Clayton tjänade tidigare i LDS-kyrkan som biskop, stavshögråd, rådgivare i ett missionspresidentskap, regional representant och områdesjuttio. Vid tiden för hans samtal som ett område sjuttio, Claytons bodde i Irvine, Kalifornien.
Clayton kallades till generalauktoritet och medlem av de sjuttios första kvorum 2001. Tidigare uppdrag som generalauktoritet har inkluderat att fungera som både rådgivare och som president för kyrkans södra Sydamerika och som biträdande verkställande direktör för familje-och kyrkans Historiaavdelning. När Clayton kallades till presidentskapet för de sjuttio den 5 April 2008 tilldelades han tillsynsansvar för kyrkans områden i Nordamerika väst och Nordamerika nordväst. Från 2012 till 2015 övervakade han kyrkans arbete i de tre geografiska områdena i Utah. I augusti 2015 presiderade Clayton vid banbrytande av kyrkans Cedar City Utah-tempel.
när LDS-kyrkan fick kritik för påstådda sexuella övergrepp mot pojkar i kyrkans scouting-enheter, som går tillbaka årtionden men offentliggjordes av anklagelser 2015, kommenterade Clayton kyrkans pågående ansträngningar för att förhindra barnmisshandel inom sina program.
från oktober 2015 till augusti 2020 var Clayton den ledande eller presiderande medlemmen av de sjuttios presidentskap. Han fyllde den position som tidigare innehades av Ronald A. Rasband, som kallades att tjäna i de tolv apostlarnas kvorum. Han utsågs till en emeritus General authority i oktober 2020.
i April 2016 upprätthölls Claytons bror, Weatherford T. Clayton, som en generalauktoritet.
Clayton har varit talare vid ett antal religiösa evenemang eller forum, ofta talat om religionsfrihet.