Vedvarende Blodbaneinfeksjon Med kocuria rhizophila Relatert til Et Skadet Sentralt Kateter | Jumbuck

SAKSRAPPORT

pasienten var en 3 år gammel jente med total kolonform Av Hirschsprungs sykdom. På dag 2 av livet (27. April 2006) ble det utført en nødoperasjon for tynntarm okklusjon på grunn av atresi, med fjerning av 31 cm tynntarm, etterfulgt av terminal ileostomi og kolostomi. En total parenteral ernæring var da nødvendig. Den 25. August 2006, en subkutan implanterbar vaskulær tilgangsport (Cook Spectrum Central Venous Kateter, Cook Ireland Ltd.) ble plassert for hjem parenteral ernæring etter en utilsiktet fjerning Av Nutricath (Vygon, Frankrike) kateter.

Fire måneder Senere (desember 2006) ble den første septiske episoden observert, med syv positive blodprøver trukket gjennom kateteret og fra en perifer vene. Feberen forsvant raskt etter oppstart av antimikrobiell behandling som kombinerte vankomycin (40 mg / kg kroppsvekt/ dag, 10 dager) og gentamicin (3 mg/kg/dag, 2 dager). Blodisolater ble først identifisert Som Micrococcus spp. ved å bruke rutinemessige biokjemiske gallerier og deretter som kocuria rhizophila ved å bruke molekylære verktøy. Etterpå ble syv andre septiske episoder med k. rhizophila (to i 2007, fire i 2008 og en i 2009) observert og løst med samme antimikrobielle terapi. Siden det ble antatt at kolonisering av kateteret var årsaken til sepsis, etanol låser (70% etanol ble innpodet i kateteret lumen for 12 h og ble deretter trukket tilbake fra kateteret lumen; deretter ble det utført en isotonisk natriumkloridspyling) i kateteret i løpet av de siste fire episodene forbundet med systemiske antibiotika (17). På tidspunktet for den siste septiske hendelsen i 2009 ble det oppdaget et hull i kateteret og reparert ved hjelp av et bestemt reparasjonssett. Etter April 2009 ble det ikke observert noen ny septisk episode.

i løpet av 3-årsperioden (2007 til 2009), ved Bruk Av BacT/Alert tredimensjonale (3D)-systemet (biomé, Marcy L ‘ Etoile, Frankrike), ble det oppnådd totalt 22 positive blodkulturer, med 21 prøver trukket fra kateteret og en fra en perifer vene. Alle kulturer ga Gram-positive kokker forekommer i par, tetrads, og klynger som ble foreløpig identifisert Som Micrococcus arter med grunnleggende egenskaper. Koloniene vokste under aerobe forhold og virket glatte og sirkulære med en sitrongul tinge eller kremfarge på blodagar. Isolatene var katalase-positive, oksidase-negative, følsomme for bacitracin og resistente mot furazolidon. BARE noen få positive reaksjoner ble funnet MED ID 32 Staph gallery (biomé), noe Som ga Staphylococcus auricularis med svak sannsynlighet på 57%. I 2006 og 2007 ble den kliniske stammen ansett Som Mikrokokkus uten annen undersøkelse i identifikasjonsprosessen. I 2008 brukte Vi Vitek 2 ID-GPC-kortet (biom@rieux) som ga Kocuria varians en tilsynelatende «utmerket» konfidensscore (98%). Det viste bare en enkelt uoverensstemmende test (urea) siden den virket negativ for denne arten, mens den skulle være positiv i 87% Av K. varians isolater. For å klargjøre denne uharmoniske testen og bekrefte k. varians brukte VI 16s rRNA genanalyse. DNA-ekstraksjon OG 16s rrna gensekvensanalyse ble utført som tidligere beskrevet (16). Prosedyren ble utført på 11 kliniske isolater: fire gjenvunnet i 2006, seks i 2008 og en i 2009. Overraskende viste alle sekvensene som ble oppnådd en fullstendig identitet til De Av k. rhizophila deponert i GenBank nucleotiddatabasen. 16s rrna gensekvensen Av k. rhizophila-isolatet viste en likhet på 98% (457/466)med den av 16S rRNA-genet Av k. rhizophila dc22201-stammen (GenBank tiltredelse nr. NC010617) og viste likhet med sekvensene av 10 Andre k. rhizophila stammer, inkludert kovacs ‘ historiske type stamme K. rhizophila TA68T (GenBank tiltredelse nr. NR_026452; likhet på 99%) Og Micrococcus luteus NCTC 2665 (GenBank tiltredelse nr. NC012803; likhet på 93%). Andre kocuria-arter viste en likhet på 451/462 for kocuria carniphila og 452/467 for kocuria marina. Endelig og nylig har vi brukt matrix-assistert laser desorpsjon ionisering – tid for fly massespektrometri (MALDI-TOF MS) som tidligere beskrevet (6), bekrefter stammen Som K. rhizophila. Spektralprofilene til fire kliniske isolater var identiske med spektralprofilen Til k. rhizophila-typen (Fig. 1) og ganske forskjellig Fra profilene Til Kocuria kristinae, Kocuria palustris, Kocuria rosea og Kocuria varians, alle tilstede I andromas-databasen. With the disk diffusion method, all the isolates were resistant to ciprofloxacin, intermediate to erythromycin, and susceptible to penicillin, gentamicin, amikacin, tobramycin, tetracycline, vancomycin, and teicoplanin, according to EUCAST breakpoints determined for Staphylococcus spp. since there are not breakpoints available for Kocuria spp. With broth microdilution, MICs were 0.03 mg/liter for penicillin, 0.5 mg/liter for gentamicin, 1 mg/liter for amikacin, 2 mg/liter for tobramycin, 8 mg/liter for ciprofloxacin, 4 mg/liter for erythromycin, 0.125 mg/liter for tetracycline, 0.5 mg / liter for vancomycin og 1 mg/liter for teicoplanin.

MALDI-TOF MS spektrale profiler. Topp fire linjer, fire kliniske k. rhizophila isolerer fra vår pasient; siste linje, k. rhizophila type stamme brukt I andromas databasen.

Klinisk isolerer genotyping med vilkårlig primet PCR teknikk som trengs forlenget rampe ganger, som rapportert Av Ellinghaus et al. (8). Det ble utført på 9 representative isolater av de åtte septiske episoder og viste det samme mønster, som representerer en klonal K. rhizophila stamme gjenvunnet i 3 år(Fig. 2).

Vilkårlig primet PCR mønstre Av K. rhizophila stammer. Baner: M, DNA-stige; 1, type stamme DSM 11926; 11, k. rhizophila fra en annen pasient (stammer fra baner 1 og 11 er ikke relatert); 2 og 3, to isolater fra den første septiske episoden; 4, isolere fra den andre episoden; 5, isolere fra den tredje episoden; 6, isolere FRA den fjerde episoden; 7, isolere fra den femte episoden; 8, isolere fra den sjette episoden; 9, isolere fra den syvende episoden; 10, isolere fra den siste septiske episoden; 12, negativ kontroll. Baner 2 til 10 har lignende mønstre, som indikerer samme belastning.

micrococcal arter ble funnet i støv, jord, vann og mat og på hud og slimhinner av mennesker og dyr. Medlemmer av disse artsgruppene har også blitt funnet å forårsake infeksjoner som meningitt, endokarditt og lungebetennelse, spesielt hos immunkompromitterte pasienter, og infeksjoner relatert til implanterte eller innsatte enheter (18, 21, 30). Blant den nylig etablerte slekten Kocuria er dokumenterte humane tilfeller av infeksjoner begrenset. Arten K. rosea har blitt rapportert å forårsake kateterrelatert bakteriemi (2). Et annet medlem Av slekten, K. kristinae, er også rapportert å forårsake kateterrelatert bakteriemi hos pasienter med eggstokkreft (3) eller akutt kolecystitt (14). I 2009 ble To tilfeller av peritonitt forårsaket Av k. marina rapportert Av Lee et al. (12). Mer nylig, i 2010, Lai et al. (11) rapportert kateterrelatert bakteriemi og infeksiv endokarditt forårsaket Av Kocuria sp., Mens Tsai et al. (27) rapporterte En K. varians infeksjon assosiert med hjerneabscess.

Mens K. rhizophila har blitt isolert fra mat som ost (7) og kyllingekjøtt (1), så vidt vi vet, er vårt tilfelle den andre rapporten Fra k. rhizophila human infeksjon etter den første som Er beskrevet Av Becker et al. i 2008 (4). Mens kilden til vår 3-årige vedvarende k. rhizophila-stamme var uklar, er det mulig at det var en del av pasientens hudflora, og koloniserte den intravaskulære enheten ved flere anledninger. Den langsiktige intravaskulære enheten (3 år) ga sannsynligvis en nisje for den vedvarende k. rhizophila-stammen, som gjentas gjennom hullet i enheten. Reparasjon av den skadede enheten syntes å forhindre forekomsten av en ny septisk episode til nå. Hele menighetspersonalet blir nå ofte påminnet om den strenge anvendelsen av aseptisk protokoll om behandling av sentralt venekateter. For tiden er barnet i god helse og har alltid flytende avføring. Parenteral ernæring kan reduseres til 5 dager per uke.

ID 32 Staph gallery tillot ikke en pålitelig identifikasjon Av K. rhizophila siden databasen av denne kommersielt tilgjengelig diagnostisk kit inneholder bare et begrenset antall micrococcal arter, ikke dekker de nylig beskrevne arter og ikke gjenspeiler taksonomi etablert Av Stackebrandt et al. (23). Vitek 2 ID-GP-kortet identifiserte tvetydig flere kocuria-arter (K. varians, K. kristinae og k. rosea), men Ikke K. rhizophila. Videre er feilidentifisering av koagulase-negative stafylokokker som Kocuria ved bruk Av Standard biokjemisk analyse Fra Vitek 2-systemet ikke uvanlig, på grunn av fenotypisk variabilitet (5). I kontrast var bruken AV 16s rRNA genanalyse ELLER MALDI – TOF MS tilstrekkelig for å oppnå en nøyaktig identifikasjon Av k. rhizophila.

Få data er for tiden tilgjengelige om antimikrobiell følsomhet For Kocuria spp. eller andre micrococci og dessuten er det ikke definert noe generelt akseptert terapeutisk regime for alvorlige infeksjoner. I 1995 ble von Eiff et al. (29) bestemte MICs av flere legemidler på 188 mikrokokkale stammer: MIC90s (mg/liter) rifampicin, penicillin, imipenem, ampicillin, clindamycin, cefotaxim, vancomycin/teicoplanin og gentamicin var henholdsvis ≤0,031, 0.125, 0.125, 0.25, 0.25, 1, 1/1, Og 1, Mens MIC90s av amikacin, erytromycin, fosfomycin og fusidinsyre var >2 mg / liter. I vårt tilfelle var stammen utsatt for vancomycin og gentamicin, og kombinasjonen av disse to stoffene tillot alltid sterilisering av blodkulturer.

til slutt, hvis en organisme som ligner micrococci gjentatte ganger isoleres fra blodkulturer, er det viktig å bruke andre midler enn de rutinemessige biokjemiske systemene, for EKSEMPEL 16S rRNA gensekvensering eller MALDI-TOF MS, for å oppnå en nøyaktig artsidentifikasjon. Det anbefales også å verifisere nøye integriteten til langsiktige intravaskulære enheter og reparere skade på berging av sentrale linjer fra å måtte fjernes.

Nukleotidsekvens tiltredelsesnummer.

16s rRNA gensekvensen Av K. rhizophila isolat har blitt sendt Til GenBank under tiltredelsesnummer JQ272742.

Legg igjen en kommentar

Din e-postadresse vil ikke bli publisert.