Harvard Medical School
Institutt For Biologisk Kjemi og Molekylær Farmakologi (BCMP)
240 Longwood Ave., Bygning C2, Rom 315-325
Boston, MA 02115
de molekylære mekanismene for transkripsjonell regulering er svært bevart blant eukaryoter. Transkripsjonell regulering som respons på miljø-og utviklingsmessige signaler formidles av den kombinatoriske og synergistiske virkningen av spesifikke DNA-bindende aktivatorer og repressorer på komponenter i det generelle transkripsjonsmaskineriet og kromatinmodifiserende aktiviteter.
Mye av arbeidet i dette laboratoriet kombinerer genetiske, molekylære og genomiske tilnærminger tilgjengelig i gjær for å ta opp grunnleggende spørsmål om transkripsjonelle reguleringsmekanismer i levende celler. Nåværende prosjekter inkluderer 1) genetiske eksperimenter for å teste vår tretrinnsmodell for nukleosomposisjonering; 2) en systematisk analyse av generelle transkripsjonsfaktorer involvert i initiering ved bruk av ankeravgangssystemet; 3) en studie av faktorer involvert i forlengelse og nukleosomutarmning ved 3′ ender; 4) ved hjelp av direkte RNA-sekvensering, en genom-bred analyse av mRNA-halveringstid og 3 ‘ – enddannelse, 5) bruk av en funksjonell evolusjonær tilnærming for å forstå rollene til ulike transkripsjoner, samt spesifikke komponenter av transkripsjonelle koaktivator-og co-repressor-komplekser og aktivator-og repressorbindingssteder som formidler miljøresponser.
de transkripsjonelle regulatoriske kretsene involvert i cellulær transformasjon er av fundamental betydning og selvfølgelig direkte relevant for kreft. Vi bruker to isogene modeller (brystceller og fibroblaster) av menneskelig kreft for å belyse de transkripsjonelle regulatoriske kretsene som er involvert i prosessen med cellulær transformasjon. Dette innebærer mekanistiske eksperimenter på inflammatorisk feedback loop og relaterte aspekter av den cellulære transformasjonsprosessen; hele genomprofiler av mrnaer, mikrornaer og transkripsjonsfaktorbindingssteder for å gi et integrert syn på cellulær transformasjon; og identifisere gener, mikrornaer og regulatoriske veier involvert i å generere kreftstamceller og mammosfærer. Prosjekter inkluderer 1) mRNA, miRNA OG linc RNA profilering av sfærer vs kreftceller i forskjellige typer kreftceller; 2) ribosom profilering under cellulær transformasjon; og 3) Storskala ChIP-Seq eksperimenter for å bestemme rollen av transkripsjonsfaktorer i transformasjon. Til slutt, etter å ha oppdaget at diabetesmedisinen metformin selektivt dreper kreftstamceller, undersøker vi mekanismen for metforminvirkning og dens potensial for forebygging og behandling av kreft.
