
B

i in.

badania oporności na leki przeciwretrowirusowe u osób dorosłych zakażonych ludzkim wirusem niedoboru odporności typu 1: 2003 recommendations of an International AIDS Society-USA panel

,

Clin Infect Dis

,

2003

, vol.

37

(str.

113

28

)

2

United States Public Health Service Task Force

. ,

zalecenia dotyczące stosowania leków przeciwretrowirusowych u ciężarnych kobiet zakażonych HIV-1 dla zdrowia matki i interwencji w celu zmniejszenia perinatalnego przeniesienia HIV-1 w Stanach Zjednoczonych
dostępne pod adresem: http://www.aidsinfo.nih.org. Dostęp maj 2003

3

Loemba
H

,

Brenner
B

,

Parniak
MA

i in.

polimorfizmy cytotoksycznych limfocytów T (CTL) i epitopów pomocniczych T w obrębie odwrotnej transkryptazy (RT) podtypu C HIV-1 z Etiopii i Botswany po selekcji oporności na leki przeciwretrowirusowe

,

Antivir Res

,

2002

, vol.

56

(str.

129

42

)

4

Loemba
H

,

Brenner
B

,

Parniak
MA

i in.

dywergencja genetyczna ludzkiego wirusa niedoboru odporności typu 1 (RT) i szybki rozwój oporności na nonukleozydowe inhibitory RT

,

środki antymikrobowe Chemother

,

2002

, vol.

46

(str.

2087

94

)

5

Eshleman
SH

,

Mracna
M

,

Guay
LA

i in.

selekcja i zanikanie mutacji oporności u kobiet i niemowląt otrzymujących newirapinę w celu zapobiegania pionowemu przenoszeniu wirusa HIV-1 (HIVNET 012)

,

AIDS

,

2001

, vol.

15

(str.

1951

7

)

6

Eshleman
SH

,

Jackson
JB

.

oporność na Newirapinę po jednorazowej profilaktyce

,

AIDS Rev

,

2002

, vol.

4

(str.

59

63

)

7

D ’ Aquila
RT

,

Schapiro
JM

,

Brun-Vezinet
F

i in.

mutacje oporności na leki w HIV-1

,

Top HIV Med

,

2003

, vol.

11

(str.

92

6

)

8

Kantor
R

,

Lloyd
R

,

Shafer
R

i in.

porównanie transmisji z matki na dziecko (MTCT) i oporności genotypowej w podtypach A, C i D HIV-1 po podaniu pojedynczej dawki newirapiny (sd-NVP) w Afryce

,

Program i abstrakty 9. konferencji retrowirusów i zakażeń oportunistycznych (Seattle)

,

2002
Alexandria, VA
Fundacja Retrowirologii i zdrowia ludzkiego

pg.

343

9

Salomon
H

,

Wainberg
MA

,

Brenner
B

i in.

częstość występowania HIV-1 opornego na leki przeciwretrowirusowe U 81 osób nowo zakażonych w wyniku kontaktów seksualnych lub zażywających narkotyki dożylnie. Badacze badania pierwotnego zakażenia Quebec

,

AIDS

,

2000

, vol.

14

(str.

17

23

)

10

mała
SJ

,

Holte
S

,

Routy
JP

oporność na leki przeciwretrowirusowe u pacjentów niedawno zakażonych wirusem HIV

,

N Engl J Med

,

2002

, vol.

347

(str.

385

94

)

11

Richman
DD

,

Havlier
D

,

Corbeil
J

i in.

mutacje oporności na Newirapinę ludzkiego wirusa niedoboru odporności typu 1 wybrane podczas leczenia

,

J Virol

,

1994

, vol.

68

(str.

1660

6

)

12

Gonzales
MJ

,

Machekano
R

,

Shafer
RW

.

podtypy odwrotnej transkryptazy i proteazy ludzkiego wirusa niedoboru odporności typu 1: Klasyfikacja, wzorce mutacji aminokwasów i częstość występowania w populacji klinicznej w północnej Kalifornii

,

J Infect Dis

,

2001

, vol.

184

(str.

998

100

)

13

Adjee
C

,

Cheingsong
R

,

Roels
TH

i in.

wysoka częstość występowania genotypowych i fenotypowych szczepów lekoopornych HIV-1 wśród pacjentów otrzymujących leczenie przeciwretrowirusowe w Abidżanie, Wybrzeże Kości Słoniowej. UNAIDS HIV Drug Access Initiative, Abidżan, Wybrzeże Kości Słoniowej

,

,

2001

, vol.

26

(str.

501

6

)

14

Bollyky
PL

,

Wester
W

,

Piotr
T

i in.

genotypowa zmienność odwrotnej transkryptazy i proteazy HIV-1 w próbkach podtypu C z Botswany u leczonych i nieleczonych pacjentów

,

Program i abstrakty XIV Międzynarodowej Konferencji AIDS (Barcelona). Vol 1

,

2002
Barcelona
Fundacio Barelona SIDA 2002

pg.

475

15

Wu
TD

,

Schiffer
CA

,

Gonzales
MJ

wzorce mutacji i korelaty strukturalne w proteazie ludzkiego wirusa niedoboru odporności typu 1 po różnych metodach leczenia inhibitorami proteazy

,

J Virol

,

2003

, vol.

77

(str.

4836

47

)

16

Gonzales
MJ

,

Wu
TD

,

Taylor
J

i in.

rozszerzone spektrum mutacji odwrotnej transkryptazy HIV-1 u pacjentów otrzymujących wielokrotne inhibitory analogów nukleozydów

,

AIDS

,

2003

, vol.

17

(str.

791

9

)

Dodaj komentarz

Twój adres e-mail nie zostanie opublikowany.